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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAAATGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTTTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAAAATGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTTTATTTGTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTGTTTTTGTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTATTGTTTGTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATGTCACAGATCAGTTAAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTTTATTCTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTCTTGTGTAAATATTGGTGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTCTGTTTGTTTATTTTTTAAGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGTTTTTGTTTGTTTATTTGATGGGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTCTTTTGTTTATTTATAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTCTTTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTATTTATTTTTTTATGTTGATGCGGAATTCATG11.68957e-06
AAAAATGTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTATTGTTTATTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATGTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTATATTTGTTTTTTCCACTTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATGTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTATTGTTTATATTTTTTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATGTTGCAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTTTGTTTATTTATTTTTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGATGCG11.68957e-06
AAAAATTAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTCTTATTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATTACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTCTGTTTATTTTTAATTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAAATTACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTGTTTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATTCACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTATTATTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATTCCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATGTTTATTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATTCCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTGTTTTTGTTATATATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATTCGGCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTTTTATTTGTTTATTTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAAATTCTCCAGATCAGTTCACGGATCGTGTCTCAAAGTTTGTTTGTTTATTTACTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAAATTCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTGTTATTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAATTCTTCAGATCAGTTCACGACGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTTGTTATTGTTGATGCGGAATTCAGTGCA11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.