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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACAATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGAGTCTTGTCAATTTTTTTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTGCA11.68957e-06
AAACAATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAATAATAAATAAACAAACAAACAAAGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATCAAACAAAAATAAACAAACAAACAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTATTTGTTTATTTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTAATTGTTGATTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGCTGTTTTCTTGTTTGTTTTTTGTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTTATTTTTTTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTGTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTTTATTGTTTATATTATTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGAGAATGTTTATTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTGTTGTTTTTTGTTTGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACAATTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTATTTTTTTAGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATAAACAAAATAGAACAACAAACAAAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTGTTGTTTATTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTATTTGATTATTTCTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTGTCTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGGCAATGGTTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTTTTTATTTATGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTTTTTTTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
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AAACAATTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTGTTTATTTATTTTTTTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTATTGTTTACTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTGTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAATTTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTATGTTTATTTGTTTTTTTTTTGTTGAAGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.