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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACAGCGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAAAATAAATAAATAAACAAAAAACACATGCGGAATTCACT11.68957e-06
AAACAGCGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTATTTTATTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGCGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTTGTTTTCTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGCTATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTCACTTGTTAGTTTATTTAATTTTTTGTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGCTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGGGGAATTAAGTG11.68957e-06
AAACAGCTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTTATTTATTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGCTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTACCGATTTGTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGCTGGCAGATCAGTTCAGCGGACGTGTCTGTTGTTTATGTTTATTGTTTATTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACAGCTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTGTTTGTTTGTTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGAACCAGATCAGTTCAGCGGATCCAGTCAATGTAATAAATGTGTCAATAAGATTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTACTAATTGTTTATTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTTTGTTTATAAATAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTGTTTATTTGTTTACTGTTTATAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTTTGTTTTTGTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGACTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAATTTGTTTATTTGTTATTTTTTAATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGACTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTTGTTTTTTCTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGAGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATGTTTGTTGTTTACTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGATGCAGACAGTTCGCGGATCGTGTCTGATTATTTTTTAGTTTAATGTTTATTGATGCGGAATTCAGTGC11.68957e-06
AAACAGGATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTGTTTGTTTATTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTGTTTATACTTTTCTTAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGCAACAGATCAGTTCAGAGCATCGAGTATTGATTTTTTTTTATTGTTAATTTATTTTTGCGCAATTCAGA11.68957e-06
AAACAGGCACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTGTCTTTTTATTTGTTGATGCGGAATCAGCA11.68957e-06
AAACAGGCACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTTATGTTTTTTTATCGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGCAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTGTTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTTTGTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.