EGR1_ELK3
CAP-SELEX sample EGR1_ELK3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TATATCGAAAACCGTAACTTCCAGTTCCGGTAGGTCGAAC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:0680e8fc107c
|
40 | — | — | — |
|
ATGGCCGTAAGTTTCACTTCCGGTCCGCACGCGAATCTGA
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:736a96c0ce3b
|
40 | — | — | — |
|
TCTGCCGCTAAACATCCCGTAAACAAATGCTTCCGGTATG
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:0ce1041c0cb5
|
40 | — | — | — |
|
AATTGTCCGTAAGTACGCGTGAAACAGGCACATCCGGACC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:075274b5d24d
|
40 | — | — | — |
|
CGCCCTGACAGTAAGCTATTGCAGCGTCCGGTCATGATAG
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:965f2e6f44ab
|
40 | — | — | — |
|
ATCGAACCGTAAACACCTCACAGTTTCCGGTTTCGTGGGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:8e14575c6e58
|
40 | — | — | — |
|
CGGCATAACCGTAAGCTCGCGTCCGGTTAGAAGCACAGAA
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:c0a0af9ee07b
|
40 | — | — | — |
|
ATACCTAGTGTACCGTAAGTTGAACTACTTCCGGTACACC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:cc0148be2bdf
|
40 | — | — | — |
|
TGACTAAACGGTATCCGTAAGTTACACTTCCGGCGCACCT
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:9f5a7ca1332a
|
40 | — | — | — |
|
ACGCCCACGCATTCACAACTTCCGGTCACATCCAACCCAT
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:dbf630ae91ac
|
40 | — | — | — |
|
AGAACCGGAAGTGCAACCGGAAGTGGACTCGCCCGCTAGA
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:17b0882e7e48
|
40 | — | — | — |
|
CACCCGACATTACCGTAAGTGGCGCAAACTTCCGGTAACT
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:f4ac9d835e51
|
40 | — | — | — |
|
CGAGATCTTTTTCAACCGTAAATAGTATTTCCGGTCGCGA
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:5f496445732e
|
40 | — | — | — |
|
ACGATCGCACATGCGTAAGTGAACTTCCGGTCACGGATGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:555132a1b2c4
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCCTACTTCCGGCACAACGCCCACGCGTCACGTGCAC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:52d6a81a6823
|
40 | — | — | — |
|
ATGCCTCGCATAAAATTGCCGTAAGTTCGTGACTGCCGGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:7b6b5fbd10d6
|
40 | — | — | — |
|
GTTCGACGAAGTAAATGCCATTTCCGTCGTCGCCGTACTT
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:75a8c2cb8341
|
40 | — | — | — |
|
TGCCTGCTAAAGGGGCCACAGTAACTAGTGAGTTCCGGTG
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:e2c8eeeca83a
|
40 | — | — | — |
|
GCATGCCGCCATCCGTAAGTCTTGACTTCCGGATCCGGCT
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:8eaf9074d102
|
40 | — | — | — |
|
CAGAATCGGGTTCTACTTCCGGTACTACGTGCAGTAAGTG
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:be56e9b3c307
|
40 | — | — | — |
|
CATAGTCAACGTGAGTTCCGGGTAACCACGTAACAACACT
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:b081f88a279d
|
40 | — | — | — |
|
CGCACACGCCTCCTCCCCGAACGTAAGCGACGCTTCCGCT
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:bffd9ace52e8
|
40 | — | — | — |
|
CACGCCCACGCGTTGCCTTACTTCCGGTGCATTACGACGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:9763ef1baf51
|
40 | — | — | — |
|
GGTCCGTAACCTACTGTTGACGGTTCCGGCCGCCGTGACC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:fde1de6f50dc
|
40 | — | — | — |
|
GAACGTAAGTTTACGCACGTAGACTTCCGCTCAGTCCGCG
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:718fed97a087
|
40 | — | — | — |
|
TTAAGATCACCGTAAGACTGGTCTGCCGGTGAAATCAGTG
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:fc8c00d68fae
|
40 | — | — | — |
|
TCATTGGCGACTATCACACGTAAGCTTGCTTCCGGTACTT
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:25d2432d2715
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCGATAAGTTTCACTATGTGACTTCCGGCTAGTACCC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:0adc18345c8d
|
40 | — | — | — |
|
CGGCCTATACTTCCGGTGCCGCACCACCCACGCATACTGG
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:b69131be6572
|
40 | — | — | — |
|
AATATCGAACGTAAGTGACACATCCGTCCAGATACCCACC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:e9767f8c73b0
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCATCCGGTGCCTCATCGGGAACACAGTATGCGACAC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:2665327f1a04
|
40 | — | — | — |
|
CTCACTTCCGGTACCATCTTGATCCAACTGTACCGTAAGT
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:2016d83126b9
|
40 | — | — | — |
|
GCCTTCGATTGCCCGCTCCGCCCACGCATTTCCGCCTGGT
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:e6aed7f7007c
|
40 | — | — | — |
|
TCACTTCGGCGTAAGTTGGAACGTCCGCCGACTCCTGTAT
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:b44d468563f5
|
40 | — | — | — |
|
TCCGTTTCTGCTTACCGTTAACCCCAGTTCCGGTATGGTA
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:4d3010fedf8b
|
40 | — | — | — |
|
GGTTCCCGTAAGTATACTTCCGGGGCCACCAAGTATACCT
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:5be2e1ca153b
|
40 | — | — | — |
|
TCCGCATCCACCCACGCACTTCCGGTGCACCCCCCCGTCA
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:889a15ecaa77
|
40 | — | — | — |
|
CGATGCAGAAACTTCCGGCACAGCCCGAAGTTGGCCACGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:7e7b7519d5f3
|
40 | — | — | — |
|
CACCGTAAGCTCTCACGCTTCCGGTTCCGGCCCACGAGCG
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:48deab287e61
|
40 | — | — | — |
|
TGACGCTCCTTTTCCTGCCGTAAATCGTGACTTCCGGCTC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:262fe40d90ab
|
40 | — | — | — |
|
GCCTGTACACCGTATGTCTTCATTCTACATCCGGCTAAGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:b117a365b06d
|
40 | — | — | — |
|
CGCATCTTCCCGTAAATACAATTTCCGGCACTCTGTGGGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:8dbc9332ce17
|
40 | — | — | — |
|
TTACCCCCACGAATCCGTAAGTACTTACCTCCGGCTTCCT
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:411eade0cdd5
|
40 | — | — | — |
|
GCTACGTCCCGCCCACGCTTCCGGTCTAACGCCCCACCAC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:f95ac1cebc8d
|
40 | — | — | — |
|
GCAAGACTCTAACCGATAAGCAAGCTGCCGGTTTTTGCCG
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:2a90663812e5
|
40 | — | — | — |
|
AGACATCCAGACGTAAGTACACGAGCATCGCACTTCCGCC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:0ba207af5111
|
40 | — | — | — |
|
CCCGTCCGTAAGTCCAAACATCCGGACGTCCACTTCGTTC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:6d87cbfa20b2
|
40 | — | — | — |
|
ACGCCCACGCACAACATTACTTCCGGACGTAGCACGCGAC
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:6aff90fd4852
|
40 | — | — | — |
|
ACCAACAGACGTAAGTGCTGGACTTGAGCCATCACATCCG
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:8c43d351a71b
|
40 | — | — | — |
|
GTACCAAATGCACCGTAACCATCAGTTCCGGCTTATCTCA
PANAPTA:P18146:EGR1_ELK3:PRJEB66722:R3:fd54a7f01c5e
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final