ELK1_FOXD2
CAP-SELEX sample ELK1_FOXD2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CCCTCCACTTCCGGTAAGCCGTCTGATCTAAGCTTTCTCC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:6e18c3e35f01
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGTTCCGTTAACTCCACCTTAATGCAGCCTGCCCTTG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:d15b190d6634
|
40 | — | — | — |
|
GACGCGTTAGTACACGCAACCGGAAGTGAGCTAGGCACCA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:ebd505db455c
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGAACCCCTTCCGAAGCTGCACCCCTCATTACCTTCT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:d35c8dad2551
|
40 | — | — | — |
|
GTGATGATTAAGCAAATATTATTGTAACACACTCTACGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:f4aae564aade
|
40 | — | — | — |
|
GACTCACATTGTTTTCGTTTCCTTAAACAAACATTATCAT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:d83d1dc8b403
|
40 | — | — | — |
|
GAAACTCGATCGCTAAGCAAATATTATTTTAGCCTACGTC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:76a9a69cce85
|
40 | — | — | — |
|
GAGCATACTCACTAAACAAACAACGACACGGCGTTAAGTA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:dff442933926
|
40 | — | — | — |
|
CCTTATGTAAACACTTACCCTACGTAAACAGTGCTGAGTA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:368d5c04266f
|
40 | — | — | — |
|
CCACGTTTACCGGAAGTACACGCCCCCTTAAACAAACATC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:dc6d2c0ac2d3
|
40 | — | — | — |
|
ACTGACCTCCACCGTAACCTCTTCGGCTCCGGTATTAGTC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:1754ad0d441a
|
40 | — | — | — |
|
ACGTCGCACAGCAAAGATAATATTTGTTTAGGCGAGTCAT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:183008bbbe98
|
40 | — | — | — |
|
GCACCCCTTTGACCGTGTTTACACAACGTTACGTTAAATA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:8a893d504565
|
40 | — | — | — |
|
ATGCTGCCGGACATAAGCACAAACACACAGTATCAGTGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:b13482238432
|
40 | — | — | — |
|
CCTCGCCCAACACTTACACTAACATTTATTTAACCGAACC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:137ce5a53f25
|
40 | — | — | — |
|
AATCATAATGTTAGCTTAAGGTATCGCCTATGCTTACCTA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:71c6295a3064
|
40 | — | — | — |
|
GCGCCTTATCATAACATTTACTTATGCCGTATCGCCCCGT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:b203de3f1628
|
40 | — | — | — |
|
AACCCGCTAAACTAACATTATTACAACGCAACATGGCTAC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:d24d9578b869
|
40 | — | — | — |
|
TCCAACAGAAACTAAACAAACAATCGAACGTACTTACGTA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:a9e28ce4ff66
|
40 | — | — | — |
|
ACTCATTAGCTCGGCCCACACGTGTTTACTTAACTAAACA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:73bc9bc5ed48
|
40 | — | — | — |
|
CCGTAACAATAACATTTACACAGTGCATCGAAACAAAAAT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:f4d7e1562e29
|
40 | — | — | — |
|
TAAACTAATGTTAGTGTAACAGTCGACTGATTCACGTGAC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:13e59f4aca7d
|
40 | — | — | — |
|
GTGACCATGATGCTATGTCAATATTTACGTAAGCATAACA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:f76dbc403951
|
40 | — | — | — |
|
CACATCTTGTTTACGTAAACTACGGTGTTTACATAAGCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:2ff9b5e6674b
|
40 | — | — | — |
|
AACAATGTTATTACAACACTATGTAAACAGTAATTGTCAA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:b123a3bea449
|
40 | — | — | — |
|
TCTCGACACAATGCTACACAAACAAACCAATTGTTACAAT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:7753e3941afc
|
40 | — | — | — |
|
CACGCCATTCCACTGAACAAATATTATCTTAACACCTTGC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:9c6cdf0c5a77
|
40 | — | — | — |
|
GGCGCTGATTTAACGCTAAACAAACATTATTGCAACGACC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:5e610097bf9e
|
40 | — | — | — |
|
CCTATTCTCCACGCCTAAACAAACACGAGCACGCTAAACA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:0cc25541fc76
|
40 | — | — | — |
|
CTTCCTACGTACCCTCCTGTTTATTTAACGCTAAACAAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:d611ca1df794
|
40 | — | — | — |
|
TACTCGATATGCATTGCCTTTACGTAAATATTAGTTTAGC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:6ff5f927cef9
|
40 | — | — | — |
|
GCGTTAAGTAAACAATGACGTAGGATGCTTAGCTTAAAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:00b92bb0e4da
|
40 | — | — | — |
|
ACCCGTTAAGTAAACAACCATTTCCGGTGCGCCCGCGCCC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:e39d0fd8e782
|
40 | — | — | — |
|
TCAGCTGCTAAACAAATATTATTCCAAGCCGTATAGCAGT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:b7cc17f67db7
|
40 | — | — | — |
|
GCCCGGAAATGCTAAAACAACATCCGACGCACCGTATGCC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:5e220ba9f85c
|
40 | — | — | — |
|
AGTCCGCGCTATGTCAATATTATTCTTAGGATCCTGTGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:c921f30db587
|
40 | — | — | — |
|
TGTGTAAATATTATTGCAGCGTCCTGACGCACGTTAACAA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:626858b00eee
|
40 | — | — | — |
|
TCCTATGGATCATTACAATAATGTTATTGTAGCCATCAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:0d449055bf41
|
40 | — | — | — |
|
ATCTATGCTTAAGTAAATGTTTACATAGCCTGCATGTGGA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:827b6fba06fe
|
40 | — | — | — |
|
TAAACAAATGTTATGACAACGCGCGTCGTTGGCCTCCCCA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:12b9ddc106f9
|
40 | — | — | — |
|
CGACTTACGTAAATATTATTGTTTAGGCTATCGTAGCTTG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:aba1f7b2d969
|
40 | — | — | — |
|
CGCCACCGCTTACAATAACATTTATACAAGTTCGTACAAT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:376fed3b7024
|
40 | — | — | — |
|
ACGACCTTAAATAAACATTGCATCTATCTTCCGGCGGAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:2217419e219e
|
40 | — | — | — |
|
CATACTGAAACAATAACAATGGCTCCTCTAACAATAACAC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:700a6dc59b77
|
40 | — | — | — |
|
AGAACCACCGTTAAGCTAATGTTATTCTTACCACTAAACT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:530f21269062
|
40 | — | — | — |
|
TCCACGCGTAAACCGGAAGCGCTATATCGTACCTTAAGTA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:33229f093aa4
|
40 | — | — | — |
|
GACCTCACACTCGTGATTGCAATAATATTAGTTCAAGCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:c49d23a3c551
|
40 | — | — | — |
|
GCCTCCATCCACTGCCTCCTGACTACGATAATATTTGCTT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:3f464d07eefa
|
40 | — | — | — |
|
CCCTATTAGCCACGATTGCAATGTTATTGTTTGCTAAAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:29700c25eefe
|
40 | — | — | — |
|
AATGCGTGGATCCGTAAGTTTACTTTAGACTTCCGGCGAG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXD2:PRJEB66722:R3:06423640837b
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final