EGR1_ERG
CAP-SELEX sample EGR1_ERG · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TCAGAAGGATCGTATATCGATATGTCGGATCGATAACATG
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:afdf7039cecf
|
40 | — | — | — |
|
TCGATAATGGCTAATCGATTACTAGTCTTGTAGGGCGCAC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:48a30c3b927e
|
40 | — | — | — |
|
GATCCGGTATAGATTATCGATTACGCCATTTATTATGCAC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:8c99bc2eaaf7
|
40 | — | — | — |
|
TGTGATCGATACTATCGATTGACCATTGTCGTCCCGTTGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:55599cc26000
|
40 | — | — | — |
|
TTATCAGCTTAAGTAACCCGCGTTTCTACGCAGCTAGCGT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:01dcbb566041
|
40 | — | — | — |
|
TAAGTAGGATACCCCGCAGTTATCGATTTCCAATACCGAT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:ea66d9a4ff92
|
40 | — | — | — |
|
CCAGCGTGTGAAATAGTACGTTGACCCCCTTCCAACCCTC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:577e891e692e
|
40 | — | — | — |
|
TACATCAGCGTATATCCGGGCAATCCGGTATATCCGCCGG
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:735b06bf3d62
|
40 | — | — | — |
|
GCACTGTGACATCATATTGAAGACACCCAAGTCATACGCA
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:e1605e975878
|
40 | — | — | — |
|
TCTGCTCATCATTGCATTGCTTCGAATTATCGATTAGCAT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:ccfb0aa3c171
|
40 | — | — | — |
|
GCGCACTTACTTCCTGTTTACGCAGGCCGGAAGTGCGCTC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:6387a663ce12
|
40 | — | — | — |
|
CTAGTACTTCGATCGATTACCCGATTTAATCGATTCCCAT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:9d38fdf70a6e
|
40 | — | — | — |
|
AGTAGGTGCTACCAGTTGTGCACCTAAGATTAGTAGATGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:fe737d033fc9
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAAGGAAGTGGGAACTTACTTTCGGTTAGCGCGCGTA
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:d8411f59753b
|
40 | — | — | — |
|
TCGATAATCCGGTCCCTTTCGCGATTTTCTTTATGACTGT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:b5c25609bf36
|
40 | — | — | — |
|
GCAATAAACGACATCATAATAACCCGTGATAACATCATTA
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:22c240443d5b
|
40 | — | — | — |
|
TGATAAGATGCCGTATATCCGATGTGCAAGTATATCCGGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:5e23248562b2
|
40 | — | — | — |
|
GACCGTAAATCCGATAAAGCGTATTTCCGGCTCTGTGTGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:2bd7960b5e72
|
40 | — | — | — |
|
CAATTGTTCACCAGCCTGCCCTAACTAATCGATACGAAAA
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:566d10557550
|
40 | — | — | — |
|
AGACCCTTGACGATCGATATACCATACATTATTTTCTAAC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:5b6dcc2b12d7
|
40 | — | — | — |
|
CTGAACGGAAACGGGTTTCCGTTAGTTGCAGCGTGGCGGA
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:6460f0fcf029
|
40 | — | — | — |
|
ATATGCTGTCTAGCGTCACCAAAAACGTAGTCATTAGGTG
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:873a70df6c04
|
40 | — | — | — |
|
GCACTCAAACACTGCAGCGACCGCACAACTACGCACCGGG
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:c635fd012101
|
40 | — | — | — |
|
TTGCCCGTAAACGCATTTCGCGTTGCCGGTCAGCATAGTG
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:a0ec32be8871
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAAGTAAGCACTTCCGGTTTCGCACATAGAGCTGCAT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:3c84a0e3de91
|
40 | — | — | — |
|
ACAGTATCATGAATACACCGTATTGCTTCTAGACCACCTT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:9b78b9c7655d
|
40 | — | — | — |
|
GGACTAACCGGAAGTCAACTTCCGGCTAGGCCCACGCTAC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:6726d7dcc666
|
40 | — | — | — |
|
CGTTCCGATTGGCATCGATTTCTATCCACGGACACCTCGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:b174e4831b54
|
40 | — | — | — |
|
TTAGTTCCCCGCTAAAATGATACCGGAAATTTGATGTAAT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:3f064ae987ca
|
40 | — | — | — |
|
CGATGTAATAATGTAGGTTATTAAGATGCATCATGATGTC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:796fb82f0418
|
40 | — | — | — |
|
CCGTATTGGCGGCCACACCAATATCGACTTTACGTGCAAT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:27e258140f30
|
40 | — | — | — |
|
TATCAGCCAATTTACTCCTTCTCACAAAGCAATCAATGCC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:f0413cd730a2
|
40 | — | — | — |
|
CGTCCGATCGATATTGGAATTCGATGAAGGGTAGACCCAT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:e758b211b813
|
40 | — | — | — |
|
CTCCCGTAAGCCAGCTGCCGGTAGTCGATGCCCTTCAACA
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:aa2276b36000
|
40 | — | — | — |
|
TATTCCGGAAACATAACAGGAAGTACACTTCCTGTCCACT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:aca7df41427f
|
40 | — | — | — |
|
CTTAATTGCAATATGAAGGTCCAAAGGGTGTCCTATGCCT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:f7b6965e9a3b
|
40 | — | — | — |
|
GCACGATATCGATTTTCCGCCAATTACCCGTGAAATCTCA
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:b32d5993f800
|
40 | — | — | — |
|
GCATCGCCTGCTACACCGGAAGTGCGGCTACTTCCGGTGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:3d7f8991c614
|
40 | — | — | — |
|
TCGATTGCCAGATTTAGTGATATTGATCCACCTTTCCTTC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:fe3ebf3f0930
|
40 | — | — | — |
|
TCAATACTAAGCTAGCAGCAACGCAATCCAATAGCCTTTC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:6925cb8d9040
|
40 | — | — | — |
|
TTATCAGAAATCAATATTCCCCGTAAATATCGATTGTCGT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:e92306f5a9dc
|
40 | — | — | — |
|
AGGATCGTAAACGTAATTCGTTGAAATCCGCTTCCGCCTT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:2e5c40b3ed6d
|
40 | — | — | — |
|
TGTGGGATCAGTAAACGCGCTGACGCGTTTCCGGACGGCA
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:f91032f606d1
|
40 | — | — | — |
|
TTCGATGCATGACGATAATAAATAACATATGGAAATGAGA
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:4c1c59ecbf3e
|
40 | — | — | — |
|
CGTAAACCGGAAATCCATTTCCGGTTCACCTTGACCGTAT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:60e6bca639ce
|
40 | — | — | — |
|
GCGGTGTAAGTTATAATGAGCAATGAGGATGTAATTGATT
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:65ac541af371
|
40 | — | — | — |
|
ACCATGCGCCACATTACGTACCTAGTCTTCCTGCTCCTTC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:b45f163913ac
|
40 | — | — | — |
|
GGCCACCGATCATCTAAAGACACAGATCAATGGATAACGG
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:3975a27e3390
|
40 | — | — | — |
|
CACGATCCCGACACGATGACGGAGCTTACACACTTGGCGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:a870f025bc65
|
40 | — | — | — |
|
CACTTGCGTTGGATTAATAATGTAATTCTAACGAAAGTGC
PANAPTA:P18146:EGR1_ERG:PRJEB66722:R3:6906550fea0b
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final