Data & API

Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

← Back to source counts

ERR11502323

RNAFOXR05

Reads
493,314
Distinct strings in file
456,534
File size
7.2 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502323
Sample:
SAMEA113565965
SHA-256
93cc84603e2c7e251e2a6c87c398de68e9e451ff704cf21c755664b9a58270d6

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAATCTCTACTCATACTCTTTCACATCTGTTCAA12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAATCTCTATTCATACTCTCTCACATACCTTCTA12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAATTTCTACTCATACTCTCTCACATCGCTTCTA12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACACATACTCTCCCACATCGGAAGAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACACATACTCTCCCACATCGGATGAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACACATACTCTCCCAGATCGGATGAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACACATACTCTCTCACATAGCATGAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACACATACTCTCTCACATCAGAAGAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACACATACTCTCTCACATCGGATCAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACACATACTCTCTCACATCGGATGTG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACACATACTCTCTCACATCGGTTGAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACACATACTTTCCCAGATCGGAAGAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACAGATACTCTCCCACATCGCTTCAA12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACAGATACTCTCCCAGATCGGAAGAG36.08132e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACAGATACTCTCTCACATCGATGAGC12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACGCATACTCTCCCAGATCGGATGAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACGGATACTCTCCCAAATCGGAAGAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACGGATACTCTCCCACATCGGAAGAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCAACGGATACTCTCCCAGATCGGAAGAG36.08132e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCTACACATACTCTCCCAGATCGGATGAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCTACACATACTCTCTCACATCGCTTCAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCTACAGATACTCTCTCACATCGGATGAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCAGCCTCTACAGATACTCTCTCAGATCGGAAGAG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCTACCTCTACACATACTCTCTCACATCGGTTGTG12.02711e-06
AAAGAGACTTGGATTGTATCCCCCTTATGTACCCGTTTTTAGATCCCACCTCTATCTCTACTCATACTCTTTCACATTTCTTCTA12.02711e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.