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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAAGGTGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTTATTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGGTGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTGTTTTTAGTTTGATTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGGTGTTCAGATCAGTTCAGGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTGTTTTTTATTTTTGGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAAGGTTGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGGGTTTTGATTATGTTGCTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGGTTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAAAAAAAAAAAAAAACAAACAAAACACCATGGGGAATTCA11.68957e-06
AAAAGTAGTCCAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTTGTTTGTTTATTTTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAAGTCAACCAGATCAGTTCAGCGGATGACTCTTTGTTTATCTATAGTTTGTTTATTATTGATGAGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTTTGTTTATTTGTTTACTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTTTTTTTTATATTTTTAATGCGCAATACAGT11.68957e-06
AAAAGTCACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCAGCCCAACCCACGCACCCCACCCTAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCAGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTGTTTATGTTTATTTTTCTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCAGCCAGATCTGTTCAGCGGATGTGTCTTGTTTATTTATTTTTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAAGTCATTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTATCTTTGCTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCCACCAGATCAGTTAAGAGGAACGTGTCTTTTGTTGTTAAATTTTGTTATTTATTCATTCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCCCTCAGATCAGTTCAGAGGATCCTGTAATGATTAATTATTTAATGCTTTATATAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCCCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTAATTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCCGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTTTCGTTGTTTATTGATGCGGAATACAGT11.68957e-06
AAAAGTCCGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTGTTTCTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCCGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTGGGTTGTTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCCGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCCGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGAGTCATATTTATTGAATATTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTGAGTAAATGTAAACAAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTATTTTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCGAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTGTTTTGTATTTAATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTCGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAACAATAATAAACAAACAAAAAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.