RXRA
SELEX selection target
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R1,R2,R4
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GAGGTCCAAGTGCCTGGCTTGACCTTTGACCTTTGACCCCGAGGT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:c6e2e7fefac7
|
45 | 17.32 | strong_positive | 0.50 |
|
TTGTGACCTTTGACCCCTGACCCCTGACCTCCACGG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:66210c979e0b
|
36 | 16.99 | strong_positive | 0.50 |
|
CAAGAGGTCCAAGTGCCTGGCTTGACCTTTGACCTTTGACCCCGAGGTT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:7d4c7cb25fb8
|
49 | 16.80 | strong_positive | 0.50 |
|
TGACCTTTGACCTTTGACCCCGAGGTTTTAT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:bb5f614891ae
|
31 | 16.21 | strong_positive | 0.50 |
|
ATGTTCCTGCACCGTGGAGGTCAGGGGTCAGGGGTCAAAGGTCACAA
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:688962690402
|
47 | 15.98 | strong_positive | 0.50 |
|
TGTTCCTGCACCGTGGAGGTCAGGGGTCAGGGGTCAAAGGTCAC
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:d2548d90f419
|
44 | 15.95 | strong_positive | 0.50 |
|
ATGACCTCTGACCCCAATATGACCTTTGACCTCTTCCTCACC
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:097bbbe73793
|
42 | 15.88 | strong_positive | 0.50 |
|
AGGGGTCAGGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:2c355686dae5
|
38 | 15.76 | strong_positive | 0.50 |
|
CTTGACCCTTGACCCTTGACCCTTGACCCTTGACCCCT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:f409d8ee9bac
|
38 | 15.75 | strong_positive | 0.50 |
|
GTCAGGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:f44e6d55e045
|
41 | 15.60 | strong_positive | 0.50 |
|
CTTCACATGGGGTCAAAGGTCAGAGGTCATCACT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:74cc171be10e
|
34 | 15.60 | strong_positive | 0.50 |
|
GGTCAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:4f528d37db40
|
38 | 15.57 | strong_positive | 0.50 |
|
GTCAGGGTCAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:5ebd8f105b6d
|
39 | 15.50 | strong_positive | 0.50 |
|
CTTGACCCTTGACCCTTGACCCCTGACCCCTGACCCCT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:419a1542f6ff
|
38 | 15.45 | strong_positive | 0.50 |
|
CCTCAAGCAGAAGGTGTGAGTGATGACCTCTGACCTTTGACCCCATGTGAA
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:5bc6a85e40fb
|
51 | 15.33 | strong_positive | 0.50 |
|
GACATTTGACCTTTGACATTTGACCTTTGCAGTGTCATGT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:a8f23785ccbf
|
40 | 15.20 | strong_positive | 0.50 |
|
GTCAGGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTTAG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:c1e46344daee
|
47 | 14.84 | strong_positive | 0.50 |
|
AGTGGAGCTGGGGTCAGGGGTCAAGGGTCAGGGGTC
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:17ac39b2ddf1
|
36 | 14.81 | strong_positive | 1.00 |
|
ATGACCTCTGACCCCAATATGACCTTTGACCTCTTCCTCACCAG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:60306fc00ba3
|
44 | 14.75 | strong_positive | 0.50 |
|
ATAAAACCTCGGGGTCAAAGGTCAAAGGTCAAGCCAGGCACTTGG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:60264dc5501b
|
45 | 14.74 | strong_positive | 0.50 |
|
GGTCAGGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTTAG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:961d2caf609a
|
48 | 14.67 | strong_positive | 0.50 |
|
ACATGGGGTCAAAGGTCAGAGGTCATCACTCACACCTTCTGCTTGAG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:9e21e60bb305
|
47 | 14.59 | strong_positive | 1.00 |
|
GGTTTGGCTTCACATGGGGTCAAAGGTCAGAGGTCATCAC
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:431f1912218f
|
40 | 14.55 | strong_positive | 0.50 |
|
CCTAACCCTTGACCCTTGACCCTTGACCCTTGACCCTTGACCCCTGAC
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:51832e97edeb
|
48 | 14.55 | strong_positive | 0.50 |
|
CTCAAGCAGAAGGTGTGAGTGATGACCTCTGACCTTTGACCCCAT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:a9dbc6663260
|
45 | 14.54 | strong_positive | 1.00 |
|
GTCAGGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:b16dd6d656a1
