These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.
ERR11502317
DNAmutFOXR05
- Reads
- 564,777
- Distinct strings in file
- 560,415
- File size
- 6.4 MiB
Source attribution · SHA-256
- Source project:
- PRJEB62756
- Archive record:
- ERR11502317
- Sample:
- SAMEA113565959
- SHA-256
- 73a05aed844e329bb29651878cf2b7a9a728ffca08c7cee53931ff7cc9122a56
Exact read query
Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.
| Sequence | Count | Read fraction |
|---|---|---|
| AAACATGCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTGTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGCCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTACAAAGGTAAAATAAACAAACAAACAGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGCGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTCTTGTTTTGTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTACTTTTGTTTTTGTTTATTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTATTATTTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTTTATTATTTGAGTGATGCGGAATTCAGT | 2 | 3.54122e-06 |
| AAACATGCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTGTTTGATTGTTTATTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGGTATTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGAACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTTGTGATTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGCACAGATCAGTTAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTATTGCTGGTTGTTGATGCGGAATTCAGTG | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTGTTGTGTATTTATGTTTACGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTATTTATATTTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCATG | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTCTTGTTTATTGTTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGGTTGTTTGTTTATTTATTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTATTTGTTTGTTTATGTTTAAGATGCGGAATTCAGTG | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGGCCAGATCAGTTCACGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTTTCTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGTG | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTTCTTGTTTATGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTATTTTTTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTGC | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTTTTTTTTTCAATATTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTGTTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCTGTTTATTGTTTTTTGTTTATATTAGATGCGGAATTCAG | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGTACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTATTTTTTTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTATTGTTTATTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTATTGTTTGTTTATTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAACATGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTATTTGTTTATTTGTTTATTTTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
Read fractions use all reads in this source file as the denominator.