ELF1_SHOX
CAP-SELEX sample SHOX_ELF1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CATCTTCATAGCACAATAATGAAACAGTATAATTATATGT
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:ca7402a3eff6
|
40 | — | — | — |
|
ATGAATGCGGATGGAAGAGTACAGTCGAAAGCAATCTACG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:febea1ecb787
|
40 | — | — | — |
|
CTCACTGCTCACCATCTGTTTAAGGTAGCAGATCCACCAC
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:eb57544924bf
|
40 | — | — | — |
|
CCTCACGTGGCCTTTGCCCCTCACCGATCTCCGCTTCCCA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:37aec4f53d3f
|
40 | — | — | — |
|
CCTGCACCCCCCTACGAATACCCGTAACGCACATTAGAGT
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:c928518e3751
|
40 | — | — | — |
|
GCGAGGGAGCGTATGATCGGCTACCAAAAGCTCTTTATAA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:f25087c45775
|
40 | — | — | — |
|
CGAGTTGTTACTGATCTAGTACAGTCCAGTGGAACGTTTG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:3078362b0790
|
40 | — | — | — |
|
GCTTAACAGCATGCTACCCTCCACGTCGGCCTAACTCTCT
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:a98228184147
|
40 | — | — | — |
|
TATTGCGCCAACACGCAGACATTCTCCCTAGAAATATCCT
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:44d2461eac90
|
40 | — | — | — |
|
ATTGGGCGCCCTCCGCCACCGCCCTGCCACCCGCCCGCGG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:bcb66ab193de
|
40 | — | — | — |
|
TGCCACCCTGCCGCCCCCACCTCCCGCCCACTGTCCAGGC
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:e5e1b6b188d8
|
40 | — | — | — |
|
GTAGAGTCGGTATGATAGCCTGATGTATGATCAACCTGCG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:a4512a75b439
|
40 | — | — | — |
|
CTAATTACATTAATGCTAATACAACCGGAAGCAGCACACG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:4678bfbfa26f
|
40 | — | — | — |
|
CGGAAGAAGTGACGTCACTAATTTAATTACCCAGGAAACA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:f06dc22801f9
|
40 | — | — | — |
|
ACAGTCTCGCACCCCAAGCTCACCCACGCGTCCTAGGCCA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:c90ddcf56e03
|
40 | — | — | — |
|
TTATGCTATTGGTGTGGATAATTACCTATAATGACGTTAA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:c68c39b16b09
|
40 | — | — | — |
|
TACGGAAGTAGGGTAATGAAATTAACCAACATTAGGCGTG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:6f416173a77a
|
40 | — | — | — |
|
CATCTCCCTGATTCCCACACCCCGCACTTGCCCCATCCCG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:1c4a6870b6b6
|
40 | — | — | — |
|
GTAAGTAAAAACCGTGCCTTGGGGCTATACAATCTTTCTT
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:63cb2035c999
|
40 | — | — | — |
|
CACGTGGCAGAATAGGCGGTAATGATCGTGGCGGCACCGG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:c5237b948394
|
40 | — | — | — |
|
CCTCACCGCCCTCTACCTATTGCACCACCCCACTGACGTA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:32549af4e64f
|
40 | — | — | — |
|
CACACCCCACCCACACGTCCCCCTCCATCCACCCACCCGT
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:bb43f577eea7
|
40 | — | — | — |
|
ATTAAGCTAAGTTATTGCGCTTAATTGCCATTTCCTGGTA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:daac7154e32d
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGCCGACCGCGCCACCATTCCTTACTCGATACCCCAA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:6b3be320e166
|
40 | — | — | — |
|
TCCGCCGCCGCCGCCCCACACCCGTCCCTCCCTTTCAACG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:97d6b6dff70a
|
40 | — | — | — |
|
CAATAATTTCCGCAATTCAATTAGACCCATTACTGCAGTA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:863d6774b2aa
|
40 | — | — | — |
|
AGCTAATCTAATTATGATGCGGAAACGTTGAACAGGAGCA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:f00c891e9a66
|
40 | — | — | — |
|
ATAAGGCATTGACGGAAGTGGCGTCTTCCGCAACAGACCC
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:f601b61db9ab
|
40 | — | — | — |
|
TTAGTCGTTCCGGCAGTACATGTAGAATACGGAGGATGCG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:e22bb52ccb3c
|
40 | — | — | — |
|
TCACGAATAAATTAGCGAATTACGCCATCCAGGAAGTGAC
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:8264a45a001a
|
40 | — | — | — |
|
TCATACAGCCACCCCTGCCACCACTACCGCCTTTTCCCCG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:49f01192b099
|
40 | — | — | — |
|
ATTTCCGCCAATTACGTAATTACACGTTATTAAGAAAGTG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:4e348e9796e8
|
40 | — | — | — |
|
TAACCCGGAAGCAGCCCAAACAAGGTATCGCTTCCGGTTG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:1922c3a1dc1b
|
40 | — | — | — |
|
CTGTCCCCCGCCCTCCCGTGTCCCCCATCCGCTATCCATC
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:ab171cecab6f
|
40 | — | — | — |
|
ACGATGCTACGTCTAATTAGATTAGCACACTTCCGCATAA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:a707debd2489
|
40 | — | — | — |
|
ACTCTGCCGTTCCCCTGTGACCCTCGCACCACACCTGCGA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:bbc1d3945bda
|
40 | — | — | — |
|
CGCGGCTTAGCCCCCCACACCCACCACCTTCTGGCCGCAC
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:3b2b5e408a83
|
40 | — | — | — |
|
CAATTCCCAAGCCCCATGCCGCCTTCCCGTCCCTACCCAT
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:b17568f6671c
|
40 | — | — | — |
|
AAGGGTAGAATACAAGGGTAACGGAATGATACGTTAGTGG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:f1f3aede9342
|
40 | — | — | — |
|
TTCATTAGCGTATAACGAGATAATTGGCATTGGTGTTTCA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:8d3707278681
|
40 | — | — | — |
|
ATAATGTACCCTCCTCCTCCCCCACCTCCACCTCACCCGC
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:205a6f883fd5
|
40 | — | — | — |
|
CTACCGGAAGTGTAAAGCACTTACCGTTCCTATACCGGTC
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:a36a6a4308c3
|
40 | — | — | — |
|
AATACCTGCTGCTACCTCCAACTACCCCTCATGACACCTG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:2f99c79c44b0
|
40 | — | — | — |
|
TAATTAATTGAGATCATGACGAACCGGAAGTATCGACAAG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:137702f43767
|
40 | — | — | — |
|
CTGACGACCTATCGGCATCAATTAAGTACTTGATTGAGGG
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:69efaa791c72
|
40 | — | — | — |
|
ACAATAACAATTGTATTAATTACGACTTCCGCTTACAAGT
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:910fff4107c0
|
40 | — | — | — |
|
TGACAACGCTCGTCCTAGCTTCCGTTCGCGCACATTCCGA
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:22683b3e0e04
|
40 | — | — | — |
|
CCAATTCGCGTTACCCTCTCACACTCCCAACGTCATTCCC
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:a349dfc5c894
|
40 | — | — | — |
|
ATCACACCCCCAACCTACTCTAATATACATCCGTCTACCC
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:7d29ca515cf2
|
40 | — | — | — |
|
ATACGGAAGTTCAAGCCGTGTCTTCCCGTACCTAAGCCAC
PANAPTA:P32519:ELF1_SHOX:PRJEB66722:R3:5d50316a8fe4
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final