BACH2_LMX1A
CAP-SELEX sample LMX1A_BACH2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GCACGCGCATGAATCATGGCTTACGATAATGAGTCATTAG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:09679d16403a
|
40 | — | — | — |
|
CAGAACTACTATGACTCACAACGTAAACGTAGTGATTCAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:b74a5e089b56
|
40 | — | — | — |
|
AACGCGAACGATGACTCACTCACGCATATGGTATGAGTCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:0e71c1da70cb
|
40 | — | — | — |
|
ATGACGCATCATCGATGAGTCATGCCACGATAGATGCACA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:8422043f5fbb
|
40 | — | — | — |
|
CATGACTCAAGGTTCATGCATCCATGACTCATACCCTGCG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:c0af8f33558c
|
40 | — | — | — |
|
CACGTAAATGAGTCAGGATAACCCTTTGCATGAATCATTG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:15a6c6a46a3f
|
40 | — | — | — |
|
CCTAGTGTCATGATTCATCCATCCCCCAGATGACTCATGA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:2d61201b19c6
|
40 | — | — | — |
|
ACGACAATCACATAAAGGATGACTCAGCAGCATGCGTCAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:98c9f9639ca8
|
40 | — | — | — |
|
ACTGAATCATGGCAATCTGCCATGAGTCATAATTGCCCCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:3a17b02dfe30
|
40 | — | — | — |
|
GTACTGAGTCATCAATTCGCAATGCGATGAATCATCCAAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:58d423139923
|
40 | — | — | — |
|
ACTTGCGTGACGCATCGTTCTATGTCCAGGCATGAGTCAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:3b2af2e5cb1c
|
40 | — | — | — |
|
GGAAGTTACGACATGATTCATACTTATCATGCATGACTCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:a60726f11236
|
40 | — | — | — |
|
CGAGTGATTGATTCATCATGACATTATGACTCAACACGGA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:9695dc80ce8c
|
40 | — | — | — |
|
GCTGCATCACGCCCATGACTCATCGTGACTCATTGACTGA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:3e1e06e921f4
|
40 | — | — | — |
|
ACCTGATGAGTCATACGCCAATCACAATGAATCATCGAAA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:c685fd2f6d55
|
40 | — | — | — |
|
GATGACGTCATGCTAAAGTGAGTCATCATGCACAACATCC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:b53d234cc661
|
40 | — | — | — |
|
GAGCTTCGACAAAGCGACATCCATGACGCATGATGAGTCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:07feebecd25c
|
40 | — | — | — |
|
CCTTCCTTATGACTCATGATGAGTCACCACACTCGCGTCG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:5b40a68fd6e7
|
40 | — | — | — |
|
CTGGTGACGTCATGTTATCGTTAGACAATGATGACTCACG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:4323ce4659f0
|
40 | — | — | — |
|
ACAGTGACTCATGTGAGCACCACTACATGATTCACCAGTT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:02a0dc6d7280
|
40 | — | — | — |
|
GAGTCATGCTTCATTGCACATCGATGACTCACGCAATGTG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:b2da4c6273aa
|
40 | — | — | — |
|
CGTGCGTCATGGTGTATGTCCACAAGCAGTCATGCGTCAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:17b54211f705
|
40 | — | — | — |
|
GTACTGCGCGTTCAGCATGATTCATTAAACGTGACTCATC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:a08e3c604809
|
40 | — | — | — |
|
CATGTTTCCATGACGCATAATGAGTCATGTTAACGCAATT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:7a065bb8c0b1
|
40 | — | — | — |
|
TTGAAGGATGACTCATCTGAAGGGACTTATCGATGATTCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:594780078d9b
|
40 | — | — | — |
|
GCTGAAGACGTGCGTCACGATATGACACCAATGACGCATA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:e5d484893ec3
|
40 | — | — | — |
|
GTGCTACCCATGACGTCACTGGACGGTGATAATGACGCAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:11a13cd14df1
|
40 | — | — | — |
|
AGCCGATGAGTCACTAATAGGTATGATGAATCATCGGCAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:6c58a74dfc37
|
40 | — | — | — |
|
TCGGAGTGATGACGCATCCTCGCTGACTCATAATACCATA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:27d5b13205a8
|
40 | — | — | — |
|
CGACCATCCCTGACTCACGGTACAACAACACATGACTAAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:8c54d188530e
|
40 | — | — | — |
|
AGGATGGCATGACTCACGAATCCACCGTCATGATGACTCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:f0ccbd474bb8
|
40 | — | — | — |
|
ATTTGTGACTCATGGCAAACGCACGGACCATGACGCATAC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:e997e69b3918
|
40 | — | — | — |
|
GCAAGAAATGGTGAGTCATGGCATAGCCCCATGAATCACC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:a402ad5d6920
|
40 | — | — | — |
|
CACAATGAGTCATCATGAAATTATCATTGCTGTGACTCAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:12e0ad3d8124
|
40 | — | — | — |
|
GCATAAATCATGAGTCATTGTGACTCATGCATTCTTTGCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:de821188850f
|
40 | — | — | — |
|
GATGAATCACATTTGTTGCGATGTGAGTCATAGGAAACCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:a84ac6a9c5fa
|
40 | — | — | — |
|
ACATTGCCCGATGAGTCATGAAACTCACCGAATGACTCAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:d2ac740df193
|
40 | — | — | — |
|
GCAGCATTACGTCAATTTACCATCCCATGCGTCATCATGA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:21ebe8144140
|
40 | — | — | — |
|
GCATGACTCACTTTATGTGAGTCACGTTTTCCGCACTGCG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:8a4a3b4fe778
|
40 | — | — | — |
|
GGAATGACTCATCATTCCCGCAAAGTGTCGTGAGTCACGC
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:fb825c12e3a5
|
40 | — | — | — |
|
ATCAGCCTTGAGCACGCGATGAGTCATTGTAGTGACGCAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:f9beee4af7f9
|
40 | — | — | — |
|
GAGCCTAACAGCACTAAACATGACGCATGCGTTGAGTCAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:73d503a2b4f0
|
40 | — | — | — |
|
AGCGTGACTCATGCTACCCCTCTTTGTGACATGAGTCATG
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:7ca04124fbdd
|
40 | — | — | — |
|
CATTAATGGAACATGACTCATTGCACAAAGTGTGCGTCAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:8f38eb0fa321
|
40 | — | — | — |
|
CACCACACTATGACTCAACATCCAGCTCAACGTGAGTCAT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:8d9712637082
|
40 | — | — | — |
|
TTGTGAGTCATATCTACCTGTGCATGAATCACGTTTACCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:f8ae271c5b81
|
40 | — | — | — |
|
TGAATGACTCACCGCAAGCGCTAGTGATTCATCAGCATGT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:50a921953483
|
40 | — | — | — |
|
CGCATAAACTGACTCATGCTATGACTCACGACGTGCCTGA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:940be886982e
|
40 | — | — | — |
|
GTCAAACACGTAAAAGCTATGAGTCACAGTGCATGACGCA
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:41222e05cf6a
|
40 | — | — | — |
|
GTACACGTCATCACTACCGTTCACTGAGTCATGATTCACT
PANAPTA:Q9BYV9:BACH2_LMX1A:PRJEB66722:R3:22b08f993e9e
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final