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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502317

DNAmutFOXR05

Reads
564,777
Distinct strings in file
560,415
File size
6.4 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502317
Sample:
SAMEA113565959
SHA-256
73a05aed844e329bb29651878cf2b7a9a728ffca08c7cee53931ff7cc9122a56

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACATGCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTGTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGCCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTACAAAGGTAAAATAAACAAACAAACAGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGCGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTCTTGTTTTGTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTACTTTTGTTTTTGTTTATTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTATTATTTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTTTATTATTTGAGTGATGCGGAATTCAGT23.54122e-06
AAACATGCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTGTTTGATTGTTTATTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGGTATTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGGAACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTTGTGATTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGGCACAGATCAGTTAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTATTGCTGGTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.77061e-06
AAACATGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTGTTGTGTATTTATGTTTACGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTATTTATATTTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCATG11.77061e-06
AAACATGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTCTTGTTTATTGTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGGTTGTTTGTTTATTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTATTTGTTTGTTTATGTTTAAGATGCGGAATTCAGTG11.77061e-06
AAACATGGGCCAGATCAGTTCACGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTTTCTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.77061e-06
AAACATGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTTCTTGTTTATGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTATTTTTTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTGC11.77061e-06
AAACATGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTTTTTTTTTCAATATTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTGTTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCTGTTTATTGTTTTTTGTTTATATTAGATGCGGAATTCAG11.77061e-06
AAACATGGTACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTATTTTTTTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTATTGTTTATTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTATTGTTTGTTTATTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACATGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTATTTGTTTATTTGTTTATTTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.