EGR1_HOXA2
CAP-SELEX sample EGR1_HOXA2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CCGCCTTAACGACATTATAATTACCGCACACGCCCACGTC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:6ad4924a4c47
|
40 | — | — | — |
|
TACCACGCCCACGCATACAAACTAATCACTTGCTAATTAC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:ed45db378bd2
|
40 | — | — | — |
|
GCGCAGGCGTAGACCATTAACACCACCCACGCTAATTAGC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:ebce462e956f
|
40 | — | — | — |
|
CGATTGTAATTACCATACGCCCACGCACTTGCGGTATGCA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:29152db99e28
|
40 | — | — | — |
|
TACATAATGGCGCCAGTCGTACGCCCACGCTAATGACCCA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:fdbc1b6df1f8
|
40 | — | — | — |
|
TAACAAGACCCACGTTCATTACGCCCACGCCTATCATTAG
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:1234120df8d2
|
40 | — | — | — |
|
GATCCCTAATTACGCCCACGCATTTAACATGGTGGGCCGC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:6353507a73e3
|
40 | — | — | — |
|
GCGAAATTAATGAGTCTAACGCGACGCCCACGCACAAATC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:cacaafb5456e
|
40 | — | — | — |
|
CAATTAGCTTAGTGCCCTAATTACCCCGACCCCGCCCACG
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:736dd6712d3a
|
40 | — | — | — |
|
ACTAATTACGCCCACGCACCCACTAATCACAGCTAAATAC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:f4f7af6a69a4
|
40 | — | — | — |
|
TACGCCCACGCATCTGATCACTATTTAATTGAGTGCAACC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:9ffd2d237fb6
|
40 | — | — | — |
|
TGCCCTTTAATTACGCCCCGCCCACGCATCCTAGGGCCGC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:47b399d10290
|
40 | — | — | — |
|
TGCCTCATCTAAAACCACTTAACGCCCACGCAAGCGTTAT
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:3ab90ba30fa3
|
40 | — | — | — |
|
TACCTTACTAATTGATCATTCGCCCTCCCGCCCACGCGTG
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:7c073944cccc
|
40 | — | — | — |
|
TACTGCAATTACGCCCACGCTAATATTCTCCCATTCCGCA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:b467d769e4db
|
40 | — | — | — |
|
TAGCGTCCATTAGGGTCACGAACCTAACGCCCACGCAGTC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:9b8051a4f785
|
40 | — | — | — |
|
GGTTTGCCATAATGACTGCAATTATCGCACACCGCCCACG
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:a41d688adf56
|
40 | — | — | — |
|
TACCCTCATTATCTACCCGCCCACGCACTTCTGCCCGGGC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:69f27a811aa9
|
40 | — | — | — |
|
ACGCCTACGCATTTAATTACGCTTTAATGGGGGCCGCATA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:dc488976424f
|
40 | — | — | — |
|
TTATCACGACAATTACACTACGCCCACGCATAATTAGCTC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:c41fb7d8abb0
|
40 | — | — | — |
|
CTAATTAGTTCGAGCCCTTAATTATACACCCACGCAAACC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:52d8df5a2589
|
40 | — | — | — |
|
GGCTAATGACACACTATTAGGGAAACCGCCCACGCACGTC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:54d13f56107b
|
40 | — | — | — |
|
GACATCATTAGTTTCGATCTTACGCCTACGTCCACGCCCA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:0b4abb453855
|
40 | — | — | — |
|
CCCATTACCGTCCGCCCCCGCTAATTACGATCCGATAGCG
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:b75194fd8902
|
40 | — | — | — |
|
GACCATACTCACCCACGTACCGCCCACGCTAATGACACCA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:34fa7bb7b17b
|
40 | — | — | — |
|
GTGAGCTCTAATCCGCCCACGCACTAATTAGCCCACCCAC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:9863c5c76e1b
|
40 | — | — | — |
|
GGAAACGTAATTACGCCCACGCGTTTTACATTTCGACCAC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:a0ce12575f66
|
40 | — | — | — |
|
CTAATTAACCTGTGACCTAACGACCTAACGCCCACGCTCA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:60d434942ae8
|
40 | — | — | — |
|
TAGGGGTGATTAGTATATTACCGCCCACGCATTACCCACC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:7febff8ac0cd
|
40 | — | — | — |
|
CAACACACATTACGCCCCCGCACTTTCGGTAATGAAGCTC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:57bcb09c7b42
|
40 | — | — | — |
|
TACTCTAGTACTAATTACATGCACCCGCCCACGCAACGCT
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:1ea4c301c1e0
|
40 | — | — | — |
|
CACTAATTAGGTTTGTATCCACGCCCACGCAAAAGCCCAA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:7626bff4bc1b
|
40 | — | — | — |
|
ACTGTAACGACACACGCTAATTACTTTTTAATTACCTTGC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:1a897d47d560
|
40 | — | — | — |
|
GATACAACAACTGCCTCATTATCTACGCCCACGCACACCT
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:5b280c2373c8
|
40 | — | — | — |
|
GCCACTTTACCCCTTAATCACCACTCATTATCCGCCCACG
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:41fdbff074e8
|
40 | — | — | — |
|
CTCCAGCAACATTACGCCCACGCAAATACATTAACCAGTA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:1eef36e3789e
|
40 | — | — | — |
|
CGTCCTGTAATTAGTCAACGCCCACGCAAATGTGCAAAGT
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:36f156d7a693
|
40 | — | — | — |
|
GACCCACTACACCCCCCCATCACGCCCACGCTAATTATCA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:ea2f0f6f0185
|
40 | — | — | — |
|
GTTCACACGACATCAATTAAAAAGCAATTAGTGCCGTTCA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:41490d98b38a
|
40 | — | — | — |
|
GACTGATCCGCCCACGCATTTAACGACGCCACGCTAGCCC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:a1a7a38cc7fd
|
40 | — | — | — |
|
GATGCACCGCCCACGCTCTAATTACAACGCCCACTATAAT
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:ac35a0a5e152
|
40 | — | — | — |
|
GTTTTAATGACCTTGCTTAATACGCCCACGCACTTGATCC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:4730ce3551b5
|
40 | — | — | — |
|
GAGACCCTAATTAGCCGTCACCCTAGACGCCCACGCAGTA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:928f57a545de
|
40 | — | — | — |
|
GTGACGCCCACGCATTCTAAGCCCTAATTACTTTTCTCAC
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:eadda81e7e5b
|
40 | — | — | — |
|
TGTTTTCCGCGACCATAATGACGCCCACGCACCATCATTA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:3cdba621216a
|
40 | — | — | — |
|
TAAAGCAGAATACCTCAATTAATGTAGCTACGCCCACGCA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:b370e1d439d8
|
40 | — | — | — |
|
GCGATCCTAATTACCAACGCCCACGCGTCGATCCGCCCTA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:458ec02004bf
|
40 | — | — | — |
|
GACCCGTCTCGACGCCCACGCATTAATTATCCTCTTCATT
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:72d1de0786d7
|
40 | — | — | — |
|
ATTACGCTGCTAATTACTACATAATTACCCTTCTTAATGA
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:115ea8d36492
|
40 | — | — | — |
|
TAGCAATACGCCCACGCCCTGCCACCGCCCCCGCGATCAT
PANAPTA:P18146:EGR1_HOXA2:PRJEB66722:R3:706631ac2c1d
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final