ATF7_GNTR
CAP-SELEX sample gntR_ATF7 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GACCATCTTGTTACCATATGTTTCAAGGACGTTGGTGAAT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:cfffe2652883
|
40 | — | — | — |
|
GAGTGTTACGTAACTGTTGCAGTTACACGTAACGTGGATA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:dfce5e010442
|
40 | — | — | — |
|
CCTGCGATGAAACGGTGTAACATGCTGTAACGTTACGTAA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:2af995abbcd6
|
40 | — | — | — |
|
CTGTTAGAGTACTCATAATTCCCATATTGTTTCCATATGG
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:96d544ed9dca
|
40 | — | — | — |
|
TTGCTAGAGCCACTCAAACTCAAAACATATGGTTTCAAGT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:abf38683e9e7
|
40 | — | — | — |
|
TGTTACAAACGTGACGTAACGTAAGTTATAACCGTCCCTA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:3dbafdf10e84
|
40 | — | — | — |
|
AAGCTATATCCATTTGGCTTGGTGCCATATGTACACCATA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:a76776a4da36
|
40 | — | — | — |
|
TTGTCGCCATATGGTCTCAAGTAAGACTAAAAAAGTAGAA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:31bd10671fe7
|
40 | — | — | — |
|
TTACGCAATAATGAAATGTTACGGATGTTACCGTAACGGT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:6a21aeca608a
|
40 | — | — | — |
|
CTTGTTACCGTAACAACTGTAACATTGCATACGCGTCATG
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:036a7d8a8d5a
|
40 | — | — | — |
|
TGTTACACCATACGTTTACGCCATGTTACTGGATTCATGA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:b8bc6b448fb2
|
40 | — | — | — |
|
TACCATATGGAAACAGCCTTATGCTTAACATCACCCCTCA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:352b8e14664f
|
40 | — | — | — |
|
GCCAATTTAACAGTGACGTAACATGATACTGGAACATAAG
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:0632ea60871e
|
40 | — | — | — |
|
GTATTAAAAAGGTGTTATATCGACCATATGGACACCATAC
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:f9a81c97fcbb
|
40 | — | — | — |
|
GTCGGTAAACATCTGACATATGGTCGCTGTATGTTTAGTT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:3baad504a2b5
|
40 | — | — | — |
|
TCCCCGTTCCCGAAGCCAACCCCCAGCCACCCCACCCAGA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:1faf280a9b13
|
40 | — | — | — |
|
AAAGTATAATAACGTTACGACTAAATGTAACATTACCACT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:f49604f7710a
|
40 | — | — | — |
|
CATCCGTTAAGCCCTTGTTACAGTAACATCGTAACAAAAC
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:38c80f335b38
|
40 | — | — | — |
|
GTGCATTAAGATACGCTATGTAACACCAGTATTACGTCAT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:d3fbcf9dc5b9
|
40 | — | — | — |
|
TAGTCGCATAGCCCATATAACATTACGTAATGTTATGTAA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:eb0231b47e33
|
40 | — | — | — |
|
TCCCCTTTACACGCAACAATGTTACGTCATCTGGTAACAT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:4ce2953ae05f
|
40 | — | — | — |
|
AACAGCAATGTTACAGCGTCATGTTACTGTAACACCAATC
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:f2618551ae73
|
40 | — | — | — |
|
TCTTAATAGTTAACATGTTACTATTATGACGTAACATATG
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:bd8b63087835
|
40 | — | — | — |
|
TGGGATCGACCGTTTATAGGATGAGCATATGGTTTATGGC
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:bb0c6636c4e2
|
40 | — | — | — |
|
CTGAGCGCTGTAACATTGTAACATTACAAACAGTACATGA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:37d248a4ceb9
|
40 | — | — | — |
|
TCAAGACACGTTTCCTTGTTATGTAACGTTACGTAACTGA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:fc135fd9c23e
|
40 | — | — | — |
|
AGACGAAAACTCGCGCCAATTGTACCATATGTTACACGAG
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:302aac5d4c81
|
40 | — | — | — |
|
ACAGATTGAGGTTGGATGTATTCAATATGTCCATGCATAT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:da87852102c9
|
40 | — | — | — |
|
CACCGTTAACCATGCTGTTACTGTAACATTATGAACATGA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:5dfdbdbaed49
|
40 | — | — | — |
|
ATGTTATGTAACATGGTAACGCATGACGTCATCTCATAAC
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:f6ade49a2ebc
|
40 | — | — | — |
|
CAACTTGGGTAACGTTACCGTTATAACATTACATTATTGC
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:0ca5216a0a24
|
40 | — | — | — |
|
CCCCAGCCCCCAGCCCCCCCACAGCACAAACTAACTCCGT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:af7d54b2c0be
|
40 | — | — | — |
|
AGCACACTTCGGTTAGTTTGTAACATAGCTGGTTACGTCA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:1d1e8f654ecf
|
40 | — | — | — |
|
GTTTTACATACGACGACCATATGGTCGGCGATCATGTCGA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:9fe37ac397aa
|
40 | — | — | — |
|
TTACGTCATTTAAAAACCTCGTAACTCCTAAGTTACTATG
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:53f9a4cd692c
|
40 | — | — | — |
|
CACGTAATGTTACCTCGTGCAATGTAATGTTACATCACAC
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:688827b75104
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTCATGAACACTACGTGAACAACGCTCAATAGCCTG
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:fbead2f15f24
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTAATGTTACACCTTCGCATAGGCCTCCCAGCACAT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:a4cb90ca6ef8
|
40 | — | — | — |
|
CTGATGACGTCACATCTACCTTCAGCCTTGTTAAAGGGCG
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:27af366944cb
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTCATACATATGCCTTGATCACGCAGCAGCTTGCAT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:f233db1f50e1
|
40 | — | — | — |
|
TCCCGCATGACAATATTGCTACAAGCTGCTACGACTGTCC
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:c43311fcb492
|
40 | — | — | — |
|
TGGTAGGATTACCCGTGACATTACGTCATAACGTACGGTA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:9b295786128e
|
40 | — | — | — |
|
TCGCGCTTACACCCGGCACGGTACTATGACGTCATTGCAC
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:3dcbf48f027c
|
40 | — | — | — |
|
TGGACGTGATGACGTCATCGTTGAACTTACTATGTACAAT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:773a1a158971
|
40 | — | — | — |
|
CCGGACAGTAAGTACATATGGCCTCAAGGTGTCTAGGAAG
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:eb6903d0b010
|
40 | — | — | — |
|
TTGGTATATGTTACGATGTTACAATGGTAACAAATTGTAT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:4c6db9266020
|
40 | — | — | — |
|
GAACATTTTGTTATTGTGACGTTACGTAACACTGCAGTAA
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:735c075fab91
|
40 | — | — | — |
|
TAGAAGGAAACAGTTCGTAACAGTATGTATTACGTCACAG
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:7e3f7b8d9757
|
40 | — | — | — |
|
AGTTGATGACGTCACAGTAGTTCAATACACGACGGAATAT
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:dcf55f5fbb69
|
40 | — | — | — |
|
GCCATAGGGATGACGTCATTCCCTACACGGTAGATTTAGC
PANAPTA:P17544:ATF7_GNTR:PRJEB66722:R3:8dd4cdcc4b12
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final