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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502311

DNAFOXR05

Reads
489,480
Distinct strings in file
485,680
File size
5.6 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502311
Sample:
SAMEA113565953
SHA-256
e91df7302ec5b513a5b7acd56f9ff1bbfa492599ed0ae3264d08d2b01b12cb2f

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACGATGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTGTTTGTTTGCTGTGTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGATTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTTGTTTTTGTTTTTATTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGATTAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTGTTTTTTTTTGTGTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAG12.04298e-06
AAACGATTATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTATTTGTTTTTCGTTTTTGTTTATAGATGCGGAATCCAGT12.04298e-06
AAACGATTATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTATTGTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGATTCCCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGTCTTTGTATTTTTTTGTTAGTCAATATTGATGCGGAATTAAGTG12.04298e-06
AAACGATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATGTTTATTTACTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTTATGTTTATTTGTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGATTCGCAGATCAGTTCACGATCGTGTCTCCCACCCACCGGCACCCCACATTGGTGATGCGGAATTCAGTGC12.04298e-06
AAACGATTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTGTTTGTTTGTTTATTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGATTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTATGTTTTTTTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGATTGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTGTTTATTTATTTAATACTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGATTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTGTTTATTTCCTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGATTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTGTTTGTTGTTTATTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGATTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTGTTTGTTTAATTTTTTGTTTAGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGATTTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGAGTCTTTTGTATGTATTTCTATTTTTGTTTTGATGAGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGATTTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTATTTGTTGTTTATTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGATTTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTATTTGTTTGTTTATTTTTTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGCAGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGAGTCTATGTTGTTTGTATTTATATTATTGTTGGTGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGCAGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTAGATGTTTATATTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGCCAAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTTCTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGCCAATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAATAAACAAACAAACACAAAAAAATGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGCCAGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTATGTTTTTATTTATTAGTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGCCATTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTTGTTTTTTTTTATTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAACGCCCCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAAAGTAACATGATTACAAAACAGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.