ELF1_OTX1
CAP-SELEX sample OTX1_ELF1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TACCTGAAATTTATTTGTAAATGACTCCGATTTTTAGAAA
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:349a1c990974
|
40 | — | — | — |
|
ACCTGAAGCCAAATGTTGGAACACGCACCCGCACGACATA
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:796845b0ea22
|
40 | — | — | — |
|
AACTGACAGGGCCTTGTACCATGCTCTTAGGCATATGCAT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:bc593b2cc4ff
|
40 | — | — | — |
|
ACGGTCTCCTTTGCGGCCTCTAATATAATATACTTCCACT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:846df4c70204
|
40 | — | — | — |
|
CCCTTCCCGGAAGTCGTGGCCCCTCAACTTCCGCTAATCC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:e42117bc9bb6
|
40 | — | — | — |
|
CATGCTACTAATCTCGGTGACGAAATTAGCGTTTGTTCAG
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:a3b1ac55725e
|
40 | — | — | — |
|
CTGGTTGTACCGAAATAATTGCAATTACGCGAATTGCTTG
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:864d7985871d
|
40 | — | — | — |
|
GCACAACATGCCTTTTCGACCTCAACCCCTTCTCCACAAC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:286d9e7d71c5
|
40 | — | — | — |
|
CCTTTCTTTTCCGGCACATCCTGTAAATTCGTCACGCTAC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:d8742bc88a64
|
40 | — | — | — |
|
TGAACTCGTTCCGTGCCATACCCTCCACTTAATCAACCCC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:bf3596129843
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGTCACCCCGCGCCAACCTTACCCTGCGGCCCATCCT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:8da8b5af1663
|
40 | — | — | — |
|
CCCACCTCCCCGACATGCATAAATACTGACCCTACACTAT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:454a65e3769c
|
40 | — | — | — |
|
CGCAGCCTTAGGCCGGATTACTGCCTGACCAGTAATCCAT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:2a9f63f73979
|
40 | — | — | — |
|
TCCCCCACTGTATCGTTAATCCGACGCTCGGATTAACTTA
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:d64bdaf8e316
|
40 | — | — | — |
|
CACCCAGACACTCCAACGTCCTCCCATCCTCTAATTTCCC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:ed2d6fbe63c8
|
40 | — | — | — |
|
ACATGCTATCGTCCCGGCTACGCTCATCGCCACCCCGTAC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:efec9abc4e6b
|
40 | — | — | — |
|
ACCCGATAATTCATAGGGATTATCGTTAGTTCGAATTACT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:46838bd97733
|
40 | — | — | — |
|
GTGCGAATTAACTAAGTTAATCCACGATACGGAATTACAT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:06ac9b7437ac
|
40 | — | — | — |
|
CTAGCCGCACCTTCCCTATTGCTGTCCCTATCCCATGCTC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:7d1b84596982
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGTCCCTTGCATAGCTAGGACCGGAAGTAGGAACCAC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:81e845d98cf4
|
40 | — | — | — |
|
AAATTGCTTGGGCTTTCTCTATAGTTAATAATATGTCTTA
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:270c7967fc4b
|
40 | — | — | — |
|
CTGGTTTTGCGTCAGATTAATTGCTTTAATCCGCCATTGC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:710f70afc25a
|
40 | — | — | — |
|
ATCCTTTGCGTTACTTCCGCATTTTGATCCCTAGCTCAAA
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:8684e246f380
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAAGTTGACATACCACTAAAGTGCTTCCGGGTTCAAT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:b2b873ec2656
|
40 | — | — | — |
|
GCGATTTCATTATGGTGATCCTCCTGTCAAGCGCCAAGTT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:588f639b2012
|
40 | — | — | — |
|
GGAACGGTGCCGAATTAAACGTACTTTTTATAATCCGGTT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:c9ddc587d5ef
|
40 | — | — | — |
|
CGTCACTTCCGCATTATTAAAATACTCACTAATCCGTTGT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:cf8bd2d3f2e2
|
40 | — | — | — |
|
ACACCGGAAGTTGCCTAAACTTCCGGCGTCAATAAAGCAG
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:418c0e7c56e6
|
40 | — | — | — |
|
ACACACACACTCTACCCGACCATTCCGCCTATCATACCAC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:0e40eb1f2580
|
40 | — | — | — |
|
GGAAACGACCGATACGATACTTCCGGGTAGATTATGCTCA
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:0478d05f897b
|
40 | — | — | — |
|
ATCCTCAATTCATGATTACCTACCCTCTCACCTTAACGCC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:d2a576ab6f51
|
40 | — | — | — |
|
CAACAGGCGATTTCCGCGTCAGAGGGGATTAACCATATTA
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:1ea751132509
|
40 | — | — | — |
|
CCCATCTTATATACCGGAAGCTACCGCAACTTCCGTGTTA
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:c335d776ab5d
|
40 | — | — | — |
|
AATGTCACGATATTAGCACGCCTGACCTCACCGTACTTCC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:b3a83183aa5b
|
40 | — | — | — |
|
ATCTGCAAAATGGTGCTAATGAAGCAGCCCCGATGCTGCT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:c3529e359e1f
|
40 | — | — | — |
|
TCCGCTAATACCTTAGGCTTATCCTATAATCCCCACGTGC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:2f04c5a13bb1
|
40 | — | — | — |
|
AGTCTCGATAATGCGTGAGAAGTAATCCATTATACGTATT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:5923c231a219
|
40 | — | — | — |
|
CAGAATAGCCTTCGTTGAAGGCGGAAGTTATCGTACTTCC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:094193a2f444
|
40 | — | — | — |
|
AACACGGAAGACACCCTTAATCCCTTCCTAATCCGTTAAT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:629d9cca00ae
|
40 | — | — | — |
|
CAGGCGCGGTTGAATTAGCAGGGCTACTGCTAATCCCCTA
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:dd18b2d85259
|
40 | — | — | — |
|
TCCGCCAATATAATTCCTACTTTTCGTTCCGACAAAGTAA
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:8dd5e4c5543c
|
40 | — | — | — |
|
TCGGCATCCGTGTCGTGCGTTGCACTCAGCGATCTCGGCG
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:3c356fc2586f
|
40 | — | — | — |
|
CCGTATACGCAAAATCCGATTAATTCGTTGGCCACTGACT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:0fa3e0e00c4b
|
40 | — | — | — |
|
TTGATTGTCTTTCGAATGATGCGTTTATCATCCGCGCAAT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:1a1ce54a4ddb
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGATATGAGCAGGATAACGCTACTCCTTCCGCTCAAA
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:61273cbb0a9d
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGCTTTCAATTAAAGCTCTTTCCCCTAAGCTTCTGCG
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:dcd9e14f0601
|
40 | — | — | — |
|
CGATCCCCACCGAATTAACGCAGAGAGCGATTAATCCGCC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:07b9b270e7f4
|
40 | — | — | — |
|
TAATGTCCATTTACGTAATCCGCTTAAAGCAAATTACGAA
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:2f98ee749682
|
40 | — | — | — |
|
AGTGCACCTTATCCATTCACGCCTTCGTTCCTAACGGACT
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:ca337c818ea6
|
40 | — | — | — |
|
CGCGTACGTCACGCGTAATTACCAATAATCCGATATGCAC
PANAPTA:P32519:ELF1_OTX1:PRJEB66722:R3:c3287253a505
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final