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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502312

DNAFOXR06

Reads
518,557
Distinct strings in file
514,634
File size
5.8 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502312
Sample:
SAMEA113565954
SHA-256
d01fc6ebfc55dba81f5feab73302a5aee0da227604c7c8d456974398036ef260

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACGGTGGACAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTTGTTTGTTTATTTTATTGGATGCGGAATTCAGTGCAACTGCAG11.92843e-06
AAACGGTGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATAAACAAAAAAAACAAACAAACAAAGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGGTGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTGTTTTTGTTTTTGTTTATTTTATGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGGTGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTTTTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.92843e-06
AAACGGTGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTACACTATTTTGTATAAATATTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGGTGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGATGTTTGTTTATTTACTTCTTATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGGTGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTGTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGGTGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTGTTGTGTTTGATTATGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGGTGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTAGTTTATGATTGAGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGGTTACCAGATCAGTTCGCGGATCGTGTCTATGGGTGGGTGGAGGGGGGGGCGCGGGATGCGGAATTCAGTG11.92843e-06
AAACGGTTCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGATTGTTTGTTTATGATTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGGTTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTGTTTAGGGATATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGGTTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGGTTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTGTTTTTTTTGTTTATTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGGTTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTCGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGGTTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTTGTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTGTTGATGCGGAA11.92843e-06
AAACGGTTTGCAGATCAGTTCAGCGGTGTGTCTAGTATTCCTACTACAATTGTGATCATGATGCGGAATTCAGTGC11.92843e-06
AAACGTAAACATATAATTTCTTCTGATCGAGTCTAATTTATTAAATGTAATAATATTTACTAAAATCGATTTTCCA11.92843e-06
AAACGTAACTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTGTTGTTTATTTGTTTTTTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.92843e-06
AAACGTAAGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTTTTTGTTTATGTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGTACCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTATGTTTTGTTATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGTACCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATGTTTATTTTTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGTAGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGTTTTTTTTATTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAACGTATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTGTTTATTTATTTTTTTGATTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.92843e-06
AAACGTATGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTTTTTTTGTTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.