|
48 | 14.54 | strong_positive | 1.00 |
|
GTCCAAGTGCCTGGCTTGACCTTTGACCTTTGACCCCGAGGTTTTAT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:5326a763a507
|
47 | 14.48 | strong_positive | 0.50 |
|
GTCAGGGGTCAGGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:84efdef835bd
|
36 | 14.47 | strong_positive | 0.50 |
|
GTGAGGAAGAGGTCAAAGGTCATATTGGGGTCAGAGGTCATAGGGCTCCAG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:4abc6b00da49
|
51 | 14.40 | strong_positive | 0.50 |
|
GATGACCTCTGACCTTTGACCCCATGTGAAGCCAAAC
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:84da7f50d670
|
37 | 14.39 | strong_positive | 1.00 |
|
CTGAGCAGGAAGAGGAGGAGGGGAGGGGAAAGGTCAGGGGTCAAAGGTC
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:c4c2a6baa7d1
|
49 | 14.31 | strong_positive | 0.50 |
|
ACCCTAACCCTAACCCTTGACCCTTGACCCTTGACCCTTGACCCTTGAC
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:73520a6f8f45
|
49 | 14.28 | strong_positive | 1.00 |
|
GAGGTCAAAGGTCATATTGGGGTCAGAGGTCATAGGGCTCCAGCCAGCTAC
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:e49a7b9b8a6d
|
51 | 14.21 | strong_positive | 0.50 |
|
CATGACACTGCAAAGGTCAAATGTCAAAGGTCAAAT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:d6271cfb77cb
|
36 | 14.21 | strong_positive | 0.50 |
|
GTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTCAAGGGTTAGGGTTAGG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:eb3d8e7bd51d
|
47 | 14.15 | strong_positive | 0.50 |
|
GGTCAGGGGTCAGGGGTCAAAGGTCACAAAC
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:9b8bb502090a
|
31 | 14.13 | strong_positive | 1.00 |
|
GAAAACACAGGTCAAAGGTCAGAGGTCAGTGTCAGGGGTCAGCCAGGGAAGT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:f2b5e0f6f5ef
|
52 | 14.11 | strong_positive | 0.50 |
|
GTGACCTTTGACCCCTGACCTTTCCCCTCCCCTCCTCCTC
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:2366800c1ea5
|
40 | 14.08 | strong_positive | 0.50 |
|
CTTGACCTTTTGACCTTTGACCCCCTGGGAA
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:87bc4bf35729
|
31 | 14.08 | strong_positive | 0.50 |
|
GTCAGGGTCAGAGGTCAAGGGTCACG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:1e62919999cc
|
26 | 14.06 | strong_positive | 1.00 |
|
GACCTTTGACCTTTAACCCACGCGGCCACCC
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:a75692d9379c
|
31 | 14.04 | strong_positive | 0.50 |
|
ATCAGGTTTGGCTTCACATGGGGTCAAAGGTCAGAGGTCATCACT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:2faec1356f9b
|
45 | 13.95 | strong_positive | 0.50 |
|
GGGGTCAAAGGGTCAGGTTGTATGAAAGGTCAAAGGTCACGGGTCCTGTGG
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:60fefc538945
|
51 | 13.86 | strong_positive | 0.50 |
|
ATCAGGTTTGGCTTCACATGGGGTCAAAGGTCAGAGGTCATCACTCA
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:bfed7c448682
|
47 | 13.85 | strong_positive | 0.50 |
|
CAAGAGGTCCAAGTGCCTGGCTTGACCTTTGACCTTTGACCCCGAGGT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:932e04a7341e
|
48 | 13.78 | strong_positive | 0.50 |
|
GAGGTCCAAGTGCCTGGCTTGACCTTTGACCTTTGACCCCGAGGTT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:fe178c012c8e
|
46 | 13.75 | strong_positive | 0.50 |
|
CGTTTGACCTTACAGTGGCATTTGACCTTTGACCTTTCAAT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:949c904a7463
|
41 | 13.75 | strong_positive | 0.50 |
|
CCCTAACCCTTGACCCTTGACCCTTGACCCTTGACCCTGACCCTGAC
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:51d46a0d4616
|
47 | 13.75 | strong_positive | 0.50 |
|
ATAAAACCTCGGGGTCAAAGGTCAAAGGTCAAGCCAGGCACTTGGACCTCTT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:54a01b67367e
|
52 | 13.75 | strong_positive | 0.50 |
|
AAGTGCCTGGCTTGACCTTTGACCTTTGACCCCGAGGTTTTAT
PANAPTA:P19793:RXRA:PRJEB76622:R4:c20fd8360334
|
43 | 13.74 | strong_positive | 0.50 |
SELEX rounds
R1
R2
R4 ·final
Structural & language-model features
JSON ↗Pre-computed feature availability; artefacts are distributed through the canonical data bundle.
Residues
462
FASTA
—
ESM-2 mean
—
ESM-2 per-residue
—