CREM_HOXD3
CAP-SELEX sample HOXD3_CREM · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CATGATGGTCATTAAACACAGCTTAATCACCATGCCACAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:ed3edfd68a56
|
40 | — | — | — |
|
CCATACATGACGTCATTTGCGCGTTAATTAGGCCATGACG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:11a598521d3a
|
40 | — | — | — |
|
TGCAGCTAATTGGAAACTAATTGCAGACCCGCGTGACGTC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:2a4fa42a9ac2
|
40 | — | — | — |
|
GGGCAATAGCTACTTGATACCTAATGACGATCTATCACAT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:cba4e54f587e
|
40 | — | — | — |
|
CTAAGGGATGACGTAATTAATGACGCCATCATTAGCCCTC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:59084d14aaaa
|
40 | — | — | — |
|
TGAAATGACAATTGCCCGTTAACCGGGACACTCAATAGTG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:f06484bd673c
|
40 | — | — | — |
|
CACGGTCATTACCACTGCTTACGTCATTAACAACTGCTGT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:46308742c1c8
|
40 | — | — | — |
|
AGGGAACACCCATTAACCCGTAATTGCATTCCATGACGTC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:c56c17c42f4f
|
40 | — | — | — |
|
CCCGTTAGCCCATTACGCTAATTGCGTCACACCTTCTGTC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:3ff4be8d1d8c
|
40 | — | — | — |
|
CAAGCTAATCGCTAGATCATTAGTTATTCCTGATGACGTA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:e1b8c05c6ecb
|
40 | — | — | — |
|
TAATTAGATAGAGTCCTAATTACAGGATACGCACCACATT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:97c952b11328
|
40 | — | — | — |
|
CTACTGGGAGAGCCAACGTCATTACGCACCCAGCGTAATG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:c2b697998938
|
40 | — | — | — |
|
TCATTAGGGCCATCGCGACATAAACGTGTCACCCCTAATG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:91b78c5bf4f3
|
40 | — | — | — |
|
CAAGCATACCATGACGTAATTAATGAGCCATTACCCTCTG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:8f9b3a4e543d
|
40 | — | — | — |
|
ATGCACTCCTAATGACCGTATTACCGTACGTCATTACCGC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:68c288b19cb9
|
40 | — | — | — |
|
GCGCATTAAGGTATGACGCCACTAATTACCACCTCATTAG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:e77cc3d19215
|
40 | — | — | — |
|
TGGTAATTAGAGAATGTCCTAATTACATTAATCGTATCGT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:4573604601a0
|
40 | — | — | — |
|
ACAGGGATAATTACGTCATATAACGCTAATGAGAGCACGT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:ab9b890bdc49
|
40 | — | — | — |
|
AACCGTCCGACGTCATAGCATAATTATGCCTAATGACGTG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:35c659f12bb9
|
40 | — | — | — |
|
ATCACGGATGCTAATTAGCGATTAATGAGCTTTCGTATCC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:440144542e07
|
40 | — | — | — |
|
TAATTAAGGATTCCTTAATTACGTGCATAGACATGCAGAC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:b8e1d459de31
|
40 | — | — | — |
|
TACGCCAAGTTGACACATTACGACTAGCGTAATGATATGA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:179916fd1be6
|
40 | — | — | — |
|
CTACGTCATTAGATGCGCACGGACGATAATGAGCAACCCC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:9f034e523f69
|
40 | — | — | — |
|
CGCTAATTACTTCCTTGCTCAACCCATCAGTAATTAGCTC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:18e860b09a59
|
40 | — | — | — |
|
CCAAAACGCGTAAATTGCGCTAATTACGTCATCGCGTGTT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:a79e15e519a2
|
40 | — | — | — |
|
ATGAGATGCTTACTCGAACTACGTCATCACCGTAATTACC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:26aea7f972a6
|
40 | — | — | — |
|
CCTGACGTCATTACGCTAATGACCAAACACCTTCTCACCT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:e66860934a70
|
40 | — | — | — |
|
TCACTAATGATCATCGAAACGACCTACCGCCTACGTCACT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:08cd6d546f41
|
40 | — | — | — |
|
CACGTACCTGATGACGTAATTAGCAACACTACCTCGTTCA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:ac10febadfd1
|
40 | — | — | — |
|
GCTAGCTGACGTAATTATCAGTGCTATTTACGCTAACACC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:e067b19fdebb
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCTAAACGAATGCTAATTACATTAGCCTAATGGACGT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:a2f9456c8df0
|
40 | — | — | — |
|
CACGACTTGCTAATTACTGCAGTTAGCTAATGACCTTGAC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:0bef0781cbe3
|
40 | — | — | — |
|
CTGATGTCACGTTGACCGTAATTAGCGCGTCATTTAGCCG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:bad4f83be293
|
40 | — | — | — |
|
GCACACATTACCGCGTGATAATTACCCACAATTAACGCGG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:a5898c0e7f1b
|
40 | — | — | — |
|
GACCACTAATTACCTTAATTAGCGTAATGTTCCATGCCGC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:74e17550b284
|
40 | — | — | — |
|
GTCATTAACGCCTAGGCAAGTCCACGCTAATGACCGTTAC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:b03bc452fcd9
|
40 | — | — | — |
|
CATGACTATGACGTAGTTCATTAACACCTAATTACATGCA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:61efc76b88de
|
40 | — | — | — |
|
CTCATAATGCCGCTAATTACTGCGCCCCTTTGACGTAATT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:206b6432d276
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCACCCTCGCACACTGCCTAATGATCAATTAGCACTA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:4c28794962c2
|
40 | — | — | — |
|
CCCTACGTCATTACCACCCCTAATTACCCCCGCCACTCTC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:c3e05be45e83
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTATCCGGTCATTCGTTAATGACGCAATTAGCTACCT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:762e44338cca
|
40 | — | — | — |
|
ACGACTAACTACAGGTCATTAGCACGACACGCTATTGACG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:97972ba10172
|
40 | — | — | — |
|
GATACGCTCTGACGTCATTACGTCGAAGCATTAAGTACAT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:0240c5bb487f
|
40 | — | — | — |
|
CCACTAATTACTTCCGTAATTACATAGGTCTCACTAACGT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:348163ca834c
|
40 | — | — | — |
|
GATCCATTATGGCAATTAGCTTACGTAATGACGCTGACCG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:3fa5568d3009
|
40 | — | — | — |
|
TTCGGCAATTAGATCCTAATTGTCATCTCATGACATGGCC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:31137cbd9222
|
40 | — | — | — |
|
TAACACGCTAATTACGCGGACCCAGGTAATTATGCAGCAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:c7587585eb0f
|
40 | — | — | — |
|
GTCATTAGCTACCGCTTCGCTCGCTAATCACCAAGTTCAC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:eabf7eafdfaf
|
40 | — | — | — |
|
CATAATTAATGTATACAACTAAAACGCTAATGACGTCATT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:592719c7ac91
|
40 | — | — | — |
|
CCTAATTAACCCATTAGCGTGCACCCCACGTCATAACCTC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD3:PRJEB66722:R3:72c21dee2d70
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final