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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACGTGTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTATTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTGTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTTTTTGTTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTGTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATGGTTTGTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTGTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTATGATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTGTTGCAGATCAGTTTAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTATTGTTTATGTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTGTTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGGTTTGTTTGTATTTTGTTTATAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTATCTATTTATATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTGTTTTTGTTATTGTTTATCTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTGGATTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTACGCAGATCAGTTCAGAGGATTGTGTCTAAAAAATAAACAAACAAACAACACACGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTAGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTATTTATGTTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTAGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTATTTTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTCACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTATTTTTTTTATTTAATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTACAAAATCATTATGTAAACAAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTTTTTGTTTGTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTATTTGTTTATTGTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTATTTGTTTTTTTTTTTCGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTCCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTATTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTCGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTGTTTGTTTATGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTCGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTTTGTTTATTTTATTTTGGTTATGATGTGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAAAAATAAACCAAAAACAAAGACACGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTTTTTTTATTTATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGTTCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAATAAACAATAAACAATAAACAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCTGTTTTGTTTATTTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTTGCCCAGATCAGTTCAGCGGACGTGTCTTTGTTTATATTTTTGTTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.