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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACTATCCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTTGATTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATCCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTATGATATATTTGTTGTTGATGCGGAAAGTGCA11.68957e-06
AAACTATCGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTTTTTTGTTTGTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATCGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTATTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATCGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTGTTTATCTTCTATGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATCGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTATTTACTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGCTTATATTTTGTGTTATTGTTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTTTATTTTTATTTTTGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACTATGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTGTTTGTTTATGTAAATATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATGTTTATTTTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTATTTTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTGTTTATTGTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACTATGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTGTTTGTTTACTTTTGATTGTTTACATAACGATGCGG11.68957e-06
AAACTATGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTTGTATTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGACTTGTTTATATGTTTTGTTTACATTTGATGCGGAATTCAGTGC11.68957e-06
AAACTATGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTCATATTTTTTTGCTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTGTTTATTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTGC11.68957e-06
AAACTATGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATATTTATTTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTTATTTGTTGTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACTATGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTTGGTATTTGTTTTGTTTGATGCGGAATT11.68957e-06
AAACTATGTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATGTTGTTGTTCATTGTTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTGTTTCTTTTATTTAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACTATTCCCAGATCAGTTCACGGATCGTGTCTTGTTTATGTTTATTTTTATTTGTTATGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACTATTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTATTGTTAGTCTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.