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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502311

DNAFOXR05

Reads
489,480
Distinct strings in file
485,680
File size
5.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502311
Sample:
SAMEA113565953
SHA-256
e91df7302ec5b513a5b7acd56f9ff1bbfa492599ed0ae3264d08d2b01b12cb2f

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAAAATATCCAGATCAGTTAAGAGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATCGTAATATAAATATTTATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGTTGTTGTTTACATAATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATCAGCAGATCAGTACACCGCAACGAGACAAATTGATTAAATCATTAATAATATGTACAAGCGCAATTCAC12.04298e-06
AAAAAATCGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTTTTCTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTTATTTTTGTTTGGTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTGTTTGTTTATTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATGCACAGATCAGTTCAGCGGTCGTGGGGTTGTTTTTTTTTATTGTTGTTTTGTTTATGCGGAATTAAGTG12.04298e-06
AAAAAATGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTGTTTTTTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAAAATGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTGTCGGTGTATCTAAACGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTATTTGTTTATTTTTTGTTATGCGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTACTCTTTTTTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTACTCTTTTTTTTGTTTGTTTATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATTCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTATAGATGCGGAATTCAGTGCAACTGCTGC12.04298e-06
AAAAAATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTGTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTGTTTATCTATTTTGTTGATGCGGAATTCAGT24.08597e-06
AAAAAATTGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTTGCTCTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATTTACAGATCAGTTAAGAGGATCGTGTCTTGTTAATGTATTTTTGTTTATTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAAATTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTACTTCGGTTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAACACGCCAGATCAGTTCACGACGTGTCTTTTTGATTGTTTATTTATTTTACTTTGATGCGGAATTCAGTGCA12.04298e-06
AAAAACCACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTGTTTTATTTGCTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAACCGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTTTATTTATGTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAACGAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAGTGAATACACAATAAACAAAAACAGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAACGCATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTGTTTACTTTTTTTATTTAGGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.