CREM_HOXD4
CAP-SELEX sample HOXD4_CREM · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TGTCAGGTTCGGGAAAGACGTGGCAATATAATAGTCAGAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:c4183143eb98
|
40 | — | — | — |
|
CAGAACTTAACTCTTCTTGAACAGGAAACCCCGCATTGTA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:ee2a30cdcb7e
|
40 | — | — | — |
|
ACCTGTTGTACAAGTTTACCGTACGTGGGCACACGGGCAC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:e62ab63b5058
|
40 | — | — | — |
|
ACCGCTTGTCAATTATCACGCTCAATAATTGACGGTACTA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:55017b2351ee
|
40 | — | — | — |
|
TGAATCATTAAATGCACTTAATGACTTCCGCCATGCAATT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:79cda0f16b25
|
40 | — | — | — |
|
GACGACTAATCGTTGTCTATAACGATTAGTCGCACTGCGA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:1d843f6fae01
|
40 | — | — | — |
|
TGACCCACGTACGTTAATCAGCACTGCTGATTAAGGTTAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:a3e9dcb2aac7
|
40 | — | — | — |
|
CCATACCGCACCGTGACTTTCCCTCCTTCATCCCCTACCA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:2791ffc8208b
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGGCTAGGATATCTAATGACCCATCGTGATCATTAGG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:48bffa72354d
|
40 | — | — | — |
|
TAGGTCATTAGAGTTACGTTCTAATGACGAATCATAGGTT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:2aa0cd1c2729
|
40 | — | — | — |
|
CGATGACGTACGATTACGCGTAATAGTACAGACTCTCACA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:abf132bc7129
|
40 | — | — | — |
|
CGATCAACCGACTTGTCATTAGGCCTCCTAATGACACTCC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:7538fcdd0603
|
40 | — | — | — |
|
ACGTAATTAGTGGATATTGCTAATAACGTATAACACGTAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:68afd6b34765
|
40 | — | — | — |
|
CAACAGCAATGATCGTTATGACCCAATACATAACGATGGG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:fc3816fa1fbb
|
40 | — | — | — |
|
TAATTGGATCCATACCGCTGCATCATTAGAGACATAATGA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:e4c54036562f
|
40 | — | — | — |
|
TCAGGGACGATAATCATTAAGGTGGCCTTAATGATAGCAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:db2b46d0fea5
|
40 | — | — | — |
|
ACATCTACGCAACAACGAGCCTAATTGATGATCAATTAGG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:85b8098163f5
|
40 | — | — | — |
|
TTAATGATCGCTTGACGCTCATTAACGTGTCGAACGCACG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:6abd7bf63f04
|
40 | — | — | — |
|
AACGTACGACATGCATTATGACATAATGACGCGTAAATGA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:1e821a471cd9
|
40 | — | — | — |
|
ACGAGACACGTACGTCATTAGTGGCTAATGAACGACATTT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:0f03505e0b31
|
40 | — | — | — |
|
CTAATGACATGGCCAGTGCCTCTCATTAGCAGGCTGGACA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:981610deef39
|
40 | — | — | — |
|
TACACGAGAATACCGCTCATTAGCGTATATACTAATGAGG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:77cf02fc3f9f
|
40 | — | — | — |
|
CCAGAAAGATTATGCGTAATGATCGAGGCCATTAACATAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:9204d0f0570d
|
40 | — | — | — |
|
CGTTTTGCTTAATTACACTGTAATTAACGAATCTCGTCAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:abeebf2ec6b0
|
40 | — | — | — |
|
TAACGTGAAAACTAATGATGACGTAATTACATCATTACCT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:6194957376cc
|
40 | — | — | — |
|
GCGTACCGTAATAATCGTAATGATTACGGGCAATTGACCA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:4faf159409e6
|
40 | — | — | — |
|
ATGCGTGGTTAATTAGCGTAATTAGAGGATTATCATGCGA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:9b8eb9f4981c
|
40 | — | — | — |
|
TTGGCTGCGTGGTGTAATTAAGAAGCGCTTAATCACATGC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:d4236b990d25
|
40 | — | — | — |
|
TACGTTGAAGATGTATAACCATTAGCCACTAATGGTTAGC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:8cd610d04f57
|
40 | — | — | — |
|
CCCACAGCACCATTAACATAACGTTATTGGTGCACACCGC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:dae3a3a7997d
|
40 | — | — | — |
|
TACGCGTGATTATCCAGATCACCAATAATCACGATCTATA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:dd8dc579ed07
|
40 | — | — | — |
|
TGCATTAGCAAATGAGTCATTAGGCATAATGCGATATCGC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:91a9a2182d69
|
40 | — | — | — |
|
GTAATTATCCTAACACCATAATTACTCGCTACTATATCAG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:d5ff7d2f7501
|
40 | — | — | — |
|
TGTCAACAAGGCAAACAACTAGTTATCGTTAACCTAATGA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:2fae22a1254e
|
40 | — | — | — |
|
GGTATCATTATGCCTTGATAATGATACCTAATCCTGGAAC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:a87a8c66c41d
|
40 | — | — | — |
|
ACAGCGAACACACTCGTTAATTGCACCTGCAATTAACTAG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:6126ab21d629
|
40 | — | — | — |
|
CATTTACCAGCATCATTACGTCAATTACCAAGAACAAACG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:30f96ad3f051
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCTCATTACGTTTATGGGCAGCTCGTAATGAGGTTCC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:99720e903577
|
40 | — | — | — |
|
GCGAGCCTTAATCGTGCAGCTATTATGACGATAATTGCCA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:a17d0b955b42
|
40 | — | — | — |
|
AGTGGTCACCGATAATTACCTGTAATTATGAAGCATTAAT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:8669862314f5
|
40 | — | — | — |
|
ATTGCTTAACTAATGACGTCATTGTTAACAATTAATGCAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:8325b8b56caf
|
40 | — | — | — |
|
GCCAATAAATCCAATTAACGAAATGGTTAATAGGCCACGA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:b91865e64e2c
|
40 | — | — | — |
|
AAAAGATCATTAACGTAGTTAATGGACTTTTGCGTTCGAA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:8b1828c41288
|
40 | — | — | — |
|
ACATAAGTGTAACTGAACTCATTACCAGCTAATGAGGAGA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:5d9666fee8af
|
40 | — | — | — |
|
CAAAGCCATCTCGCACGTTAATGACTGCTGAATCATTAAT
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:437fc4eb0555
|
40 | — | — | — |
|
GCACTACGTTGTAATGTTGGGCTGCTAAGATACATCATTA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:4f49cdc7d74a
|
40 | — | — | — |
|
AATCATTAACACACACGTGTTAATGAATAAGCACTAACGA
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:5658d89f9f65
|
40 | — | — | — |
|
TCATTGACGTCATCCGTACATTATGCCTAATGACGTCATG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:a05307c3da8b
|
40 | — | — | — |
|
GCTGATACCATTAATGTAAGAGAAGAGTCCATTAATGGAC
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:bba5ebc8e9ff
|
40 | — | — | — |
|
AATGACAATTACTTTAATGACAAGGGGCTAATTGCATTAG
PANAPTA:Q03060:CREM_HOXD4:PRJEB66722:R3:d61cc7a058ac
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final