Data & API

Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

← Back to source counts

ERR11502323

RNAFOXR05

Reads
493,314
Distinct strings in file
456,534
File size
7.2 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502323
Sample:
SAMEA113565965
SHA-256
93cc84603e2c7e251e2a6c87c398de68e9e451ff704cf21c755664b9a58270d6

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCAGCCTCAACACATACTCTCTCACATAGGTAGAG12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCAGCCTCAACACATACTCTCTCACATCGCTTCTG12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCAGCCTCAACACATACTCTCTCACATCGCTTGTG12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCAGCCTCAACACATACTCTCTCACATCGGTTCAG12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCAGCCTCAACACATACTCTCTCACATCGGTTCTG12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCAGCCTCAACACATACTCTCTCACATCGGTTGAG12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCAGCCTCAACAGATACTCTCCCAGATCGGAAGAG12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCAGCCTCAACGCATACTCTCTCAGATCGGTAGAG12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCAGCCTCAACGGATACTCTCCCACATCGGAAGAG12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCAGCCTCTACACATACTCTCCCACATCGGTTGAG12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCAGCCTCTACTCATTATCTCTCACATACCTTGTG12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCTACCTCTATTCATACTCTTCCTGATTCGAAGAA12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCTACCTTTATCGATTTTTTTCCTTATTCGATATA12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTGAATGCTGTCAACCTCTACACATACTCTCTCACATCGCTTCTG12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTGAATGCTGTCAGCCTCTACACATACTCTCTCACATCGCTTCAA12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTCCGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGGATTAAATGCTGTCAGCCTCAACACATACTCTCTCACATCGGAAGAG12.02711e-06
AAACCTTCCTCCTTTGTCCTTCCATCCACCCTGTTGTGAATTAAATGCTGTCAGCCTCAACACATACTCTCTCACATCGCATGAG12.02711e-06
AAACCTTCTCCCTTACCCTAGAGTAAATCAGCCTCAACGGATACTCTCCCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCTAGTCACG12.02711e-06
AAACCTTCTCCCTTACCCTAGAGTAAATCAGCCTCAACGGATACTCTCCCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTGTAGTCACG12.02711e-06
AAACCTTCTTACTTTCTAATTCACCACATACCCATTGCCCAACCCAACCTCAGTCTCAACAGATACTCTCCCACATCGCTACAGT12.02711e-06
AAACCTTCTTAGCGCCTCTAACTCAGCGTCTCATATAGTAGGGTCGTCGCTCAGCCTCAACACATACTCTCCCACATCAGTTCAG12.02711e-06
AAACCTTGGTAAAGTTAATAAACAACCCGATACCCGTGCCCAGTATCCAGTCTATCTCTACTCATACTCTCTCACATCGCTTCTT12.02711e-06
AAACCTTTATACCCTACTCCCTGGCCCGCGGTATCCTCATCTATACTTTTCACTTTCATCATTTACTCTCCTACATCACTTCAGT12.02711e-06
AAACCTTTCCTCTTCGGGACCATACTAAAGCGGGATCCCTCCCACCCGGTCAGTCTCAACAGATACTCTCCCAGATCACAACAGT12.02711e-06
AAACCTTTCTCTTGAACCCTAATTGCCCAACGCGACAGCCCTACCCGGTATCAGCCTCTACACATACTCTCTCACATCGCATCAA12.02711e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.