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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502317

DNAmutFOXR05

Reads
564,777
Distinct strings in file
560,415
File size
6.4 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502317
Sample:
SAMEA113565959
SHA-256
73a05aed844e329bb29651878cf2b7a9a728ffca08c7cee53931ff7cc9122a56

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAATTCGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGATTATACTGTTTATTGTTCTTGATGCGGAATTCAGTG11.77061e-06
AAAATTCGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTGTTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTCTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAGACCACCCCGGCAACGCCCCCACCCGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTCTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATATGTTTTGTTTTGTTTTGATGAGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTCTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTTGGTTTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTCTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTTTATTGTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTCTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTGTTTATTTTTTTAATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGAGACAGATCAGTTCAGCGGATCGGGTCTTGTGTTTTTTGTATATTGTTTAATTTGAATCCGAATTCACT11.77061e-06
AAAATTGATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTTGTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGCGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAAAAAACAATAAACAAATAACAGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGCTGCAGATCAGTTCACGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTCGTGTTTTTATTTTGATGCGGAATTCAGTG11.77061e-06
AAAATTGCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTTATTTATTGTTTATATTTGATGCGGAATTCAGTG11.77061e-06
AAAATTGCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTATTTGTTTATTTGTTTGTTTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTATTTGTTTATCTTACGTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATATTATCTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATATTTTCTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTTTATTGAATGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTGTTGTTTATGTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTAATTTGTTTTTGTTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGTCACAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTTTGTTTATTTGTTTTTGTTGGTTATTGATGCGGAATTCAGTG23.54122e-06
AAAATTGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCCTTGTTTATTTGTTTTTTTTCTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTGTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTTTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAAAGTAAACAATAATCAACAAACGAGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06
AAAATTGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTTTGTTTATATTTTGATGCGGAATTCAGT11.77061e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.