ELF4_HOXD8
CAP-SELEX sample ELF4_HOXD8 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TAAACGAGGTAGTAGTACTGAGGCCACGTTATCCATGCCG
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:4a2cf5d24661
|
40 | — | — | — |
|
CAGTCCGCCCCCACTTTTTAGGTCTCGCGCTACGGCTGGC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:a8d6c6177f9b
|
40 | — | — | — |
|
CCATAATTACCAACAATCTTGCTCCTACGTAATTATGGTG
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:b06290934f8e
|
40 | — | — | — |
|
ACGAGTACCGGAAGTCGTTAAAGTACCACTTCCGGTACAA
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:e85c203d26a2
|
40 | — | — | — |
|
CTCCTGTCCAATATGAACAGCGATTCTCCACTACTACCCC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:169a81f90d8d
|
40 | — | — | — |
|
ACCCGCTACCTCCTGTTTTCCAGGTATTCAAACACGAACC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:f152ad449d9e
|
40 | — | — | — |
|
ATCTAAAATAATAGGCACAGCGTTATTATCCTACGATCCA
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:a4ac36a458dc
|
40 | — | — | — |
|
CAGCAACACCGCGTATTACACCTCCCTACACCCCCATAAT
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:fdfb7696307c
|
40 | — | — | — |
|
CGCCTTTACCACACCGCCCCCTTAACCTCACGAGCAATCA
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:e83bcce09c80
|
40 | — | — | — |
|
TAAACTAGCCCCGTGACCGTTAAGCCAAGTTTAGTGATCA
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:56c51cf5bfde
|
40 | — | — | — |
|
AACAATGCGGAAGTACATGCCTACTTCCGCATTTCTCCCT
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:f0b7455cc216
|
40 | — | — | — |
|
GCACCACCGGAAGTCCCGGAGGCACTTCCGCCCATACCCT
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:5f9d9001c013
|
40 | — | — | — |
|
TACCCTTGTTTGTTGGCGCGATAATTGAGGCGTTGAGAAC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:3463368cd28f
|
40 | — | — | — |
|
GCCTAGGACCCATCCGAGCCCCTAAACCCCAACACCGGCG
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:7ba8fa6f8f1f
|
40 | — | — | — |
|
CCATCTACCCACTGAGCTCTCTATCAATCCCTGTCCCTTT
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:80c42c360263
|
40 | — | — | — |
|
ATAGTGACATCGCTAACTTCCGTACAGCACCGACAGTTGC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:63914fcfe08b
|
40 | — | — | — |
|
GTGACTTCCTTGTTTCAATAGGGGTACACGTTATTGAATT
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:7c53150c8ca7
|
40 | — | — | — |
|
CGGAAGTGAGCCTCACTTCCGCATGCGACCCACCTGCCCA
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:6b1a5d94ebb3
|
40 | — | — | — |
|
CGTAACCTAATATCTTAGAAAATCATAGACAGTTATTAGC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:2700056eaf16
|
40 | — | — | — |
|
GCAATTAATCAGCCCGCTCTCGCTGTAACCTAATTAAACC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:5723cc3c1a4f
|
40 | — | — | — |
|
TCTCCCATGGCTTCACTCACGGATCCGCTACTCCACGCCA
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:126b8a5d26f7
|
40 | — | — | — |
|
CGTAATTACGGCTTAACGATACTAGTTACGGTAATTACCA
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:b4a0eef96c8f
|
40 | — | — | — |
|
TGCACACGGGGGCGGAAATTGCCATTTCCGGTGAGCGCAC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:fca86d55d298
|
40 | — | — | — |
|
CATCAAGCTTAACCCTCTCCCCTCGCATCCCTGCGCCGGC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:95bdf8316dce
|
40 | — | — | — |
|
CGCAAACCACCCCCGTACCCCCCGTCCTATCCCTCCTCTA
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:8e59413e42b3
|
40 | — | — | — |
|
TTTAACGAGAATTTAATGTACCAGCGTTAAAATTAAGCTA
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:e1c38a4391d8
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCTTTCCATTAATGTTTGATTGGAGCTTCATTAATGC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:d8bd9a794475
|
40 | — | — | — |
|
CGTGTCCCCCCAGCACACAAAACGCCCCACCCGCGCACGG
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:337f0832922c
|
40 | — | — | — |
|
CCTGCCTCCCCACCCTCGTACCCGGCCGCCTCACCGGAAC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:19ebe34fa324
|
40 | — | — | — |
|
AGCAATAGGCTACTCTGCTAAAGAGAGCGCGTTATAGCTC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:b1fd1e0bd70b
|
40 | — | — | — |
|
ACAGAGCATTAAGTTCACAATTAAGTTCACACTTAATGCG
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:12c6408b6550
|
40 | — | — | — |
|
CGCAGACCGGAAGTTGTCTTCCGCGTTGCGATCATAAATG
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:3f77ea090d6f
|
40 | — | — | — |
|
ACTTCCGGGTAATTTTCCGCATTCCGCGGCCGCAATTACC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:0c4ac63f2a2b
|
40 | — | — | — |
|
TACTTCCCATATTCCCCCACATTAAAACGGTCACGCCGGC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:159c8c025d18
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCTATCCATACTTCTTGCATCCTTACCTCATGTCCCC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:611aadc7e814
|
40 | — | — | — |
|
GCCACATGCATTCCATGGTCTATCTTGAACGCTGCGGAAG
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:74dc125633c5
|
40 | — | — | — |
|
ACCCCCGGCGATACCTCCTTACTCCCCCCCATTCGCACCG
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:59e9901ee653
|
40 | — | — | — |
|
CAAGCCCGAACACGCCCCCGACACCACACAACGTCTGAAC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:4629190c08ab
|
40 | — | — | — |
|
CACGGAGATCAGGACCAACCCTACGCTCCGCCGCGTTAAC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:fa310bf387ea
|
40 | — | — | — |
|
TACCGTCGCAGATCGCCACCCCGGATAGTATACCCACCGT
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:4dc0939013a6
|
40 | — | — | — |
|
ACGATAATTGCAACTGCAGCAGTTAGCGGGCAATTACGGC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:4d893d2a5115
|
40 | — | — | — |
|
ATTCTTTCCCCCTTCCACGAATAGGCGTACGATGCCTCCT
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:f88fc0a323bd
|
40 | — | — | — |
|
CCTGCTTATACATCCCATAACTATCGCACGTAATGCCGGA
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:b8ea21342284
|
40 | — | — | — |
|
TATGCATTCCTACAGGGTGTACTCGGCTCCGCACACAGTT
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:69c5fa8fcf7d
|
40 | — | — | — |
|
TACCGCCTCTTAATATGCAGTTGTACTCATGCAATTAAGC
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:1e9f1afc340b
|
40 | — | — | — |
|
ATAGATTCACTTCCGCATATCAGTGCTATTAGCGAAAGTA
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:1b22843e9e02
|
40 | — | — | — |
|
CTTATTCGATAAACCATAGGCTCCTACGCGTTATGGTCTT
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:cf2d0a188925
|
40 | — | — | — |
|
ACCACACCGGCCGAGACAATCCCTGTGCGCGCACCTATAG
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:88c9b93dbb3f
|
40 | — | — | — |
|
TCACGTAGCAAAAAGGTACTCTCATCATCTTCTGACTTAA
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:5ef78a9b0264
|
40 | — | — | — |
|
CCCGGAAGTGCACTTCCGGTACCTCATGCTCAGTCGCCCG
PANAPTA:Q99607:ELF4_HOXD8:PRJEB66722:R3:89812bbc74c5
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final