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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502317

DNAmutFOXR05

Reads
564,777
Distinct strings in file
560,415
File size
6.4 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502317
Sample:
SAMEA113565959
SHA-256
73a05aed844e329bb29651878cf2b7a9a728ffca08c7cee53931ff7cc9122a56

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAAATGCGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTGTTTATTGTTTAGTTTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATGCTCCAGATCAGTCCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTATTCGATTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATGCTCCAGATCAGTTCAGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTGATTATAATTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTGC11.77061e-06
AAAAATGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTATTTTTTTGCTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAAAAACAAACAAAAAAACAAAACAAGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTACAAATGTAAATAAACAAACACAAAAGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTGTTTGTTATTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATGGGACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTGTTTATTTGTTTATCTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATGGGCCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTATTTATTTGTTTATTGTTTATTATTGATGCGGAATTAAGTG11.77061e-06
AAAAATGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTGTTGATATGTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTGTTTATTTGTTTTTTCTGATGCGGAATGCAGT11.77061e-06
AAAAATGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTACTTAATTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGATTATTTGTTTATTTTTTATTGATGCGGAATTCAGTG11.77061e-06
AAAAATGTCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTACATTTTCTTTCCTAAATATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTAAAGGAAAATAAACAAACAAAACACGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTGTTTATTGTTTTTACTTATAGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTCCTTAATTGTTGATGAGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATGTTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTCACATAATTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATTACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTTATTGTTTATTGTTTTGTTTTGGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATTAGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGTTGTTTTTGTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATTCCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGGGGGGGAGGGGGAGGGATGATGAGTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATTCGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTGTTTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATTCGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTTTTTTGTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAAATTGATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTGCA11.77061e-06
AAAAATTGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCAATTGATTGTATGATTTATTTTTAAAGAACCGCAATTAAGAC11.77061e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.