ATOH1_HOXB5
CAP-SELEX sample ATOH1_HOXB5 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CTCTGTCTCTAGTTCGTGTCATCAGAACCAACCCTGATGA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:6836ba0e34ea
|
40 | — | — | — |
|
TGCTGCCGTACTTAAAAATGCTCACAAATGGAGAAACATG
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:92add3241486
|
40 | — | — | — |
|
CCACTGTTGCACAAGCTATCCATTTTCAACCCCCAATCAT
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:818e0b8b1488
|
40 | — | — | — |
|
GGACCAATCATACTCCTCAATGAAGATCAAGCTACAGCTC
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:b67faf247855
|
40 | — | — | — |
|
TAACGCCTTGTAAGGACGTAATTAGTCCTGTGACTAATTA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:cd54d58511f3
|
40 | — | — | — |
|
AGACTTGAGGTAGGATGTCATTAAGGTAGAGCCTTAATGA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:5733789dd548
|
40 | — | — | — |
|
GTTTTACTGAACATTACGGCTACTAACCTGTCATACAACC
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:fe49c093d221
|
40 | — | — | — |
|
CTGGTGCAATTAGGTCCGTGGATAGATCCATGCCTAATTG
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:c9e5c15b1373
|
40 | — | — | — |
|
CCTGCTTGTGCTAATTACAGTAAGGAAAGTGGCTAATTAG
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:2daff8bf6be5
|
40 | — | — | — |
|
ATGTAATTAGCCATATGTTACGCCCTACGTTCGGTAATTA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:6974cf6dd891
|
40 | — | — | — |
|
ATGGGACGTAATTAGCGTAACATGTGTCACTAGCACAATG
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:d0c4d3d1d87a
|
40 | — | — | — |
|
GATCACGCTAATGACCGTAATTAACATTTTAATTACCAGT
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:f2d30a1cdcf6
|
40 | — | — | — |
|
GCACATTGTGGTGCCTGCTTACCGCTGCTCGCGCGTGTAA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:5ebeddb0e4fc
|
40 | — | — | — |
|
CACTACAGGATCACGTTAATGAGCATTTATACGTCATTAA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:87a88a3326a5
|
40 | — | — | — |
|
GACCCAAGGCCCAAGAACTGATGACCACCAGCTGAAACTG
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:b1bbcf63ab99
|
40 | — | — | — |
|
GAATACCTGTACTCATGGTCATTAACGTGCTGGTTAATGA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:71cdb73b6331
|
40 | — | — | — |
|
CACTGCGCGTAATTAAGGGCATTATACAGCTGTTAATTAC
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:b87bb3ebab25
|
40 | — | — | — |
|
GACCCTGCGATTACGAGCGGAGAAAGCTGTGCTACGGAAC
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:f3d68979978e
|
40 | — | — | — |
|
GTAAAGCGTCGCTCCCTGTAATTAGGAAATGCCTAATTAC
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:212fc6b6a78c
|
40 | — | — | — |
|
GTTGGGACTACCGGAGTCCTCTAAAAGGCCACCGAAATCG
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:87b424983baf
|
40 | — | — | — |
|
ACGCAACTTATACCGGTCCATTAACTATACGTTAATGGAC
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:67a461b4cbf1
|
40 | — | — | — |
|
CCTAATTACATACACTAACATGTAACGTAATTAGCACCAA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:82840ed0091d
|
40 | — | — | — |
|
ACGACAGCTGTCATTACTTAGTACACCAATGACTCGTTGT
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:ea3db930e0ee
|
40 | — | — | — |
|
ATTATCGTGTAATTAGCGCCACAGAGCATATGGCGTTAAC
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:1f6b84fac896
|
40 | — | — | — |
|
ATTATTCGGGGGAGCAGAGGCGATGTAAATTCTGAATGGA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:b6c13fbf8f0a
