These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.
ERR11502317
DNAmutFOXR05
- Reads
- 564,777
- Distinct strings in file
- 560,415
- File size
- 6.4 MiB
Source attribution · SHA-256
- Source project:
- PRJEB62756
- Archive record:
- ERR11502317
- Sample:
- SAMEA113565959
- SHA-256
- 73a05aed844e329bb29651878cf2b7a9a728ffca08c7cee53931ff7cc9122a56
Exact read query
Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.
| Sequence | Count | Read fraction |
|---|---|---|
| AAAATTCGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGATTATACTGTTTATTGTTCTTGATGCGGAATTCAGTG | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTCGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTGTTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTCTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAGACCACCCCGGCAACGCCCCCACCCGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTCTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATATGTTTTGTTTTGTTTTGATGAGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTCTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTTGGTTTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTCTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTTTATTGTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTCTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTGTTTATTTTTTTAATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGAGACAGATCAGTTCAGCGGATCGGGTCTTGTGTTTTTTGTATATTGTTTAATTTGAATCCGAATTCACT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTTGTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGCGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAAAAAACAATAAACAAATAACAGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGCTGCAGATCAGTTCACGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTCGTGTTTTTATTTTGATGCGGAATTCAGTG | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTTATTTATTGTTTATATTTGATGCGGAATTCAGTG | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTATTTGTTTATTTGTTTGTTTTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTATTTGTTTATCTTACGTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATATTATCTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATATTTTCTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTTTATTGAATGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTGTTGTTTATGTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTAATTTGTTTTTGTTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGTCACAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTTTGTTTATTTGTTTTTGTTGGTTATTGATGCGGAATTCAGTG | 2 | 3.54122e-06 |
| AAAATTGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCCTTGTTTATTTGTTTTTTTTCTTTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTGTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTTTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAAAGTAAACAATAATCAACAAACGAGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
| AAAATTGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTTTGTTTATATTTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.77061e-06 |
Read fractions use all reads in this source file as the denominator.