CUX1_LMX1B
CAP-SELEX sample CUX1_LMX1B · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ACAAACACCAATAACCAATATATCGATCAGCGAATACGAT
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:487f94c763b3
|
40 | — | — | — |
|
TATAACCTATCGATTACCAATACCTAATTATCACTCCGCC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:acaea004527b
|
40 | — | — | — |
|
GATCGTCGAATTCCTGATAATCAATCAATGGATCAATCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:9d8dddb9cf60
|
40 | — | — | — |
|
AGCCAATAAGTGATCGATAATCGTACCTCCCGAGTCACAA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:bfd9e3d9857c
|
40 | — | — | — |
|
ATGTGATTAATTGATTACGTATCGGAATTGCGCTCAGTGC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:d0565aa91085
|
40 | — | — | — |
|
CTCAATATCGATAACTAATATCGATTACACAGCGGCCTCA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:4d88fa9367a7
|
40 | — | — | — |
|
ACCAATACGATCCGCAACCTATGCCAATAATAATCGATCA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:cdd7db46f9c1
|
40 | — | — | — |
|
GATGGCAAGCCACGAATCGATCGATTAATTATCGGACCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:66fdbc2ef921
|
40 | — | — | — |
|
GATCAGAAATCAATAATCAACCTTATCGATTGAGCGATGG
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:fdf751db713e
|
40 | — | — | — |
|
ATTGATAGTTATCGTCGATTATCGATTATGCATAGCCTTG
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:057bf5557911
|
40 | — | — | — |
|
GCGAGAACTGATCGATCATCATAATCGATAAGGACCGAAT
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:72d2e43706b7
|
40 | — | — | — |
|
TCATGATAGAGTTTATCGATCAGTTATCGATTAATACCGC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:dc8cd173d8e0
|
40 | — | — | — |
|
AACTGATGGTCTAGTGAATGTCGAACCAATAACTAATCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:217df74ca418
|
40 | — | — | — |
|
TCTATTGATTATCGATTGGAAAGCGATTGCATATTAGATT
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:96ec7d7cb68a
|
40 | — | — | — |
|
CATTATTGATTATTGATCACACCGCACGAACATTCGACAA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:65fede53a219
|
40 | — | — | — |
|
GATCGATTATCCATCGATTCTGTATCTGTGTGCCCCGACG
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:75c476494ed7
|
40 | — | — | — |
|
ACATAATCGATAAGCGAACGCTTATCAATCAATTACACTA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:8bbc8af49e6a
|
40 | — | — | — |
|
TTAACAAGCGCCGATAATCATTGGCAATAATCGATTACAT
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:4db0caa47cf0
|
40 | — | — | — |
|
AATCGATAAATTATCGGTAGTAACCGTCGTATTGATTCTC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:4b0e92c1927a
|
40 | — | — | — |
|
CACCCCCCAGGTTTCCAATCGATACCTAATCAATACTTAA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:fa98564750b7
|
40 | — | — | — |
|
TCCTAATAGCCAATATAATCAATCGTCAACAATCAATACC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:68ff374bdf79
|
40 | — | — | — |
|
TTCGGTATCAATAGCCAATAATCCATCGATCCAATCACTC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:c441fbe6c70e
|
40 | — | — | — |
|
TAACATTCGATAATCAATAACAATGTATCGATGACAATGC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:f16443dd9566
|
40 | — | — | — |
|
ACCAATAATTAATCGATTGCACTGCCACAAGCACAGTACG
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:49a5f7dc9844
|
40 | — | — | — |
|
AAAGTTAATTAACTTCGACGCAAATCGATAACTAGATCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:44c4c7f14b46
|
40 | — | — | — |
|
CTGGCGTATTGAAAGTGATCAATTGCTAATCGATAACTCT
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:53171a05988f
|
40 | — | — | — |
|
GATATTACCAATCACATAATCGATACCCAGTTATCCGCGC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:709d8d85818f
|
40 | — | — | — |
|
TAATCAATAACCAATCACTCAATCCTTATGTTACCGCCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:16ff7e070754
|
40 | — | — | — |
|
CTGTCTGATCGATAATCAATGGCCACTAATTACAACGCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:17299445dc45
|
40 | — | — | — |
|
CCAATCACCCTAGCAATACCGATAATCGATAACATTGAAC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:256620d30614
|
40 | — | — | — |
|
TATTGTATCTACGTTATCGATAACGTTGAGTATTGATCCT
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:c1cad73c9199
|
40 | — | — | — |
|
ACTCTCACTAATCGATACCCAAACCAATCGATCACGGCAT
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:77dc1f00596e
|
40 | — | — | — |
|
ATGATCGATCCGATAATCGATCACATCGGAAATGCAACAT
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:6a6543024c0c
|
40 | — | — | — |
|
AAGTGCCTAAAGTATCGATCCCTAATCGATAACTATCGAC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:5e6b4cab78f4
|
40 | — | — | — |
|
TATCGATAGATCGATTACCAATCATCCAACTGTACAATGG
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:fbb398b2d1a6
|
40 | — | — | — |
|
CGATAATCGATAAATAAAATCGATCAATGGGTAGCATATT
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:56b15e259198
|
40 | — | — | — |
|
TATTCCATACTAATCAATAATCGATTGACCAGACCAACCG
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:45578ea7c02d
|
40 | — | — | — |
|
CTTCCGCCCTCAAGACCACGCATTGATTAGTTATTGATCT
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:8d211e00c1ac
|
40 | — | — | — |
|
CCGATATATTGATTATGTCTAAACGCCAATACGTACTCGC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:1e18b5b998aa
|
40 | — | — | — |
|
TTGTCAATCGATGATATCGGTAATCAACTAATTGGTACGA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:19d5bc764709
|
40 | — | — | — |
|
TTATCGATAACTATTGATTACATCGCGGGAATGCTAAGCG
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:ddc53ec9f915
|
40 | — | — | — |
|
TCACTCCCCGCCCGGAAATCACCACTTCCGCCCGCCACGA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:271846d4518e
|
40 | — | — | — |
|
AGCTGATGCCGATACCACGCTAAACTAATCAATAACTCCC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:eef67702a565
|
40 | — | — | — |
|
TCTAAAACACCAATACGCACGCTGCCTAATCGATCACGTC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:b3e44ed9e2ff
|
40 | — | — | — |
|
ATCGCGAAATCGATACCTGGCCTGATCGATTATGTCGATC
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:96750a47e681
|
40 | — | — | — |
|
CGAGAGCGAATCATTCGCGTTATCGATCAGTTAATCGATA
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:209327f7b940
|
40 | — | — | — |
|
TATCAATATCCAATAATTGCCATGCAATGCTGCGAACTAG
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:def75097465b
|
40 | — | — | — |
|
GTATCGATACATTATTGATTATTAGAACTGCGGAGAGCGT
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:cb9ca6a374f0
|
40 | — | — | — |
|
GGCATGACGAGCTAATCAATCAATTGTGAAATCGATAAAT
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:48ebba3e6ddb
|
40 | — | — | — |
|
ATCGATACCGATATCACTCATCGATCAATTGAGAATTAAG
PANAPTA:P39880:CUX1_LMX1B:PRJEB66722:R3:56a778b64243
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final