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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502311

DNAFOXR05

Reads
489,480
Distinct strings in file
485,680
File size
5.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502311
Sample:
SAMEA113565953
SHA-256
e91df7302ec5b513a5b7acd56f9ff1bbfa492599ed0ae3264d08d2b01b12cb2f

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACAATGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACAATGTCCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGTCTTGTTTTTTGTTTATTGTTTATATTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACAATGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTAAACGAACAAACAAACCATAAACGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACAATGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCTGTTTTGTTTATTTATTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAACAATGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTGTTTAGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAACAATTAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAAAAAACAATAAACAAAAACACGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACAATTAGCAGATCAGTTCAGCGGGTCGTGTATTTGGAGAATATTTATTTTTATGTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACAATTCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTTTCTGATTGTTTGTTTTTTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACAATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGAGAATGGACTAAAAACCAAAAACGGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACAATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTATTGATTGTTTATGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACAATTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTCTTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACAATTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTGTTTATTTACGTTTTTGTTTATGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACAATTGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTATTGTTTTGTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACAATTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTATTTTGTTTAGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACAATTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTATTTGTTTATTTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACAATTTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTAATTTATGTTTTGTTGTTTATTGTGGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACACAACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTTTTTTTTTTTGTTTATTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACACACTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTGTGTGTTTGTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACACCAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTATTTGTTTGTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACACCACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTTGATTTGTGTTTATTCGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACACCACGCAGATCAGTTCAGGGATCGTGTCTATTTGTTTGTTGTTTTTATGTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAACACCACTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTATTTGTTTGTTTGTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACACCAGGCAGATCAGTACAGGGATCGTGTCTAATTTGTTTGTTTATTTTTGTTTGTTGATGCGGAATTAAGTG12.04298e-06
AAACACCAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTTTGTTTTATTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACACCCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTTAGCTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.