CREB1_ELF1
CAP-SELEX sample CREB1_ELF1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AAATATTGGGGTGTCATGTGGAATACGCAAAGCTTAATAA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:9899b1bb4548
|
40 | — | — | — |
|
TGTAGTTGGCTTATGACGTAGCTAGGACACGTCATAAGTA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:ffb4d34ee3f5
|
40 | — | — | — |
|
AGCCCTATCCTACTTATGGAGGATGTCCTTATTCTGGGAG
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:40b4268b7895
|
40 | — | — | — |
|
GTGCATTGTTTCCGCATGACTTTTGCTATGACGTCATCGT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:5d4d9093240f
|
40 | — | — | — |
|
ACACTAAGGATAAATAGTGAAAGGCCAACTCACAAATCTA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:10bb7aff0393
|
40 | — | — | — |
|
ACTTCCGGTGTGACGTCATACCCATTCTATTGCATAAGGT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:d688ebb98db8
|
40 | — | — | — |
|
CCGACAATGACGTCACTTTCGTCTATCTTCGCTCTCGCAT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:e2412e4dd076
|
40 | — | — | — |
|
CAGTGACAGAATGCTGTAATGCTGCAACAATGACGTCATT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:560d9b7e4c7e
|
40 | — | — | — |
|
GCGTTAAGGCGTCTGAGTGATTCACTGTCCATTGGAGTGA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:e9c1e6b9d0ef
|
40 | — | — | — |
|
TCAGCGCGACCTCGGAACAGTGACGTCATAGCTTCGCTGA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:549fb9853e34
|
40 | — | — | — |
|
CGAGAAGCCTGCCTGACATTTCCGACGGTGACGTCACTTC
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:e84b03e5a7db
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAAATATGTTAGTATGCATGAAGAAACATGACGTCAT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:0c97abfb7cd7
|
40 | — | — | — |
|
GCAACGGTAATCTGACGTCATTGCATGATGACGTCATGGC
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:210fbfad2275
|
40 | — | — | — |
|
TAGCATGCTTCGATGCCTGTGACGTCACCGATCGTTCATA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:c0b3c513e092
|
40 | — | — | — |
|
AACTTCCGTGTGACGTCACACTATAGCCAATTTTACGGTA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:41d8e1c8d7a6
|
40 | — | — | — |
|
GGCATCTCTCGTCTTAAATGACACATCATCCTCCCTTCAT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:a3b7ecf59702
|
40 | — | — | — |
|
TACGTGCATGACTACGCACAGTGTTTCCGCTTACGTCACA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:3b9df45d0f60
|
40 | — | — | — |
|
CCCACGCTGACGTCACGCACCCTAGGATGCAGAACACGTG
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:12d4fa26ed54
|
40 | — | — | — |
|
TTTTCGATGTCGTGTGCAAAGACCTATGACGTCATGGGTC
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:f148387b5aee
|
40 | — | — | — |
|
TACGTTTCCCTTTCATGTATGACGTCACGGGAGGTGAACC
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:3b1e8d8d455f
|
40 | — | — | — |
|
CATCCCTTCCGGATGACGTCACACACTTAAACTCACTCGT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:2f9eb007f454
|
40 | — | — | — |
|
GGGCCCAAAGGGTGCCGCTGACGTCACAGTGTACACCGCT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:80bfc8518a32
|
40 | — | — | — |
|
CTTCCTTCCCTGCGGTCGTTCTTCGTGACGTCATAGATTG
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:d1953d754904
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTCATACCGATGAAGACGTGCATGGAGTCTACCATC
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:a4e56515c3e6
|
40 | — | — | — |
|
ACGTTAGCCGCGATACGATGACGACATCAACGTTCCACCA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:a6c1850fac63
|
40 | — | — | — |
|
TCTGGATCACGCGCGGCTTGAATGTAACAATGACGTCACT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:671f5d28e371
|
40 | — | — | — |
|
GCAGCATTACATTGGGCCCTCACTCCGGATGACGTCACTT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:bab6b7961735
|
40 | — | — | — |
|
GACTGATTACGTAATTAGCCCCATGTCTAATACGCAATGT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:f2b8fb6607aa
|
40 | — | — | — |
|
GTTAACGAGATGGCGTTGCGCGCATTTGTCGTGACGTCAC
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:d91fea1a2627
|
40 | — | — | — |
|
GCATGACGTCACGCGGACAGTGGGATGTGTAATTTTTGAA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:ba5100fea7e1
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTGACGTAACTTAAACGCCGCCGGCGACGTGACGTAA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:51641712f258
|
40 | — | — | — |
|
AGGGGCAACGATGACGTCATTGCTTGGGATGACGTCGCAG
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:672a8d740931
|
40 | — | — | — |
|
CAGGATATTGACCTCTTTGGGTGACGTCACGGTAGGATGT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:7dae75872e44
|
40 | — | — | — |
|
CATCGATGACGTCACCTAGACGGATGTCCGGTATTTACAT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:73af3f328ddd
|
40 | — | — | — |
|
GGCTGTGACGTTCTGTTGTTGAATAGTAGGAGTGACGTCA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:baad5d6ac1f0
|
40 | — | — | — |
|
GGTCCGGTTTAAGAACGTGACGTCACGCGCTGTTCCTACG
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:6fd31e38dd62
|
40 | — | — | — |
|
ACCCGCTGCTGACGTCACGCGGCCATTACATTAACCAACA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:cbd8acfb15c5
|
40 | — | — | — |
|
CCCATGACGTCACCACTGCCTACGAGACGCTTTACTAGCA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:360b38136388
|
40 | — | — | — |
|
ACGCATTCTGACGTCATATGTAGGTATGGCACTGTCTGTG
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:1194574ad31e
|
40 | — | — | — |
|
GAACCACTACAGTGAGGTGCCTCACGCCTATGACGTCATT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:4c1f3de7c674
|
40 | — | — | — |
|
TGCGATATCGAAAGACAGTGACGTCATTATTCCTTAGAGT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:dda9274c5223
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTCACGAGCGGGTCCAACAGTGAACATCCCTAGGAG
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:ad25767400f2
|
40 | — | — | — |
|
CTCAACGCATCCTGTACGCCACGCCGTGACGTCATGTTGA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:7db310e86b04
|
40 | — | — | — |
|
ACAGGCGTGACGTAATCGTAGTTGTTTCCGTGTAGCTAGG
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:5dbb72450cc1
|
40 | — | — | — |
|
TATGACGTCATCATGATTACCCGTCATCCCATTCGCTCCT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:9e784b28f47d
|
40 | — | — | — |
|
CCCTTGTTGTTAGTGACGTCATAACGACGTTCCCGCTACT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:f6c508f65f3c
|
40 | — | — | — |
|
CACACAGTGTATCATTTCCCTTATGACGTCATTACTGAAG
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:231146807a1c
|
40 | — | — | — |
|
GGCGTGTGACGTCACGAAGTTGCGCACGCGTAACTACCGT
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:df400310f8f9
|
40 | — | — | — |
|
GCGCGCCTGTCAACATATCCGGTACAGTGACGTCACTGTA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:76dccae2ffeb
|
40 | — | — | — |
|
ATGGTGACGTCATCAGGAGCTGACGATGCCTTGGCCTCGA
PANAPTA:P16220:CREB1_ELF1:PRJEB66722:R3:131e92cc5402
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final