CUX1_USF1
CAP-SELEX sample CUX1_USF1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GATCGAAATGAGTGAACACGTAGCGCCGCTAAGTTATTAC
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:360ffc86eae8
|
40 | — | — | — |
|
TCGATGTTGAAATCACTATTAATATTCGATAGACCAGTTC
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:716bc3af37c1
|
40 | — | — | — |
|
GCTTAACACGTACCCTAGTAGGGAATAGCTAAATAACCCA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:4b7c958368ca
|
40 | — | — | — |
|
GTACCAGTCAAGTTTCGGTAAGGCCACTCAACTTGCAATT
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:508ce6410d80
|
40 | — | — | — |
|
GAGAAGGATGGCTGCGGTAGTCCGCAACGAGCCTCAGAAA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:c0614052d2b4
|
40 | — | — | — |
|
TATCGATCCCAGTGACATTATCGATCACGTGATTGCCTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:ffe0046a5ed8
|
40 | — | — | — |
|
TGCACGACAGCATCGATCACCGCAATGCTAACCTGATCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:aeff8dec4ace
|
40 | — | — | — |
|
TGTTTACAGCCATTGATTACGTGATCGATCACCGATTGAT
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:402ecaa0e289
|
40 | — | — | — |
|
GTTGATCAATAACGCGATAGATCGATTATTGATCAACGGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:8fba74af73d8
|
40 | — | — | — |
|
GCTGGTAATCAATAACGACTTATTGATCACGAATCGCATG
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:ea27fb329108
|
40 | — | — | — |
|
CATGTTCATTGATTAGTATCGGCAAACCTAGCGACATGCA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:a149b0b1c291
|
40 | — | — | — |
|
GTAATGTATTGATTAGGCTACGACGGCTAATCGATACAAG
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:32356b935664
|
40 | — | — | — |
|
CAGCGTACAATCGATCATGATCAATACATGCTGTCGTCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:8f407a2f6703
|
40 | — | — | — |
|
TACCGACTTATCGATCACTAGCTGATCGATAAGGTCCTAA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:f8119f15f48b
|
40 | — | — | — |
|
ACGATCGATACATGGACATAATCGATAAGTATCGGCAAAC
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:a7b71b742207
|
40 | — | — | — |
|
GCTAACATCAGGACGCGGATGTATTGATCCTTATTGGCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:9a1dbca6e629
|
40 | — | — | — |
|
CTCACGACACCTATTGATGAATTATCGATACCGATCCACG
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:bf3e5a376ecf
|
40 | — | — | — |
|
GTTAATGATCACCCAAAGTGTTTGGATCAATAACAACCGT
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:1a946109f538
|
40 | — | — | — |
|
CACGTATTGATGGATTATCGGAACCTGTAGTCCATCGTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:412d4ae592eb
|
40 | — | — | — |
|
TAGATTCATTGATATGGCGAAGACATATCGATGACACTGC
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:2ffdca53142a
|
40 | — | — | — |
|
CGCTCCGACGTGCATGCCGATACATATTGATTACCCCCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:b5657fe05a4c
|
40 | — | — | — |
|
CGCAACAAATAGCGTAATCAATAAGTATAGGCACTTACGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:6f02f26d511d
|
40 | — | — | — |
|
GGCAATCAATAATCATTGATTACGATATGAGCACGCATGT
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:eea69f2bc428
|
40 | — | — | — |
|
AGTAATCAATAGCATCATCGATCTGTAACTCACGTCTCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:3be680fd1834
|
40 | — | — | — |
|
TGAATGTATTGATTACGTATCGGCAAGGGAGATTAGCATC
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:435eaf3dea00
|
40 | — | — | — |
|
TGGCAGTTATCGATTACGTATCGGAAGAAGCGGCCTGACA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:ef0236dad71f
|
40 | — | — | — |
|
TCGATCACGCTGACGTAATCCATACACATGTACCTATTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:d65c20a2d97c
|
40 | — | — | — |
|
GCGGATGGTAATCAATCGCACATATTGACGACCGTATTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:bd6348f22679
|
40 | — | — | — |
|
AGTCGAGGATGATCAATACGTTGCGTGCCGTATCGATCAC
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:e2c2ece89f95
|
40 | — | — | — |
|
CCGCAACGACAATTGATTGATCGTTATCGGTGACGATCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:5cdc7f024205
|
40 | — | — | — |
|
CCGCAAAATCGATCGTACGGGCGGTGATCGATCAATGCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:2561193903c8
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTAATCAATAACACCAGCAATCGACACGTGATCACAA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:6f04dbe7f6b2
|
40 | — | — | — |
|
CGATGGCTTGGATCGATGCCACGTGCGTATTGATTATTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:ee06554f7fb3
|
40 | — | — | — |
|
TGATCGATAGTGATGATCGATTATCGATTAGTGCGCGCCA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:691e137adece
|
40 | — | — | — |
|
GCACGTGACCCAGGTTGTCACGTGGCCCCAAGCGCGCCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:9fd38a35a2db
|
40 | — | — | — |
|
CATCGATTAATCGATCGCAAACTAATTGCAGATTGATTAA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:db3fd29abcf9
|
40 | — | — | — |
|
ATAACGACTTGATTAAAGTGATCGATTAGCGACCTATCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:5fd1965ba520
|
40 | — | — | — |
|
CGCTGTGCCAATGCGATACATAATCAATAGCTACCATTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:206acc6b69b1
|
40 | — | — | — |
|
TTGATTATTGATCAGTGCACCAAACGAGCACCATCTCCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:86fb3f9b7f5a
|
40 | — | — | — |
|
AGGGCACGAAGACGTTAGTATCGATTATGTATCGATCAGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:0be05eb43b2b
|
40 | — | — | — |
|
TTGGATCGAGTGATAGCCTTATCGATTATCGATCACGTGC
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:14f62cf31284
|
40 | — | — | — |
|
CCACGTCTTACGTGATCAATATCCTGATCAATAGGGTAGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:7f47c3e7b0ea
|
40 | — | — | — |
|
CTGCGATCTCATCCTCTATAGTGATCGATTAGTTGATTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:06554985201d
|
40 | — | — | — |
|
GATTCATCCCGTATTGATCGTCGGGGTGATCGATACTGTA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:c32ab4771844
|
40 | — | — | — |
|
TGCTACCCTAATCGATACTTGCAATCGATAACCGAATCAA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:0e81cbfee41d
|
40 | — | — | — |
|
ACCAAGGTGATAGCTGATCGATTATCGATCATGTGCCTTC
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:04dac6ab402b
|
40 | — | — | — |
|
GAGTGATGTAATCAATAACATGTACCAAGTTTATTGGCGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:3e62ce410c14
|
40 | — | — | — |
|
CTGATCGATAGCGGATATCAGGACTATCGATCAAGGGCTA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:c7ada82f7a6e
|
40 | — | — | — |
|
TGCACCAATACATAATCAATATCGATCATTGCATGCTTGA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:2304d5d99b2a
|
40 | — | — | — |
|
CGACGTACGATAGCCTAATCAATAGTAAATCATCGCCACA
PANAPTA:P39880:CUX1_USF1:PRJEB66722:R3:acba498c0021
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final