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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAAGTGCGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTGTTTATTTGTTTGTTTATTATTGATGCGGAATTCATG11.68957e-06
AAAAGTGCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTTAATTGTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGGACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTTTGTTTAAATATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGGCGCAGATCAGTTCACGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGTGC11.68957e-06
AAAAGTGGCGCAGATCAGTTCAGCGGACGTGTCTGTTTGTTTGTTTATTTCTTTGTTTTGGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAAGTGGCGCAGATCAGTTCAGCGGACGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTTGTAAATAAGGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAAGTGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATGTTATTTGTTTATTTTTCATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTACTTTTTGATTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTTTATTTTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGACATTAAAAAGAGAGATAAACAATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTGTTTTTTGTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGGCTCAGATCAGTTCGCGGATCGTGTCTATGTTTGTTTATTTACATGGAATATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAAGTGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAATATAAACATAAATAATAAACAAAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTAATGTTTTTTTTTTATGTTATGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAAAGTGGGGCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGTCTGTTTATTCTTTGTTTATATAAATAAGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTGTTTGTTTGTTTTTCATGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATATTTTTTTTTTGATGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTATTTATATTCCTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTATTCTTCTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGTATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTGTTTATTTTTTGTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTGTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTGTTTGCTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTTGTTGACGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAAGTGTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTTGATGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAGTGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTATTTATTGTTTATGTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.