CREB1_SOX11
CAP-SELEX sample CREB1_SOX11 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AAAACAATAGACGTGACGTCATGGGACGTTCTATTGTCAT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:a645b1b8492c
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTCATCGAAGCTATTGTGTTTCATCCCTTTGTGTTT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:722ce9808e8d
|
40 | — | — | — |
|
TCCTGTGACGTCACTTGTTCCCATTGTTTGCGCATTGTTC
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:ef27177339b6
|
40 | — | — | — |
|
GCCAGTCGTGATGACGTAACAATGGACTATTGTTCGGCTT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:0c915d9d3618
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTAATAGCGACGGTGTGACAATGGTTCATTGTTCTA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:b75fa0331ee0
|
40 | — | — | — |
|
TGAACAAAGGACGCGTGACGTCATCAACAATGAGTCAATG
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:1bdad4dc1081
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTAATTGACGGCTTTGTAAGGCCATAGAACAATGGG
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:cf66ccf17317
|
40 | — | — | — |
|
CTCTGTTCTCTTTGTAATGACGTCACAAAGACGCTATCAC
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:e07b46245a98
|
40 | — | — | — |
|
TGAGTTAACAATACCCGTTGTCACTGGCATTGTGACGTCA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:96a3d333fc5d
|
40 | — | — | — |
|
CTGACGTCACACAATAGTCTATTGTCGTGTACACCTCGGA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:700d690b2e20
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTCACGTGCGCACAATGGTGGTATTGTCCAGAATCT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:384921973476
|
40 | — | — | — |
|
TATGATTGTCGCATACTATGTGACGTCATTCCTTTGTTCT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:7f7f1d278c48
|
40 | — | — | — |
|
CTTTGTTAGCGATTCGCCTAAGCTTTGTGACGTCATTATC
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:f5af78e16e0a
|
40 | — | — | — |
|
GCAAGAATGTATCATCGATACGTCATAATGAGCAATGTGA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:138bf4ec5445
|
40 | — | — | — |
|
GTTACTCGTGACGCAATCTCAATGTTATTGATGACGATCA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:df2b75d14c3e
|
40 | — | — | — |
|
AAGCTCTGACGTCACAATGCCCTTTATTACCTTTTGTTAA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:fb5b59c66cd6
|
40 | — | — | — |
|
CCGTGACGTAACACACAATACACCTACCCCCCTTTGTTCT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:72b48fe4d6d2
|
40 | — | — | — |
|
ACATAGTTCACCTCCTTTGTTCGTCCCATTGTGACGTAAG
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:026a2f0199e5
|
40 | — | — | — |
|
CTGCAATCACGTGAAACTGGTCTAACCGTTCAACGCAATT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:aed742286833
|
40 | — | — | — |
|
TTACGTCACAATACCAATTGTGATGGCTTGACCCTAATGA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:293938062119
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTCACCAGGCTTTGTCCGAGAACAACGGCTATCCAC
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:d5f5f7257a26
|
40 | — | — | — |
|
AAGGTGACGTCACACCATTGTTATCAGCTCTTTGTACCGT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:726c68c8655d
|
40 | — | — | — |
|
TAGAGACAAAGTACCTTTGTGACGTCACAGTGCTACCATT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:eb0028504917
|
40 | — | — | — |
|
CCCTGGGGACAATGACGTCACAACTATTGTCTCTTTGTGA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:8cb889487ae7
|
40 | — | — | — |
|
CTCCTATTGTCTATTGTTTGCATGATAATGCGTGACGTAA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:78d0066eaac8
|
40 | — | — | — |
|
CGATTGTATTGTGACGTCACAAAGCCGCTTCCTATGTGCT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:81512a7f4e23
|
40 | — | — | — |
|
TGTTACGTCACAATAGGGTTGTTCACAATGGGACTATTGT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:83fe6dd06a8c
|
40 | — | — | — |
|
CGTCGGATGACGTCACAAAGGCGTATTGTTGATACATGAC
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:cf76c148d51a
|
40 | — | — | — |
|
GAACACATGACGTCAATGGTATCCATTGTTCTTATTGTGT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:e3b745377041
|
40 | — | — | — |
|
CTATTGTGACGTAACAAAGCGGCTGTAAGGAACACGACAA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:fdd73ca9a414
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTAGGCAACTACTCTTTGTCTTATTGTTCGCGATAA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:bfb0f604d872
|
40 | — | — | — |
|
GAACAATGCTGCACGCCATGACGTCACAAAGCCTGTCCCC
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:84d293e8f20f
|
40 | — | — | — |
|
GGCCGAGAGTGACGTCAGAGCCTATTGTTCGGCCTATTGT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:c5d59b979ce7
|
40 | — | — | — |
|
CGGCGGTGACGTAATGCGGGGCATTGTCTCACCTTTGTGC
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:25d9b655c786
|
40 | — | — | — |
|
TCTAAGCGATTACGTCACAAAGGACTGACCTCTATTGTGC
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:5fc05b730fe6
|
40 | — | — | — |
|
GTTATGACGTCACTTCAGGCAGTGTTCTAAAGAACAATGC
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:eaf73469c7bb
|
40 | — | — | — |
|
TCAATGATACGCTTTGTCCATACTCATTGTGCTTACGTCA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:fd42b060a9b1
|
40 | — | — | — |
|
ACGTCACACACAAAGGACCTTCGGCCAGAGCATTGTACTG
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:484572641203
|
40 | — | — | — |
|
GCTATGACGTCATTCATCTTTGTCTTCTTTGTGTTGACAG
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:0413f5e56088
|
40 | — | — | — |
|
GTTGCCTGAACAATAGGGATGTGACGTCACAGGCTTTGTT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:b5e089cf2c72
|
40 | — | — | — |
|
TGACAAAAGGTTAGGACTGACGTCACAGTTTCATTGTTGT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:bc6df662e856
|
40 | — | — | — |
|
GTTCATGTGTAACAATAGACATATTGTGACGTCATCGTTA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:b862bc42536a
|
40 | — | — | — |
|
GTGTCTTTGTGTTACGTCACGCCCAATTGTTCACGTGTCT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:3202add738a2
|
40 | — | — | — |
|
CACCTCATGCAGACAATACCCATTGTATTGCTTACGTCAC
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:165674bb54ee
|
40 | — | — | — |
|
AACACCTTTGTTGTATGCTGTGACGTAATAGACAATGGGG
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:5abfdcc5abce
|
40 | — | — | — |
|
CGACTATTGTTTCGCAGTCATATCTTTGTGACGTCATTGT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:db5e3a4b87eb
|
40 | — | — | — |
|
ACGCAAATGGATGCCTTTGTGTGACGTAATCAATTGTTCA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:c34c67b395ae
|
40 | — | — | — |
|
AAGGTAATGACGTCGTCAAACAATGGAACAATGTTTGTGA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:2634fa47127d
|
40 | — | — | — |
|
GCCGAGCCTACCATTGTCTGTGCCATTGTTGACGTCATCA
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:aef47aca1b55
|
40 | — | — | — |
|
TGTTCCCTTTGTGTGTATGTGACGTAAGTGGTATTGTTAT
PANAPTA:P16220:CREB1_SOX11:PRJEB66722:R3:da374329b39b
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final