CUX1_TFAP4
CAP-SELEX sample TFAP4_CUX1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CAACCCAGCTGTTCTCGTTGGACCAGCTGTTCACCAGCGT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:9c85a818966a
|
40 | — | — | — |
|
AGCAGCAGCTGATCGCAGGCTGAATCAGCTGAGTGATTAG
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:73fb53cb7bb0
|
40 | — | — | — |
|
CGTGTCAGCTGATGATTGCATCAGCTGTGGGCTCACCGTT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:14259b1f91aa
|
40 | — | — | — |
|
CACACGTGATCACTATCGATCAGCTGTGCCTCAGCTGCTT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:0ebae71ca85e
|
40 | — | — | — |
|
GCAGCTGTTTTGCGCGCAGGCGAACAGCTGACCGCCACTG
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:5e8f4722adcb
|
40 | — | — | — |
|
TCAGCTGTTCAGGCCGGTAGTCAACGCACACAGCTGATAG
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:0c65b76e204e
|
40 | — | — | — |
|
CAGCTGTGAAAAGCAGCTGCACTGCAACATGCGATATAGT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:c6c25a869c9b
|
40 | — | — | — |
|
CAGCTGTTGCCCACAGCTGTAGCAGATCACGACAAGGCTG
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:c3e7bdba654f
|
40 | — | — | — |
|
ACCGCCCCTTTGCAGCTGCTGAACAGCTGACCACCTACCA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:47e2fa3edc16
|
40 | — | — | — |
|
CCTGCTGATGATCTAACAGCTGTACACGCTAGTACAGCTG
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:04ff47f001e7
|
40 | — | — | — |
|
TCCCACGCCCATATCACACCACTACCCCCTTCCACCGAAC
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:2b5d5e2bcf32
|
40 | — | — | — |
|
GGTCTACAGCTGACTTTACATCAGCTGATCCGTCACGCTA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:f07f5d68d53d
|
40 | — | — | — |
|
GGCGCCGACGGCTGCCGCATCATATGTGTGAACAGCTGTG
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:f5adfa76b4ec
|
40 | — | — | — |
|
CACAGCTGATCCGAACAGCTGTCCAGTGCGTCCGTCCCTC
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:3fa82894c6be
|
40 | — | — | — |
|
CCCACCTGTCTCGCCAGCTGAGCCTCACCTGCGCACTCAT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:231b0d4213e6
|
40 | — | — | — |
|
GCAATCGAACATATGGTTTGTGCCAATACGATCATCTGAT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:57e9088594f0
|
40 | — | — | — |
|
ATCCCCACGCACAGCTGACTACGTGGTGTAAGCAGCTGGA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:3e58d852b78b
|
40 | — | — | — |
|
CAGCTGCGCAACAGCTGCACTGTGCTCATAATCGCATGCT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:9aca63c380f2
|
40 | — | — | — |
|
CAACAGCTGACCCAGTATCACGGCGCAACAGCTGTCCTGT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:1000584f3bb7
|
40 | — | — | — |
|
CGTGCCCCAGCTGTTCCGAAGACATTCGTAACAGCTGATA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:6d449d289c4c
|
40 | — | — | — |
|
ATGCTACATCAGCTGTACGCCATGCAACACATGTTCTGAT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:a27371dd6e34
|
40 | — | — | — |
|
GAGGCACACCGTTTAGTCGCAGCTGACTAGCAGCTGTTCA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:d89478159993
|
40 | — | — | — |
|
CAGCTGAGCCACATGTGTTGCAAGCCACGCGCAGCTGCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:5a24fad6eeec
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCCACGTCGCAGCTGTCTCATCAGCTGCTGCGCCGCA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:5a1771826c0c
|
40 | — | — | — |
|
CGTCAGCTGGTACCTCACAGTCCAGCTGATTAGCCGGGTA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:8ab46fa8208b
|
40 | — | — | — |
|
CTGCATTGCCCAGCTGTTGGCCAGCTGATGCCAGCGATAA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:53b58f2d99e8
|
40 | — | — | — |
|
GTCAGCTGACGTCGATAATGTCGCAACCATCAGCTGATCG
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:d936cbc77c78
|
40 | — | — | — |
|
CAATCGTAACTCGATCAGCTGATATCGCCTCAACGTTAAT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:2f215d9afb2b
|
40 | — | — | — |
|
TAGCGGTAACACCAGTCAGCTGCGTGACAGCTGCACGTTA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:ff7b7cf63bff
|
40 | — | — | — |
|
ACAGCTGTGCGTAACCTGGGTCAGCTGACTCCCCAACCTG
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:c8603ac5051a
|
40 | — | — | — |
|
TTAGCTCTCAAGACGTGCCCAGCTGTCACCCCAGCTGATG
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:764d559e661a
|
40 | — | — | — |
|
AACAGCTGACCAACAACGCACACAGCTGTGCCTTCCTCAC
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:0daee481dbf4
|
40 | — | — | — |
|
TGCCGAACAGCTGGATCGCACATGTTCGATATCTGCGCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:d30b790b5b38
|
40 | — | — | — |
|
ACCGACACACAACAGCTGCACATGGTACCACAGCTGATGG
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:2521b67867df
|
40 | — | — | — |
|
TTGAGCACAGTTAAGCCACTTTCAGCTGTCCACCAGCTGT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:22bef90ba249
|
40 | — | — | — |
|
CTACAATCAGCTGCTAGACTACGTCACAGCTGCTCTAGCA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:d652c7596e15
|
40 | — | — | — |
|
TCAACAGCTGAACATCACTGCCAGCTGATGCCTGCTGCCA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:6e1e1cc0f5a4
|
40 | — | — | — |
|
TGTTCAGCTGTTCCGCCTATGGAAACAGCTGATTGCAATA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:fca55773b12f
|
40 | — | — | — |
|
CCGCATCACTCACAAGTACAGCTGACTAGTCAGCTGTTGG
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:6b186856a752
|
40 | — | — | — |
|
TACAACGGAAACTCAGCTGCAACTCAGCTGTCGTCTCAAC
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:f621a6ae1009
|
40 | — | — | — |
|
TCGTCTAAGCCAGCTGTCATTAGCTTCGTTACAGCTGTTC
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:834d153f566a
|
40 | — | — | — |
|
GCTCCACGGCAGCTGTTACGTTCCAATCAGCTGTACACTA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:ba2bfe4b599c
|
40 | — | — | — |
|
TGAGCGCAGCTGACGTGATCACCTGTTCTAAGCCCTCCCT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:b83c1aba27b4
|
40 | — | — | — |
|
GTGATGGACTTACACATCCAGTCAGCTGATTCCCAGCCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:2ae5c0adc021
|
40 | — | — | — |
|
ACACCCGTACGCCAGCTGACGTCCACACGCGTCAGCTGAT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:3508442b864e
|
40 | — | — | — |
|
CACTTGATCAGCTGATTTGCCCTACATGGCACACCCATGT
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:fc8e211702e4
|
40 | — | — | — |
|
GCTATCAGCTGATCGCTACGACACCTGGTTCCCACTGCGC
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:561284aea349
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCTCACCCAAGCCGACCATATGACCAATCAGGTGACA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:0af226900078
|
40 | — | — | — |
|
CAGCTGTCAGGTCTCCGCCCTCACCTCTCCACACAGCTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:b11d51f9ad4e
|
40 | — | — | — |
|
TACACAGCTGACTCGCACATGACATCATGATCAGTCGTTA
PANAPTA:P39880:CUX1_TFAP4:PRJEB66722:R3:d35a43887759
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final