CUX1_POU2F2
CAP-SELEX sample CUX1_POU2F2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TTAACAGATCAATACCATGCTAATAAGAGCGGGCTGATTT
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:2266d04b8da3
|
40 | — | — | — |
|
CCCAATGGTAATCGATTATGCAAATTAGACATTGACTTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:e21f2d4806a5
|
40 | — | — | — |
|
ACCAAACGAAGCAATTAAGCTTCCCGTTCGCTATTATCAT
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:d12ef01a6b1e
|
40 | — | — | — |
|
AATCACAAAACTTATAAGTAGCCTATTCTAATACAACCCT
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:f06c4766e46d
|
40 | — | — | — |
|
TAAGTCCGTCTACTCGAATGCATGTCGCAGGGTTCCTTAT
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:2cdd20d8ad49
|
40 | — | — | — |
|
AACCAATAGATCGATTATGCAAATTAACCAACATTGCCGC
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:a97103a1dfcb
|
40 | — | — | — |
|
ATCACATGGATCAATATTGCTAATTTGCATATTGGTTTGG
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:becc556919bf
|
40 | — | — | — |
|
TTATGGTAAACTCATTTGCATAATCGATCAGTACACGCTG
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:753b5be6c953
|
40 | — | — | — |
|
TTGATTATGCTAATTAGGTAAGGTATGTACGTTCGAATAT
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:8f64d6af8743
|
40 | — | — | — |
|
TTGATTATGCAAATGATCATTGGCTAGCGTCAATAGCGGA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:29d4af5a9858
|
40 | — | — | — |
|
ATTACCGATGGCGGCGAAGAAGTAAATATTTAAAATCGTA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:0390cca8f9f8
|
40 | — | — | — |
|
TGGCGCGACCCCGACGCACGCAAATGCCCAGATTAACCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:e62b1430c39b
|
40 | — | — | — |
|
TGTTGAACAATATGCAAATGAGATGCAAATCTTCAGCTTG
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:e7eae3863c23
|
40 | — | — | — |
|
ATATTCTGATCATCTAATTTGCATATTCAACACGTTGGTG
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:a366f907f52c
|
40 | — | — | — |
|
AAATCGATCCATACTGTCTGAGCCTAATTTACATAATCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:b668e1a10d7e
|
40 | — | — | — |
|
GATATGCAAATGAGTATTCGTGACGCGCATATCGATTAGG
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:18f34cc82074
|
40 | — | — | — |
|
TCCTGTGCCCGCACATACAACCTTGCGCGCGCATAATTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:f1e9104c7324
|
40 | — | — | — |
|
TCGTATGCGGGTGATATGCAAATCATATGCAAATACGGTG
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:6baa51a98e8f
|
40 | — | — | — |
|
TATCGATATGCCTATTAGCTATGCAAATTACGCACACTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:8e1eafdff5fd
|
40 | — | — | — |
|
CGATATGCAAATCAGCAGATCGATAATAACTCTCATTCGC
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:04662fe70e88
|
40 | — | — | — |
|
TTAATACATGAAGTTATCGGTAACGACCCTAATTTGCATA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:6c9ce0a10e04
|
40 | — | — | — |
|
ATAAACTAGTGAGGATCGATACAGTATGCTAATTAGTTGT
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:03ba1c4d9e06
|
40 | — | — | — |
|
AATAGTATGCAAATGAGCGACAGATCAATATGGCGATTCA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:8a556fdb6521
|
40 | — | — | — |
|
AGGAGGTATTAAAGGCTAATTTGCATAAATAATCGATGGA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:df459e073683
|
40 | — | — | — |
|
TATGCAAATTAGATGAAATGTCATGTATGATCGATAAACA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:f4a839091afd
|
40 | — | — | — |
|
ATATGAAGTGATCGATTAGAACGTAATTTGCATAACAGTA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:70da41d1f203
|
40 | — | — | — |
|
TCGATCACCATATCGAATATGCAAATGACTGACCCTAATT
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:eaf6b489c6d5
|
40 | — | — | — |
|
TTTGCATGCCACTTCATTGATTAGGCAAGTCGATACGAAG
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:f5e6f98811eb
|
40 | — | — | — |
|
GGGTCATTAGCATATCGATTTCCCCAATGACCGTAATTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:4a71ab64ea58
|
40 | — | — | — |
|
TGGATGACTTGCATGCGTCGCAGCTCATTTGCATAATATA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:81c9fc4e32c5
|
40 | — | — | — |
|
ATGCATATCGATAATGGTTATATGCAAATTAACGAACTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:0002d89fac08
|
40 | — | — | — |
|
CATCGATTTGCATATTGATCACAATCAGCGATATCATTAG
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:874784bcf4f2
|
40 | — | — | — |
|
ATTATGCAGATTTATGCGGTTATGCAAATGAACGAAACAT
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:a0bdaea927b7
|
40 | — | — | — |
|
TATCGATTAACATATACCTAATTTGCATAAAACCGTGAGC
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:6694d8899fce
|
40 | — | — | — |
|
ACTCATTTGCATACTAGCCATGACGCATTGTGGTAATCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:62e534c9e590
|
40 | — | — | — |
|
AAAACGCCCATGAATTAGCATATCATTAGCATAACTGCCA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:ddbffbfe90cc
|
40 | — | — | — |
|
TTGGGTAATCAATAATATGCAAATCAAACATGATGCATTA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:eb7ce797776b
|
40 | — | — | — |
|
CCTAATTTGCATATGTATGAGATGATTACAACTTAGCGTT
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:8bd7244fc8a6
|
40 | — | — | — |
|
TCGATGAACAGCAATCTGGTTATGCAAATTAGGCATTACC
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:cef7acb43770
|
40 | — | — | — |
|
ACCTCACATCGTCCTTATTGGCCCAAATTTGCATAATCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:1d9ddf00f0da
|
40 | — | — | — |
|
AGGCGTATGTTGCGCGGCCATGGCTCATTAGCATAATCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:563fede37258
|
40 | — | — | — |
|
CGCCATCTTAGGCAGGGGCGTAATTTGCATAATCGATAAT
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:018293713076
|
40 | — | — | — |
|
CATTTCCGATAATATGCAAATTAGCTGAATCGTATGCACA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:dcfe98aa3a30
|
40 | — | — | — |
|
GCGTTATGCATAAATCTGCATATGCAAATCAGAACACAAA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:29d0b83e520d
|
40 | — | — | — |
|
TGCCCTAAGTGATGATCAATTATGCAAATTAGGATTGGAG
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:1a9b66a285be
|
40 | — | — | — |
|
GCTTAATTTGCATAATTAATGGTATTGGATCCATTGACGA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:3e091c2a87db
|
40 | — | — | — |
|
TTGGAAGTGCAGTATATTGATGAGTAGGTCATTTGCATAA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:0b2b9746d8ee
|
40 | — | — | — |
|
TTAATCGATACCATAGTTCGCACAAGTTATGCAAATGACG
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:3f3386220ee0
|
40 | — | — | — |
|
GATCCGATCGATTATGCAAATTTTATCGAAACAGCAGCCA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:f425cc3bbf18
|
40 | — | — | — |
|
TGATCAATGCCTGAGCTTAATTTGCATAATTTCTGCTCCA
PANAPTA:P39880:CUX1_POU2F2:PRJEB66722:R3:8ec87704105a
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final