EGR1_RFX3
CAP-SELEX sample EGR1_RFX3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GCGCGCGTCACCATGGCGATCATCTGTTGCCATGGCAACG
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:efd5a164dc97
|
40 | — | — | — |
|
CCGCGCTACCATGACAACCACCCACGCAATGTGCCTCCAT
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:81f11a9c04c9
|
40 | — | — | — |
|
TGCCATGGCAACGCCCTTACGCCCACGCACGATGCGCCCC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:1a431cf22887
|
40 | — | — | — |
|
GCCCAATCTGGCTCCGTTGTCATGACAACGTGCCCTCCGC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:b2f433db9fce
|
40 | — | — | — |
|
GCGTGGGCGTAACGCGCCGTCCGTTGCCATGGAAAGCAAG
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:35f52652a690
|
40 | — | — | — |
|
GCCCATATCAACCGTTGCCATAGTAACGTCGGTATGCCAT
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:d4ce5b700c8f
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCCTCACCATGGTAACCACCGCCCACGCAGCGTCCGT
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:e54611db74c6
|
40 | — | — | — |
|
CCATCCGCCCACACATTGCAGGTAACCATGGTAACTCAGA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:5e3dd31aa4cd
|
40 | — | — | — |
|
AGCCATGGCAACGCCACGCCCAGCTCTTGACGCCCACGCA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:86f5619081b8
|
40 | — | — | — |
|
GTGCCCACACGAAGGCAGGTTGCCATGACAACGCGAACCT
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:572583a745ea
|
40 | — | — | — |
|
CGTTGCCTGGCAACACGGCCACCCACGCCATCACGCCACG
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:2682bb0aad8f
|
40 | — | — | — |
|
ACGCCTACGCTATAAGATGGAAACGTGTTACCATGACAAC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:e30c6fb12f5c
|
40 | — | — | — |
|
CGCCATGGTAACGTCGACAACGCCTACACATTCTGCTCCT
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:b17c35df2b2c
|
40 | — | — | — |
|
ACCATGGCAACGACCTCCCACGCGTTTCGCACCATGCCAG
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:3026b708a7f0
|
40 | — | — | — |
|
CCACACACGTTGTCATGGCAACGCCGGGCGTGCCGTCTCA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:bd88e1dafcb7
|
40 | — | — | — |
|
GCGCAGTGACAGCGCAAACTCCCGTTGCCATGGTAACGGT
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:744014591350
|
40 | — | — | — |
|
CACGCCTATCGCCATTCGTCAACCACCGTTGCCATAGCAA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:93be22cec727
|
40 | — | — | — |
|
CCCGCCGTAACCATGGCAACGGTCATACGCCCACACACCG
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:3cef77fd0281
|
40 | — | — | — |
|
TCCCAATACACGTGCATCAGTTACGCGTTACCATGACAAC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:19ba813333de
|
40 | — | — | — |
|
CGCCCACGCTTAGCAACGCCATAGCAACCTTCTCCCGTGC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:22554e74dd38
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCGTGCCACACGCGTTGTCATGACAACCGCAATCATA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:12a9955e5427
|
40 | — | — | — |
|
CCTGAGCGACCCTCCCTGTCGCCATGACAACGCGCCCACA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:fccd37ba7e1d
|
40 | — | — | — |
|
GCGCCGTTACCATGACGACCCGTTCCACACCCACGCCGAA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:812f83db050f
|
40 | — | — | — |
|
CGCACACAATGCAACACAGTTGCCATGACAACCAGGCACT
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:cacb56b3f6fc
|
40 | — | — | — |
|
AGCATGTAACCATGGCAACGCCTTAATGCTGCACGTTCAG
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:7fc96b062eb2
|
40 | — | — | — |
|
TTCGCGTTGCCATGGCAACCTCCCGGTCACCACGCATGGC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:1c00234d7150
|
40 | — | — | — |
|
GTTGTCATGGCAACACGCCCACTGCTCCAATGATCTACAA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:74399709f68f
|
40 | — | — | — |
|
GTGCTTACACCGTAACCATGGCAACACAGTAGGTTGCCTA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:47439bcac4af
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCCGATGCGTTGCCATGGTAACCGCCCTGCACTACCG
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:cbafd8096037
|
40 | — | — | — |
|
CGGGTCCCCCACGCCCACGCCACGCTGTCGCCATGACAAC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:1ee3cde78ce7
|
40 | — | — | — |
|
TACCCCATCACATAATGCCTAGCAACGGTAACCACGGCAA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:eba18d9c5b35
|
40 | — | — | — |
|
GCACGCCCTCACACCCTCGTTTCCATGGCAACTAGTCCTT
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:903f0efe3942
|
40 | — | — | — |
|
CACCATGACTACCACCACCCACGCAAAACAGCTATTCTTC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:f2c61342069a
|
40 | — | — | — |
|
AACCGTTGCCTGACGATCTGTCACCATGGCAACCCGCCCC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:d2c3335da325
|
40 | — | — | — |
|
GCGAACGTGCTACCATAGCAACATACGCCCCCACACCCTC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:faf7dcc13123
|
40 | — | — | — |
|
CACCAACCAGTTACCATGGCAACGCGCCCGCCACCCGCTC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:a294954e3ace
|
40 | — | — | — |
|
AACAACACGCCTATCATATGCGTTGCCATGGTAACCGTGC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:fd44f49b3f08
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTAACTACTAGCAACGCCGTTACGCCCACGCTCCACA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:85e99c4ec4d0
|
40 | — | — | — |
|
CCCTCGTCGCTAGGAAACCACGCCCACGCACCACGTGCAT
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:8f79315ca3a8
|
40 | — | — | — |
|
TGCCATGGCACCGTTACCATGGCAACACGCCTTCTAGCGA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:178c415d1677
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTTGCCACGGCAACTAGACCTACGCCCCCGCAACCA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:3a7402a689cc
|
40 | — | — | — |
|
ATGCAGCACGTTGCCAAGCAACTGTGCCCACGCACCGCAA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:24e32ffac0e5
|
40 | — | — | — |
|
TCGCGACGTCTTGTTCGTTACCATGGTAACCGTGCTCAGA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:01425f022e7f
|
40 | — | — | — |
|
TCGCCTCCTTACGTTGCCATGGCAGCTACCCACCCACGCT
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:fb68ec2c65a0
|
40 | — | — | — |
|
GCCGAATGCTGTCATAGCAACCGCCCACGCACCTCGTTCC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:839f0a969849
|
40 | — | — | — |
|
CCCACCCACGCCTCGTTACCCAGGCAACCGCGTGTACCAC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:7278f9884150
|
40 | — | — | — |
|
CCCCATGACAACCGAGGGAGAGCCGTGCGACGCCCACGCA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:d160d0587895
|
40 | — | — | — |
|
TCCCCATCATCTCCATGGCTACCACCTACGCATACGCCCA
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:9fc44536baa8
|
40 | — | — | — |
|
GCGTGGGCACCTAGCAACGCCCACGCATCCACACATAGGC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:f918c987126a
|
40 | — | — | — |
|
CGCCGCAGCCATCTGGCGCCGTTACCATGGCAACGATAAC
PANAPTA:P18146:EGR1_RFX3:PRJEB66722:R3:950c394609bf
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final