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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACGATGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTAGTTTATTATTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTGTGTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTGTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATGTACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTATTGTTTTATTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATGTACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTATTTGTGTATTTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTATTTATTAGTTTGATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAAAAAAAAAATAAAACAAACAAATATGATGCGGAATTCAA11.68957e-06
AAACGATGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGATTGTTTTTGTTTTTTTGTTTATAGATGCGGAATTTAGT11.68957e-06
AAACGATGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTATTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATGTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTCTGTTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTTGTTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTTGTTATTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATTACCAGATCAGTTCAGGGATCGTGTCCTTTTGTTTGTTTATTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTGC11.68957e-06
AAACGATTCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTTTTGTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGATTCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATATTTTTTTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATTCCCAGATCAGCTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGATAACAAAAAAATAAACAAACAAACGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTTATTATTGTTATTCTTTACGGTGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTACTTTTTGTTGTTTGTTTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATTCGCAGATCAGTTCAGCGGACGTGTCTTGTTTTGTTTTTGTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGATTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAATAACAAACATAAACAACACCAAAAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTATTCAATTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTTTTTTTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTTATAATTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.