CREM_HOXA4
CAP-SELEX sample HOXA4_CREM · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GACGTGCGGTGAGAGACACGTGTCAACTGTGACATGACAT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:8c70f62c44b0
|
40 | — | — | — |
|
AACACAAAACGCCCTTACCTCTGGCACTACTGCTCACAGC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:7334502fb568
|
40 | — | — | — |
|
GCCGCCAAATTAACGTGTTTAATTGGGGGACGATGGACGT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:c87458bfc626
|
40 | — | — | — |
|
GTGCGATAAGGCATTATCCCCGATAATGCGAAAGCAATGT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:c3f5722afb58
|
40 | — | — | — |
|
CATTATCTCATTATCGCAGACGCGGCAGCGATTGAACTTT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:14aef3d95951
|
40 | — | — | — |
|
GCCCAGAACATCGTTTAATACGCACTAAACGATGTCATGT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:586b42576f93
|
40 | — | — | — |
|
GTTACATATGCACCTTAATGAGCCTACGTCATACAAATGC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:a951bc592f2d
|
40 | — | — | — |
|
CACGGCGGAGCATAATTAGCGCGTTAATTAATGACGCAAT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:406e8de61377
|
40 | — | — | — |
|
GAATCGCCTAAATTGATCGCAGCTCAATTAGCGATAACCA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:6f83273956bc
|
40 | — | — | — |
|
ACGAAATAATGTGCATCCCAGTACTGCGTGAACATTATGT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:154e0af31718
|
40 | — | — | — |
|
AATGGTCGCGTTAGAAATGAACATGGCCACCATTAGTACC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:33dd744adbb7
|
40 | — | — | — |
|
AACCAGCAATTAGACAAACTAATTGCGTCAACGATGTCGC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:d0814348be61
|
40 | — | — | — |
|
TCGCATCCTACATTAGGACGAAATGGTTATGCCAGCCCAC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:57cac5d8b4dc
|
40 | — | — | — |
|
GGAATAATTACACTCATCATACGTAATTATGTGCGCACCT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:f49a3f78061e
|
40 | — | — | — |
|
GGACGTAGAGGATTACGTACGTCAATGAGGAGGTGATTAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:844c47ddb759
|
40 | — | — | — |
|
TACCGATACGTCACGGTATCGCTCTTAATCGTCGTGTAAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:f067aa963809
|
40 | — | — | — |
|
CAATTAGCTTCACGCCCTCCCCTGCCGCACCGTAGTCAAG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:1b51ecd42d0a
|
40 | — | — | — |
|
CGTCGCTAATTACCTTGGGCACAATTAGTGTTAACCTAGA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:c6272f025bfe
|
40 | — | — | — |
|
TTGCCCAATTACCATGGGTGTTGCGCCGAGGGCACGTGAC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:9bcbed8d8b82
|
40 | — | — | — |
|
CCAATTTGCATTGCGCTACCCACGCGCGCGTAATGACACG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:0a09d6ca32d1
|
40 | — | — | — |
|
CTTAATCAATTGACGGCTAATTGATAAAGTGTGATGTACA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:68ab49921815
|
40 | — | — | — |
|
ACAAATGACGCGATGACGACGCGATAATCAGGATCTAATC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:fe20c0fe826f
|
40 | — | — | — |
|
GCACGTAGGTAATCATAGTAACGGGATGATTACTGCTTTG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:814b33568297
|
40 | — | — | — |
|
GACGCCTCATGACAACGTCATTTAGCTTAATGACTACGTC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:a9703d3d2838
|
40 | — | — | — |
|
TACACTAGAATTAAGTCATTAGTGTAATGACGCCCCTCAT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:521f5aa3a728
|
40 | — | — | — |
|
AAGCCCACACCATTGGCAATGGCGTATCCACGAACGCTCT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:e99cfcee0291
|
40 | — | — | — |
|
GTACATGATGATGTATCAAGGGCGTAATTAGCCCCTACAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:cb3ed5b59e25
|
40 | — | — | — |
|
GCGTATCGATTAGATCGTAATCGATGAGGCGCAGAGTGGC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:dfe88a062da0
|
40 | — | — | — |
|
CCACGAATTACGATCGAATGGTGATTACGTCATGACAATC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:032096d31582
|
40 | — | — | — |
|
CCCTCGTTGCAATAGCAGGTAGATGAAGTAGCTAGTTTCC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:8997ab55be15
|
40 | — | — | — |
|
GTCTACATTAATAGGCAGACTGGCAATTAATGCGCATCAT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:502663ea9cef
|
40 | — | — | — |
|
ATGCACCACCCGCATGGTCCCGTTCCCATTAACCTAATTA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:36a74248deb3
|
40 | — | — | — |
|
GTCATAATGCAACCGATCATTCACAGCGGAAAATGATCAG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:daf81e12bb9a
|
40 | — | — | — |
|
CATTATTGCTCAACGTAATGAGTGCCTCACGATTGCGGTC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:11160839f10d
|
40 | — | — | — |
|
GGTACGTGACGTTCATTATAACGATGGACTGATAAATGGC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:5730ab18be2f
|
40 | — | — | — |
|
TAGCAAAGATAAGGACAGTACTAATCGTTTGATGATGGGA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:dd1c0b03946e
|
40 | — | — | — |
|
TAGTTGGTGAACGAGGGTCGATTAACGCTGATGAATGGAG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:785c2b514253
|
40 | — | — | — |
|
ACAAGATGATGGTCGTAAATGACAACGCAAACACATCGCC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:8227d5d55d47
|
40 | — | — | — |
|
AAGGACGCAAGCTGATCCACGTCATTAGCCCGGCTAATGA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:95196c098cb8
|
40 | — | — | — |
|
CTGCACTCACGTCATGACCCACCCCAACCCACAGTCAGCT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:7b90f37a67a7
|
40 | — | — | — |
|
GAGACGCGTACGTCATTATTCGCGTGATAATAACGATGTC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:e2393cf244f6
|
40 | — | — | — |
|
CGCTCATTACGCTGTAATGACCGCGTATCAATCAGCTTAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:0b856f8dac8b
|
40 | — | — | — |
|
GGATGCCTAACAACTTCGAGAACTGACGACACCCTCGCAC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:7d294c0d3674
|
40 | — | — | — |
|
CGACGCTCTTGCCCAACCCATGATTACACTATAATCGACT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:ab6b5970fde3
|
40 | — | — | — |
|
CGATAAGCGTCCATCCGACGCTAATCGCAGGCCCTACAGC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:840d4d6daca0
|
40 | — | — | — |
|
AATGACTTTCAGCTGGAATCATTATGCATCCACAATGATC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:468f3947ff62
|
40 | — | — | — |
|
CTGCTTACACAATGCTATGCGGCATGAAATTGATGACGCA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:b9f2d2cd85e9
|
40 | — | — | — |
|
GGTAATTAGGGCTGTGATGACCATTAGCCGGCGGCAGACA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:1068a00306bc
|
40 | — | — | — |
|
GAGCCGCAATTATCACACTAATGCGATAATAATGCTGTTT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:b85f80955627
|
40 | — | — | — |
|
TGGTGTAATTATCGCGAATGTCGATAATTAAGAAGGATAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXA4:PRJEB66722:R3:883b3b174c5e
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final