CUX1_NKX6-1
CAP-SELEX sample CUX1_NKX6-1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ACTAATTAATCAAATACGATTATGCGGGGGGGACCTCTAA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:18fabd4c5c20
|
40 | — | — | — |
|
GGTCGCTATTTACCCTAATTGCTTTTTAATGACCATAATC
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:92d26f365750
|
40 | — | — | — |
|
GCTAATTAAAAAGCAATTAACGTCTAACACATGACTACTA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:b4d94d897ee0
|
40 | — | — | — |
|
CCGTTTCGGAACTAATTGCGTTTTAATTACCCTACTATCA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:e59fee53eaf5
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCAAGGCATTCATCGGGTAATTAAAAATCAATTAACG
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:c46c9729eb0e
|
40 | — | — | — |
|
TGCCGCACATTGGATCGTGTAATTAAAAAGCAATTAAGCA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:0f53c0ba4db7
|
40 | — | — | — |
|
TGAACGCAAACGCAAGCTAATCAAAAAGCAATTAGTGTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:ed86b7353821
|
40 | — | — | — |
|
TACTTGCCTGTTAATGCGTTAATTGATATTTAATTGGTGC
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:a5b782c038c4
|
40 | — | — | — |
|
AGAACATGTACACTAATGAGTTTTTAATTGATTATTACGT
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:c548f0891029
|
40 | — | — | — |
|
CGTTAATTGCTATTTAATTGCGATGCAGTAGCGGACACGT
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:b3a235f5634b
|
40 | — | — | — |
|
ATTGAGAATCACAACGACTCGCTAATTGCTTTTTAATTAC
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:988160c54bb3
|
40 | — | — | — |
|
GTTCGCATTAGGAGCAATTAAAAATCAATTAAGCGTTTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:729aea2288a6
|
40 | — | — | — |
|
GAGCGAAAGATACGATGCAATTAAAAACGCATTAACTAAG
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:707a22fe6665
|
40 | — | — | — |
|
GCAACCCTTAACTATCATTAAAAAGCAATTAGCGCAATGC
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:c7448388f3ec
|
40 | — | — | — |
|
CAAGGTAATTAATAAGTAATTATCAGTACGAGTAGTATGT
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:4d549001ca18
|
40 | — | — | — |
|
GTGCGCAATGACTCATTAAATTCCCATTACCTGGCTGCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:f8518341abc3
|
40 | — | — | — |
|
CGAACACTAAATCACGCGCTAATGACTTTTTAATTGATTC
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:69592adecf71
|
40 | — | — | — |
|
TCATTATTTACATATCGATTAAATAGCAATTAGCTATCAT
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:a04c651847be
|
40 | — | — | — |
|
TGTAACCGATCAATAATCGATCGCGAACCATCGATAATGA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:8d02471ff532
|
40 | — | — | — |
|
CCACGCTCCGCATATTCCCTAATCGATATTTGATCGATAT
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:889173db6c25
|
40 | — | — | — |
|
TGATCGAATCAAATATCGATTATCGATTGCCAATAGGAGC
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:413b84d1494f
|
40 | — | — | — |
|
AGTAATTAAAAACCCATTAACTGTGTTGTTGAGTGAAAAC
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:c6eccbc435ea
|
40 | — | — | — |
|
CGTGCGATTGATTACTGACAGTAAGGCAATTAAAAAGCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:f6ee409268b8
|
40 | — | — | — |
|
TGACTGATGAGCAGGTAATCGATAATTAATTGTCCCTCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:3166891286f2
|
40 | — | — | — |
|
TACCAATCGATAATCGATTAGCAACGATGTCCTACCGACA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:e7ef540737e4
|
40 | — | — | — |
|
GCTAATTAAATAGCAATTAGGATAGTTCGATCTATCGTAG
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:6b17e8e54531
|
40 | — | — | — |
|
ATATGCACGCAACTGAGCGTAATTAAAAAACGATTAGCTG
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:2d4f391464dc
|
40 | — | — | — |
|
CTTTAATTGCTATTTAATTACTTCTCCCCACCAACACACG
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:1f6d7e843588
|
40 | — | — | — |
|
CCGGTAATTAAAATGTCATTAGTGACATTATCGGCACCAT
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:f30105405886
|
40 | — | — | — |
|
TGATTACAACACTAATTAAATATCGATTACCGATTTGGCC
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:5dc7eca5bd46
|
40 | — | — | — |
|
CGATACGTTCTGACGATGTCTCATTAAAAAGTAATTAAGC
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:a2da097f92c3
|
40 | — | — | — |
|
CGCTGCAATTAAAAAGCAATTAAGAATGAAGACGCGCCAG
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:91a8d10f0ebc
|
40 | — | — | — |
|
CCGTTTGTTAATTGCTATTTAATGATGTGCATTCATCATA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:a95daef0e7b5
|
40 | — | — | — |
|
ATTTTACATTGCAGCCGTGTAATTAAAAAGCCATTAGTGC
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:d0e78f1041b2
|
40 | — | — | — |
|
CTGAGCAATTAAAAACACATTAACAGCGAAGCACCTGAGA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:3ecf71f21b93
|
40 | — | — | — |
|
GGGTATCGAAAACATATCGATAATTAATAATCGATACCCT
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:2b6f70e99b00
|
40 | — | — | — |
|
TTGAGTCATTAATTACCCATTAACTAGGGAAGTAGATCAT
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:77686cf69240
|
40 | — | — | — |
|
ACCATAATGGCCAGTGTTAATCGATAAATAATGGGGTCTA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:32f6e26b2316
|
40 | — | — | — |
|
ATGATGACTCATCGATCAATTATCGATCAGCGTGTCTGCA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:f5b4f31801b7
|
40 | — | — | — |
|
GAAACATGTAATTAATTACCGATTAACGATATCGCATAAT
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:143ef80b7371
|
40 | — | — | — |
|
CATCGCTAATGCGAAATTGATGACCTATGTTAGGACGACG
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:d4718459bd90
|
40 | — | — | — |
|
CGGTTGCTGATCGATAGTAATCGATTATGTATCGGCACCC
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:b7a8c1c5fa06
|
40 | — | — | — |
|
GCTGACTAATTAAAAAACGATTAACGCTACGCGTTACCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:befa6d0bdb19
|
40 | — | — | — |
|
ATAACCATTATCAGCATCACTCATTAAAAAGCAATCAACG
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:735c5fca06e5
|
40 | — | — | — |
|
TCTTGTCCACCAGTTAATGGGATATTAATGACTTTCCTGC
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:8a27d5bae92e
|
40 | — | — | — |
|
ATCATAACCGATAATTGATCATTGATTAGGTCAACACGCA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:f1921a14c15f
|
40 | — | — | — |
|
GACCTGCGCTGGTAATTAAATATCAATTAGGCGAAATATG
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:2d301abbd726
|
40 | — | — | — |
|
AGCCGCTAATGGCGATTTAATGACCAAGCTGTGACGCCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:225f55ceb213
|
40 | — | — | — |
|
AAAGGAATGATCGTCTGCATAATTGGTTATTGATTACCTA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:9ed848ea6b3a
|
40 | — | — | — |
|
TTAGCACCGCGTAAAAAATGATGAGGTAATCAATAACCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:711da2522a37
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final