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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502317

DNAmutFOXR05

Reads
564,777
Distinct strings in file
560,415
File size
6.4 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502317
Sample:
SAMEA113565959
SHA-256
73a05aed844e329bb29651878cf2b7a9a728ffca08c7cee53931ff7cc9122a56

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACGGGTTGCAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTATGTTTATTTTTTTTTAATTAGTTTTGATGCGGAATTAAGTG11.77061e-06
AAACGGTAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATAGTATGTTTATTTGTTTATTTTAGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTAAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTGATTATTTTGTTTCATGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATGTTTCGTTTATTGCTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTTATTTTTGTTTATTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTATAATTCTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTGTTTATGTTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTCACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTATTTGTTTGTTTATTAAATGAGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTTCTTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTGACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTGTTTGTTGTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTGAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTATTTTTGTTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGACTCTTTGTTTTATGTTTGCTTTTATGAGGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTATTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTATTTTGTTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTGTACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGTTACTTTGTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTGTTCTATGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTTAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTTTTTTCTCTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTTCCCAGATCAGTTCACGGATCGTGTCTTGTTTACCTTTTTTTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.77061e-06
AAACGGTTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTATTTGTTGTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTATTGTTTATTCTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTTGTTTATTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTTGTTTTGCTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGGTTTGCAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTTGTTTGTTTGTTTTCCTTTCTTGATGCGGAATTCAGTGCAAC11.77061e-06
AAACGGTTTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAAATAAACAAAAAATATAAACAGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAACGTAAAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTATTGTTTTGTATGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.