These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.
ERR8016766
NACC1_CC40NTGAGTAYWCA3
- Reads
- 447,391
- Distinct strings in file
- 438,015
- File size
- 5.3 MiB
Source attribution · SHA-256
- Source project:
- PRJEB49150
- Archive record:
- ERR8016766
- Sample:
- SAMEA12312951
- SHA-256
- 4d4e59719af036199a7d44bece9d5c89229d3ab700e97dd0c37b5e2ac221912d
Exact read query
Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.
| Sequence | Count | Read fraction |
|---|---|---|
| AACATGTATGACGTATTTAGGTCGTGGTCAACGGTCGTCT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGACGTTAATGGTTTATATGTTCTCGTCTTGC | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGACTAGAATTGCAGCACGTGGCTGCCATGAT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGACTCAGGTAAACGGCATGGTAATATCGATG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGACTTCCTGACAACGCTATCAAGTTGGCGCA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGACTTGACACGGAACCGGCACCATGACTTGA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGAGCCACACTCGTACTGTCGTGAAGTCATGG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGAGCGCATTGTGTCATCGTCCAGCTGGTGTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGAGCGCCACATGCGTCGATGGATGTTACCAC | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGAGCTTGCGAGGTCATGTGGGTTGTGTGAGT | 2 | 4.47036e-06 |
| AACATGTATGAGTACCACGTGTATTGGGGCACATGCGGTG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGATCCATGCTTGTTGTGATATGTTCCCGTTC | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGATCTGCCATGATTGAGAACGCATGTCGTGG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGATGCACGTGGTCAACTCGGTGGACCTCGGC | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGATGCATGTCATCTGCTTGCGTGGTCCTCTT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGATGCCTTTCCTGTACGGGGTAACACGATCT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGATGCGTCGTAGGACTCGTATGCGAATTGCA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGATGTTCAGGCAGGGTTTAGGGGAGGGTCCT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGATGTTGCACTGGTTATGCTAACAACCTGGT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGATTGAGATCACGTGTGCTAAGGGCGCAGGC | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGCAGAAAATGTGCATGATGGATACTGATAGA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGCAGGCAACATGCATCGGAAGAATGTGGCCC | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGCAGTGCCGCGTAACTGTGACTTGACCTCTG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGCCAAACACACAGGCAGTTAGGGTAAACGTC | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGTATGCCGCCTACGGTGCATGGTGCGGTTAACATG | 1 | 2.23518e-06 |
Read fractions use all reads in this source file as the denominator.