ELF1_HOXC11
CAP-SELEX sample HOXC11_ELF1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AGTTAAACCCGCTCAATTATACGATTTTTCCGATAATATG
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:e90fcbeeb68c
|
40 | — | — | — |
|
TGCACGTTTGGCATCCGGCATATTGAACACAATTCTTCTC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:19c33aee2dd1
|
40 | — | — | — |
|
TGGAGGCTCTCATTGAAATAGAACCAAATTACCGGGTTGT
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:07e74e3aba37
|
40 | — | — | — |
|
GTGCCGGAAGTACCACTTATCGTTTTTATGTACCTTACCA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:7499181db7f8
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGAACCGTGAAATACACCTTGATTATTTCCGCTTCCC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:1499450b763d
|
40 | — | — | — |
|
GCCTAACCTTACCACAATGTTGCAAGCTCCTCCTCTCGCG
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:92a5353de783
|
40 | — | — | — |
|
CACCCTTATGTCAGTATGCATTTAACGATTATATGCCACA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:0f168ea74b67
|
40 | — | — | — |
|
TCCCACAAATCCCCTTGGCGCTGACTCCGCGTCCCTGCCA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:74c64f79a8fd
|
40 | — | — | — |
|
ACTAATGCTCCACAACACAACTACCCCTGACCTGCCTCGT
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:19ad97287114
|
40 | — | — | — |
|
GCGATGCTGTCACCGGAAGTAATTATAATTGCCATTCCGA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:36d066c4d0d4
|
40 | — | — | — |
|
AGGGCACTGACAGTATTGCCAAACTCCTTGCATATTCCGA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:331f727de8aa
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAAGTATTACCGCACTACGCATACTTAACGATATCCC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:96324c62de89
|
40 | — | — | — |
|
TACTACGCCTCCGCCATTATCGTTTTTTATGATCTACCCA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:94bd0c9ba51e
|
40 | — | — | — |
|
AAGTCTCGTAAATCTGGCGGCCAATTTACGAGCTACATCA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:7f47ebae46dd
|
40 | — | — | — |
|
GTAGTTTAATATCTCCCGATTACTATAAGTGTGCACCGGT
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:ce7cf7473a31
|
40 | — | — | — |
|
CGTAAACCTTGTTCCCCCTGGCTCCAAGACTTATTGACCA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:8ebb3502ea96
|
40 | — | — | — |
|
GCCCTGACACTCTCAACGTTTTCACTTTGGCCCCTGTAGC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:8ceb0e662cf6
|
40 | — | — | — |
|
CACACATCGATTTAACCGTATTTACCACATAACCGTCACG
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:4e8de0d84c81
|
40 | — | — | — |
|
TCGCTCCTTCCGCTTCCGCTTTCGTTTATTACCAACAGCC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:d9f61cdb0a63
|
40 | — | — | — |
|
ACCCGGAAGTCGTAAACAAGGGATGCGCCTTAACGTTTCG
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:ee23ed3892f0
|
40 | — | — | — |
|
GGAAATTAATTTCCGGTCTCATGCAGGGACTATATTGCCC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:cdd299db559b
|
40 | — | — | — |
|
ATACATAATGCCTTACTTCCGCGTGTCATAAATACCGCAC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:746ec2e0d9e0
|
40 | — | — | — |
|
AACATTCCCGTACCCCGCCACCACACTACACGCCTAAAGC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:7c2b63be8760
|
40 | — | — | — |
|
GAGGCTGCACTTTTAATGACTTCCGCAATTATGGCGATTA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:3a1dad6dcaa8
|
40 | — | — | — |
|
CGCACCCTGTGTAATATAACCGTGTAGCATTTAACCCACC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:5c434b5b5d06
|
40 | — | — | — |
|
TTACTGATTCTCCCACTTTACGACCACACGACGCAAGATC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:d0661bef86e7
|
40 | — | — | — |
|
CCACGAAAGTTTACGTACTTCCGGACGTGTTAGTCGCTCA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:9feaa60022f8
|
40 | — | — | — |
|
ATATAATGTTCCGGTTACCTTTGACGCGAAACATTACGTC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:556107e07e20
|
40 | — | — | — |
|
AGCGCCCTCTTCCGTACCCGATCCCCAGTTTACGACATGG
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:f8586cd1d61f
|
40 | — | — | — |
|
TGACTACCGGAAGTATACGCAGTCGTTATCATAAAACGCT
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:3d4f22f5dbe3
|
40 | — | — | — |
|
ACTATCCTTCGTCTATCTACCACGTTCCCCGCCTCACCCC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:e2aa28becec0
|
40 | — | — | — |
|
CTATCAGCAGTCGTAAACTGGTGATTATTGCGGCGTGAGG
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:6bf209f3b841
|
40 | — | — | — |
|
TGACCTACGATAGTACCACATTACTAAGGCTCATTATTGA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:2d1adbbd5c16
|
40 | — | — | — |
|
TTTCCTGGTATGCGTTTTACGACCAAAAACCGTAACAACG
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:5371a88ca6bd
|
40 | — | — | — |
|
AACCTTGCCTCGCGACCACATTAACGACCATGATCCCACC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:fff7b56cb468
|
40 | — | — | — |
|
TACAATGAAATAGCTCATAAAACGTACGGCTTTATGACGC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:63b9d337bec2
|
40 | — | — | — |
|
GTTAACGACCTTATACGCGCGGCAGGTTGTTAACAACTAC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:40e6f7ccb1ef
|
40 | — | — | — |
|
CACTTCCGGGTGCGACGATAAATCGTAAAAGCAGTGTGCT
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:e72465b0d192
|
40 | — | — | — |
|
GGAAGGCGTACCACGCTACAATTTTAATGCCATGTCCGCA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:daf05099fc8f
|
40 | — | — | — |
|
TGGACCCCGGCAGTGTGTATACTTCCGGTGTCGTGGCAGC
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:b3a9ab070d01
|
40 | — | — | — |
|
TAAACACGATCGATCATTACGTCACACACGCTACTCTCTT
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:79204fbec20c
|
40 | — | — | — |
|
TGAGGATTAAGCTGCAAAAGTTAATGACTTCCGCATATGG
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:9dfeafb6f3f3
|
40 | — | — | — |
|
GGTGATGCCATAAAGCCGGAAGTCGTAAACTTACGTAACA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:21fbee50389e
|
40 | — | — | — |
|
ACTACAAACAGGAAGAAGTCCTTTACGACTTCCGGCACTG
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:73d58044655e
|
40 | — | — | — |
|
TGACTTCCGCTTCCGCAAACTCGCGTAATGGCGCACGGAG
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:27cb675f18c7
|
40 | — | — | — |
|
TATTTTACGATGCGCCATGAACACACGACAGCCGACGTAG
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:ee51b28fe08e
|
40 | — | — | — |
|
TCGTAAATATCCTATTACTTCCGCCAACTTCCGGTAGCCA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:4bd183930a60
|
40 | — | — | — |
|
CCGAACAACACGTTTACGACTCTTGCTTCACTTCCTTACA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:883d3c09b5ec
|
40 | — | — | — |
|
TCCTGGAGCCAGGCAGGAAGAATTACGCGGAAACAATAAA
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:eabc4d056186
|
40 | — | — | — |
|
CTCAACCTGTACGAAAGTTGTTTTTATTACTTCCGGAAGT
PANAPTA:P32519:ELF1_HOXC11:PRJEB66722:R3:868806d53998
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final