|
40 | — | — | — |
|
GGGTGTGAACACTGGTAAAAAGTAACATCATGAACAAACT
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:b74e67a785cf
|
40 | — | — | — |
|
GGAACGTGTTTTGAAGTAATGCCTGCCATTGAAAACTACT
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:c82433173aa8
|
40 | — | — | — |
|
GCTAGCAGCTCGTCATATGGGTAATTAGTGTTACTAATTA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:4a397aa8fdc5
|
40 | — | — | — |
|
CATTCCGTTAATAGCCGTCATTAACACGATTAATGACGAA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:1d10104ad1d9
|
40 | — | — | — |
|
CTAATGACTCAATAATAGCAGTCATTAGCGTTAATTAGCA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:77fce7067b23
|
40 | — | — | — |
|
ACAGCAACGTTAATGCATGCATTAATTGCTCAAGTCTCGA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:d50e582add5e
|
40 | — | — | — |
|
TATCCTGCTGACCCATTAGCCTGTGAGTAAGGCTAATGGC
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:6a3850c4b48e
|
40 | — | — | — |
|
ATGTGCGTTAGGTACTGGCTTGCTGGGCCGGCGGTTGGAA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:e6d5d2268d51
|
40 | — | — | — |
|
CCCTCGTATTTGACTAAGACAAGGGAGAGCAGGACGAGAC
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:b58fb55a5d9d
|
40 | — | — | — |
|
TGCGGCCGTCCACCACGGAGCACGCATGACCGCCATATGT
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:6ea0e74fd551
|
40 | — | — | — |
|
AACCACAAGGCACCAATCGCATGTTAGTGCTGCCATATGT
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:a488e3fb64b9
|
40 | — | — | — |
|
CAAGCTTAACTAGATTTCAAGCTTCAAACTTTAAAGCCAG
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:ce5f1f6b7da6
|
40 | — | — | — |
|
CATTGTGGTGGCGCTAATTACCGACAGCAAGCAGTAATTA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:d4c17d290eb5
|
40 | — | — | — |
|
TCTGGTTAGGCGATTCTCATTATGGATGACATATGCGATT
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:074c013ed01d
|
40 | — | — | — |
|
TGACCGTTTTGCGTTAATGGGTATAGCAGATGTGCCTGAT
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:db13e33a1c20
|
40 | — | — | — |
|
TGTTGCCCGTCGTTAAATCAGTGGTCGCCCGATTTAACGA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:89efc8fb5292
|
40 | — | — | — |
|
ACTACGGCACGGACAAAAAATATTATGCGGTCTCGTGGCC
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:86ab92c9940d
|
40 | — | — | — |
|
TACAGGAAGCGGCAGCCATGTATGCAGCTATCGGATCTTG
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:b81dacda2642
|
40 | — | — | — |
|
AAATTCCTCGTAAGTATATCGTTAGACGTTCATCCCTAGG
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:15c6e6704b27
|
40 | — | — | — |
|
CTCCGAAGGAGGCTTGCCACATTTACCACGATCAACCTCC
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:d207b979dcf0
|
40 | — | — | — |
|
CTGTGGACGTCATTAGGGAAGCCGCGTTCCCTAATGACCC
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:99f7f5af0deb
|
40 | — | — | — |
|
GACCCCGCATTAATTAAGAGTAACAGATGCTCCAGCACGA
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:37dea5f41324
|
40 | — | — | — |
|
AATGTGCATTAGCACCATATGTTCGTGCGAAATAGCTATG
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:c6fbe94e66d3
|
40 | — | — | — |
|
TTTGTGCAGGGTCGTGACAGCTGTCGCTGGTAATTAGCCG
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:a9bff11ddee3
|
40 | — | — | — |
|
AATGAGGTGGGAGAGAAACTGTTCCTTCGCTTGACCGCTG
PANAPTA:Q92858:ATOH1_HOXB5:PRJEB66722:R3:041f71ecd77c
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final