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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502312

DNAFOXR06

Reads
518,557
Distinct strings in file
514,634
File size
5.8 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502312
Sample:
SAMEA113565954
SHA-256
d01fc6ebfc55dba81f5feab73302a5aee0da227604c7c8d456974398036ef260

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAAGTCTTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTAGTGTTTTTGTTGTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTAGTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTATTATTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGATGCAGATCAGTTAGCGATCGTGTCTAAACAAACAAAACATAAACAAACAAAGATGCGGAATTCAGTGC11.92843e-06
AAAAGTGATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTTTTTTCATTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGATTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTATTGTTTGTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGATTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTTTTTTTGTGTTGATGAGGAATTAAGTGCA11.92843e-06
AAAAGTGCCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTAGTTTGTTTATTTTTGTTAGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGCGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCATGTTTATTTATTTTTGATTGAATGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGCTAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATGTTTTATTTGTTTATTGTCGATGCGGAATTCAGTGC11.92843e-06
AAAAGTGCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGGTAGTTTAATTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTATTTTGATGCGGAATTCAGTG11.92843e-06
AAAAGTGCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTATTGTTTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGGACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTATTTTTTGTTATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGGCCCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGTCTTGTTTGTTTTTTTTCTTTGTTTATATTGATGCGGAATTCAG11.92843e-06
AAAAGTGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTATTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTGCTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTATTGTTTGTTTGATTTGTTTTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGATTGTTTATTTATGTTTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTATATTTTTTTTTTTATTGATCCGGAATTCACA11.92843e-06
AAAAGTGGTCCAGATCAGTTCAGGGATCGTGTCTTTATTTATGTTGTTTGTTGTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.92843e-06
AAAAGTGTCCCAGATCAGTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTGTTATTTGTTTATTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.92843e-06
AAAAGTGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTGTTTATTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTAATATATTTTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAAGTGTCTCAGATCAGTTCAGAGGAACGTGTCTATATGTTTAACTTAATGTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.