These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.
ERR8016766
NACC1_CC40NTGAGTAYWCA3
- Reads
- 447,391
- Distinct strings in file
- 438,015
- File size
- 5.3 MiB
Source attribution · SHA-256
- Source project:
- PRJEB49150
- Archive record:
- ERR8016766
- Sample:
- SAMEA12312951
- SHA-256
- 4d4e59719af036199a7d44bece9d5c89229d3ab700e97dd0c37b5e2ac221912d
Exact read query
Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.
| Sequence | Count | Read fraction |
|---|---|---|
| AACATGCTAACACATTAGTAATGTTTATCGGTGTAAGCTG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAACTCTATGTCGAGCGTATCAGGCTGGGTGAC | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAAGAGGTTAGCTGTGTGCGTCGTGCTTGGTAG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAAGGACACATCCCTAGGAATGTAGATCGACGT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAAGGCAGAGGTCTGAAATTGTATGGGGTAGTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAAGGGACGCATGGTTCGTGTGGTAGCAGAGCA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAAGGGTCAGAACCTCGTCACGTGTTAGGTTAT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAAGGGTCGTTCTCAGCACTGATATGTTTAATG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAAGGTCGGGGTACAAGTACAGTCGAAAAATGG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAAGGTGTCATGTGTGTGTTAGGACTGGTACTG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAAGTAGGGTCGGTGCATACGAGTCGTAGCGGT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAAGTATCATATTGGTATGAGCAGTCTATGGTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAAGTCGACAGACCGCTTATAACGTGGTCCTGG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAAGTCGGTGTCTTCGTAATCTCGGACTACATG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAATACATACTTAGAACGGTGCGCACTCATGCG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAATATCGGTAGCCTTGTGGCCTGCACATAGCA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAATCATGTGTTTACTAGTGATGAAACAGTGTC | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTAATGCACGCTGCCACTAGATGGTGTCTATGTC | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTACACACCTGACATTTTACAGCGGTGAGGGTGG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTACACGCATGTATTGTCAGTAAGACAACGCCCT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTACAGTGGTTAACAGGCATGTGTCGGTGAACTG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTACATGCATGGTTCAGTTGAACTTGCAATATGG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTACATGCGTCTGTTAGTGGATACGCGGTTATCT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTACATGCTCCATGCTTGGATACGGCGTGTAAGG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGCTACCAGTCGTGCTTGCCACACATGTGGAGGGTA | 1 | 2.23518e-06 |
Read fractions use all reads in this source file as the denominator.