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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACCGTTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTGTTTATTCTTTATGTATTATTGATGCGGAATTCAGTT11.68957e-06
AAACCGTTGCCAGAAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTATTTTTTTGTTATTGATGCGGAATTCAGTGC11.68957e-06
AAACCGTTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTCTAGTGTCAATATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCGTTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTGATTTTTGTGTTTGTTTGTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCGTTGGCAGATCTGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTATTTTTGTTTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCGTTGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTTTGTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTAAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTTTGTTTTTGTTTTGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTAACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGGTTTTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTAATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTATCTATTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTACCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTATTTGTTTGTTTATTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTACGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTATTTGTTTGTTTGTTTATTATTCGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTATTACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTATTTGTTTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTATTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTTGTTTATTTAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTATTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTATTTTTATTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTATTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTGTTTTTGTTTATAGTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTATTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTGTTTGTTTATTTTGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTCAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTTGGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACCTCACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGAGTCTTATTATTAGAATATTTTGGTTATATTGATGCGGAATTCAGA11.68957e-06
AAACCTCACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTGTATATGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTCACGCAGATCAGTACAGCGGATCGTGTCTTTGTATTTGATTTTTTATTTTGTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTCACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTTATGTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTCAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTGTTTATTTATTTTTTCGTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTCATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTGTTTTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTCATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTGTTTATCTTTAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACCTCCACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTATTTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.