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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAACCGGGGCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGTCTTTGTTTATTTGTTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTGCA11.68957e-06
AAAACCGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTCGGTTGTTTATTGTTTATTTTTTGTGATACGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACCGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTGTTTTCTATTGTTATGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACCGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCTTGTTTATTTGTTTTGTTTTCATATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACCTAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTGTTTATTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACCTCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGCTTTTGTTTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACCTGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATCACTCTGCCCGCCCAGCCCCCCGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACCTGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTATTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACCTGTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTTTGTTCGTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACCTTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTTGTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACGATCGCAGATCAGTTCAGCGGAGTGTCTAAACAAACAAACAAAAACAACCAATGGATGCGGAATTCAGTGC11.68957e-06
AAAACGCAACCAGATCATTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTATTGTTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAACGCAAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTTTTGTTTTGTTTATGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACGCCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTTTTTTGTTTGGTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAACGCGAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTGTTTTTGTTTACCTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACGCGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTGTTTATGTTTATTTTTGGTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACGCGTCCAGATCAGTTAAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACGCGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTATTTTGTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACGCTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCCTTTGTTTATATTTAATTTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACGGCACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTTTTGTTTACAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACGGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTATTGTTTATCGCTTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACGGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTATTTTGATTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACGGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTATATTGTTTATGTTTACTAGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACGGGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTATATTATTTAAGTTTACGTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAACGGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTTGTTTATTTGTTTTCTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.