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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAAAAGTATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTGTATTTTTTTATTGTAAATATTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAAGTCCCAGATCAGTTCAGCGGAACGTGTCTTTCCTTATTTTTGTGAGCTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAAGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGCGTCTTTGTTATTGTTTTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAAGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTTTTAGTTTTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAAGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTTGTTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAAGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTATTTTGTTTTTATGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAAGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTGTTTTGTTTATTTAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAAGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTCTATTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAAGTTCCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTATTTACATTTTGTTTTGTTTATTGTTTATTGTTGATGCGGA11.68957e-06
AAAAAAGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTTGTTTATTGTTTGTTTTAGTTGTTTTGATGCGGAATTCGTGC11.68957e-06
AAAAAAGTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTGTTTATTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAAGTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTTTTTTGTTTATTTTTGATGAGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAATACGCAGATCGGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTTTTTTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAATACTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAAAATCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATCTATGTAGAGTAAATATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAATCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATGTTTATTTATTTGTTATGATGCGGAATTCAGG11.68957e-06
AAAAAATCGCCAGATCAGTTCACGGATCGTGTCTTATTGATTATTTGTTTAATGTATGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAAAATCTACAGACAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTTTTGTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAAAATGCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTATTATTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAATGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGATAGTATGTCTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAATGGACAGATCAGTTCAGCGGACGTGTCTGGTTTAGTTTGTTTGTTTTTATTTTAGATGCGGAATTAAGTG11.68957e-06
AAAAAATGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTTGTTTTTTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAATGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTGTTTATTTGTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAATGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTTTTTGTTTGTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAAAATGTTCAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTTTGTTTATGTATTTATTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGTGC11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.