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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAGCTGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAGCAAACAAACAAACATAACAAAATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGGAGGGGGGGAGCAAGGGGATGGGGAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTTTTTTGTTTGTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCACAAAATAAACAAACAAACAAAACTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTATGTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTATTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTCTTTTTTTTTGTTTATTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTTTTTTTACTTGTTGATGCGGAATTAAGTG11.68957e-06
AAAGCTGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTTTGTTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAGCTGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTTTGTTTTTATTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGATTATTTTTTTTGTTATTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAGCTGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAATAAATAAACAAAAAAATCAACAATGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAAGCTGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTGTTTATGTTTAATTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTATTTTCTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTATTGTTTATTGTTTTTGTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTTGTTTGTTTGTTTATTTGGTTGGATGCGG11.68957e-06
AAAGCTGTCGCAGATCAGTTCAGCAGATCGTGTCTTGTTTATTTATTTTGTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTATATTTTTTGTCCTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTTTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATGTTTATTGTTTATGTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAGCTGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTAATTTGTTTATAAATATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGTGCCAGACAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTGTTTTTATTTATTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAGCTGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATGTTTTTGTTTGTTTATTTAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAGCTGTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGATTATCTGTTGTTTATAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.