BACH2_GSX1
CAP-SELEX sample GSX1_BACH2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ATGACTCACATTGACGTAACCTCACTAATAACGTGACTCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:21c8cfee88b1
|
40 | — | — | — |
|
ATGAGTCACACATTTTGCCTGGACTATGCTGACTCATGAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:657892fb4581
|
40 | — | — | — |
|
ACTACGATGAGTCAGCGGTTGCCACACTGTGCATGAGTCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:74099b3cfc0e
|
40 | — | — | — |
|
GGTACCGATCTAACGTGACTCAGCGATGACTCACCGTGCC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:e297c318f7f1
|
40 | — | — | — |
|
GACAATGAGTCACGATCTTACGATTCAAAGTGATGACTCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:f12ddfc91214
|
40 | — | — | — |
|
AGGATGCGTCATCTTTACGATAAGTATGAGTCAGCATTAC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:12a2e06c19e5
|
40 | — | — | — |
|
CCGCGTACCATGAGTCACAACCTTGACATCGTGACTCATC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:153a8384b6b2
|
40 | — | — | — |
|
GCCAATGACAGCTCACCGTGACTCATAACATGACTCACCC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:3bd0f6d51ea8
|
40 | — | — | — |
|
CATGTCTCACGCACACGTATGACTCATCGGTGAGTCACGA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:ca6320059251
|
40 | — | — | — |
|
CGCAGTACCGCCCAGCCGCATGACTCATGATGCGTCACGC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:240c38923265
|
40 | — | — | — |
|
GGCGGTGAAAAGAACGTGACTCACGAGAAATGACTCATCG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:634d8dd28b77
|
40 | — | — | — |
|
CGTGACGACAAAGTGAGTCACGTCTTTATACGATGACTCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:09b6799e9f9b
|
40 | — | — | — |
|
CCCGCGCAGCACATTGCATGAGTCAGACTATGAGTCAGCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:acb642b86169
|
40 | — | — | — |
|
GTCGTGAGTCATGTGGACCTAGAATGAGTCATGCCATGCG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:7ecc20720b8e
|
40 | — | — | — |
|
CCTATGACTCATCAAAGCCAAAACATGACTCACGTTTACG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:4daab5b547e5
|
40 | — | — | — |
|
TCGGACCAGTCAGCATGACTCATCGATGAGTCACATTACC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:42a572363f34
|
40 | — | — | — |
|
TGTACAGCAGGATGACGCATCATGACCCAAACGTGACGCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:9ea2a65c55c1
|
40 | — | — | — |
|
GCTGCTTAACAACATGACTCATAAACTATGACGCACGCTT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:568aab4236e1
|
40 | — | — | — |
|
ATGAGTCATGTGTGGCGGTAAGGTACCAGTGACTCATGGA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:ff8b130be9c3
|
40 | — | — | — |
|
ACATGCGTCACGAAATATGACTCATCCGTCATAAGCCAGA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:49f685ddcf38
|
40 | — | — | — |
|
TACGATGACGCATGTTATATTACTCACGATGACGCAATGA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:e1298f02bf9e
|
40 | — | — | — |
|
CACACTGTGACTCATCCTCCCTGGCACTGCCCATGAGTCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:f70460f9235f
|
40 | — | — | — |
|
CCTGGTAAGATGACTCATGATGACTAATCGTTCACACCGA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:51a474431a07
|
40 | — | — | — |
|
CTCCCGTCGTGACTCAGGCGTGCGTCAGCTTGAGTCACGG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:2d859f6fa8af
|
40 | — | — | — |
|
ACCCCCTCGGCTATCATGACTCATAGATGACTCACGCATC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:2d08b2c64de1
|
40 | — | — | — |
|
ACAAACATGACGTCACCAACGCCACCGCTGACTCATCTAA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:51386ffddc40
|
40 | — | — | — |
|
ACCGCATGATTCATCATAAGTTCGCGTCATGACGCATGCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:834da8f26ccc
|
40 | — | — | — |
|
AACCATGAGTCATCATGACTCATCGTTCCTTTCTTCCCAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:b902b27fffa8
|
40 | — | — | — |
|
GATGCGTCATCAAACACAGTTAAACCTGACTCACGCTACG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:808d3b846dec
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCGTGACGCATCCCCTATGAACGATGAGTCATCCGGG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:c331ec57ab6d
|
40 | — | — | — |
|
ATGACCGTGACTCATGCATATCTGCACATGTGTCATGTTA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:d0022ff27b13
|
40 | — | — | — |
|
GGCCGTCGTACCGCGCCATGACGTCACGGTGAGTCATGGC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:f26c46858000
|
40 | — | — | — |
|
CCTGCCATGACGCAGCAGTGACTCATCATCCACTGACGGG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:69542912ee40
|
40 | — | — | — |
|
CCGACCCCCTCCATACGATGTGTCATGTTATGACTCAGCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:672584e9f3ab
|
40 | — | — | — |
|
GGACCATGAGTCACACACTAGACTCGTGACGCATGCTCTA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:f31e65d70b10
|
40 | — | — | — |
|
AACACAGTGAGGAATGCGTCATCGTGACTCAGCATTGTGA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:91e70f33ce8f
|
40 | — | — | — |
|
CAATCGCGCCATGACTCACGACGGGCGCAATGACGCATGC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:259794fc69ee
|
40 | — | — | — |
|
GCCACCGCTACGAAACTTATGACTCAACCATGACTCAGGG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:806d6e7b7f4a
|
40 | — | — | — |
|
TGACTCATCGCACATCCATGATGCGTCATCAACGCGGTCG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:d58128ecd799
|
40 | — | — | — |
|
GCGCATGACGTCACGTTCACAACCCCAACGTGACTCACTA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:94c8842c85e3
|
40 | — | — | — |
|
AGTAATACCGTGACACATGCTCTCGCATAAATGAGTCATG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:1db22d171ada
|
40 | — | — | — |
|
AATGCCACAAGTGTAACATGAGTCATGATCGATGACATCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:6e0423116a7c
|
40 | — | — | — |
|
GCGCACTATGACGCATTCTACCATGACTCACGCCCACCTG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:bedce70e326c
|
40 | — | — | — |
|
ATACGGATAAACATGACGCACGCGAACACCGCATGACTCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:7da55c54a357
|
40 | — | — | — |
|
GCTACCGTGAGTCACGAAATGACTCATCAGGTACAGCTAG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:6f4afba135b6
|
40 | — | — | — |
|
CCATGAATCATGCTTTCACAGAGCGTGACTCATAGAGGCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:a3662cbc8006
|
40 | — | — | — |
|
TGCAGTGACTCATGTATGTTTACCGTCTCATGAGTCATGG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:070fc8823cc9
|
40 | — | — | — |
|
GGCTAGAAGCGTTGCAACATGACTCACCTATGCGTCACGC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:40e814cc3f4b
|
40 | — | — | — |
|
AACTATGACTAACGCCATGTCGCCCATGACTCATCTCGTA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:4a67e93cf897
|
40 | — | — | — |
|
ATGCGTCATCGTATCATAGCCATGACGCATGAGCTTGCTA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_GSX1:PRJEB66722:R3:182bdc69cdeb
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final