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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACATGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTATTTGTTTTTTTTTTATTGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACATGGGGCAAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTTTTGTTTATTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACATGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATCTAAAAATAAACAAACAAACAAACGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCGTTTGTTTATTTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACATGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTACGATTTGGTTGTGTAAATATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTTTCTTTTTGTTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCCGGTTTTTGTTTGTTTATTTTTTCATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTGTTTGTTTGTTTATTTTTGTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTTTGTTGTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACATGGTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAAAAAAAAACAAACAAACAGAACAGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGGTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTATTTGTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTGTATTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACATGTCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGACTTTGTTTATGTTTTATTGTTTGTTTATCGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACATGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTATTTGTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGTCGCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTATTGTTTATTTTTTGGGATGAGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTAGTTGTTTGTTTATTTTTTTTATGATGGGGATTTCAGTGC11.68957e-06
AAACATGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTATATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTTTGTTTGTTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGTGCA11.68957e-06
AAACATGTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTATTTATTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGTGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTTTGTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATGTTCCAGATCAGTCAGCGGATCGTGTCTTTCTTTTTGTTTATTGTTTATATTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.